Биологический образец - Biological specimen
А биологические образцы (также называемый biospecimen ) представляют собой биологические лабораторные образцы , проведенных в biorepository для исследования. Такой образец должен быть взят путем отбора проб, чтобы он был репрезентативным для любого другого образца, взятого из источника образца. Когда биологические образцы хранятся, в идеале они остаются эквивалентными недавно собранным образцам для целей исследования.
Биологические образцы человека хранятся в биохранилище, называемом биобанком , и наука о сохранении биологических образцов наиболее активна в области создания биобанков.
Контроль качества
Изначально установление широких стандартов качества биологических образцов было недостаточно развитым аспектом роста биобанков. В настоящее время обсуждается, какие стандарты должны быть в наличии и кто должен управлять этими стандартами. Поскольку многие организации устанавливают свои собственные стандарты и поскольку биобанки обязательно используются несколькими организациями и обычно стремятся к расширению, гармонизация стандартных операционных процедур для лабораторных практик является приоритетной задачей. Процедуры должны быть основаны на фактических данных и будут меняться со временем по мере появления новых исследований и технологий.
Политики
Некоторый прогресс в создании политических организаций включает создание Национальным институтом рака в 2005 году Управления биобанков и исследований биологических образцов (OBBR) и проведение ежегодных сетевых симпозиумов по исследованию биологических образцов. Международное общество по биологическим и экологическим Хранилища , Международное агентство по изучению рака, Организация экономического сотрудничества и развития , а также Australasian Biospecimen сети также предложили политику и стандарты. В 2008 году французская организация по стандартизации AFNOR опубликовала первый стандарт качества для биобанков. Аспекты ISO 9000 были применены к биобанкам.
Цели качества
Критерии качества образцов зависят от рассматриваемого исследования, и универсального стандартного типа образца не существует. Целостность ДНК - важный фактор для исследований, включающих амплификацию всего генома. Целостность РНК имеет решающее значение для некоторых исследований и может быть оценена с помощью гель-электрофореза . Кроме того, биобанки, в которых хранятся образцы, не могут нести полную ответственность за целостность образцов, потому что до того, как они примут образцы на хранение, кто-то должен их собрать и обработать, а такие эффекты, как деградация РНК, с большей вероятностью возникнут из-за отсроченной обработки образцов, чем из-за ненадлежащего хранения.
Образцы хранятся
В биохранилищах хранятся разные образцы. Разные экземпляры пригодятся для разных целей.
Образцы биобанка | ||||
---|---|---|---|---|
образец | использует | техника извлечения | место хранения | характеристики |
ткань щеки | ДНК-профилирование | щечный мазок | участники могут собраться сами; можно забрать по почте; настолько легко собрать, что информированное согласие может быть недостаточно рассмотрено | |
цельная кровь | венепункция | требуется флеботомист для сбора | ||
Засохшее пятно крови | дает высококачественную ДНК и РНК | Палец | легко хранится годами при комнатной температуре | |
ткань органа | дает высококачественную ДНК , РНК , митохондриальную ДНК и источник заболевания | Биопсия | много общего с кровью; также подходит для протеомного анализа; может быть трудно получить | |
Плазма | ограниченное содержание ДНК и РНК | Фракционирование плазмы крови | требуется флеботомист для сбора | |
Моча | маркер для некоторых диагностических тестов | Мочеиспускание | неинвазивный | |
Кал | маркер для некоторых диагностических тестов | Образец стула | неинвазивный | |
Кожа | В основном используется судебно-медицинскими группами, расследующими уголовные дела. | по уголовным делам, собранным без согласия дарителя | ||
Волосы | В основном используется судебно-медицинскими группами, расследующими уголовные дела. | Анализ волос | по уголовным делам, собранным без согласия дарителя |
Методы хранения
Многие образцы в биобанках криоконсервированы . Остальные экземпляры хранят другими способами.
Техники, связанные с биобанками
Некоторые из лабораторных методов, связанных с хранением биологических образцов, включают экстракцию фенол-хлороформ , ПЦР и ПДРФ .
использованная литература
внешние ссылки
- База данных исследований биопрепаратов, тщательно подобранный сборник статей о биопрепаратах.
- Управление биорепозиториев и исследований биопрепаратов
- Список центральных биорепозиториев образцов , всемирный список активных биобанков и биорепозиториев
- Симпозиумы сети исследования биологических образцов , конференция по образцам биобанков
- Клиника Мэйо по биобанкингу
- Короткий выпуск Общественного телевидения о музейных коллекциях