EMBnet - EMBnet

Биологии Европейской сети Molecular ( EMBnet ) является международной научной сети и группы интересов , что цели повышения биоинформатики услуг путем объединения биоинформатики экспертиз и возможностей. На 2011 год у EMBnet 37 узлов в 32 странах. Узлы включают кафедры университетов, связанные с биоинформатикой , исследовательские институты и национальные поставщики услуг.

Операции

Основная задача большинства узлов EMBnet - предоставить национальному научному сообществу доступ к банкам данных биоинформатики , специализированному программному обеспечению и достаточным вычислительным ресурсам и знаниям. EMBnet также работает в области обучения биоинформатике и разработке программного обеспечения . Примеры программного обеспечения, созданного членами EMBnet: EMBOSS , wEMBOSS, UTOPIA .

EMBnet представляет широкую группу пользователей и тесно сотрудничает с производителями баз данных, такими как Европейский институт биоинформатики (EBI) EMBL , Швейцарский институт биоинформатики ( Swiss-Prot ), Мюнхенский информационный центр белковых последовательностей (MIPS), чтобы обеспечить единый охват услуг по всей Европе . EMBnet зарегистрирован в Нидерландах как общественный фонд ( Stichting ).

С момента своего создания в 1988 году EMBnet превратилась из неформальной сети лиц, отвечающих за ведение биологических баз данных, в единственную всемирную организацию, объединяющую профессионалов в области биоинформатики для совместной работы в расширяющихся областях генетики и молекулярной биологии . Хотя EMBnet состоит преимущественно из академических узлов, она получает важное дополнительное измерение от своих промышленных участников. Успех EMBnet привлекает к участию все большее число организаций за пределами Европы .

EMBnet имеет проверенную инфраструктуру для организации учебных курсов, оказания технической помощи и помощи своим членам эффективно взаимодействовать и реагировать на быстро меняющиеся потребности биологических исследований так, как не может сделать ни один институт.

В 2005 году организация создала дополнительные типы узлов, позволяющие использовать более одного члена от страны. Новое название категории - «связанный узел».

Координация и организация

EMBnet управляется Ежегодными Общими собраниями (AGM) и координируется исполнительным советом (EB), который наблюдает за деятельностью трех проектных комитетов:

  • Комитет по образованию и обучению (E&T). Образовательная поддержка включает серию курсов, организованных в странах-членах и на разных языках, комитет также работает над постоянной разработкой доступных в Интернете учебных материалов.
  • Комитет по рекламе и связям с общественностью (P&PR). Этот комитет отвечает за продвижение любого типа деятельности EMBnet, за рекламу продуктов и услуг, предоставляемых сообществом EMBnet, а также за предложение и разработку новых стратегий, направленных на повышение видимости EMBnet, и заботу о публичных отношениях с сообществами EMBnet. и связанные сети / общества.
  • Комитет технических менеджеров (TM). ПК TM предоставляет помощь и практическую помощь участвующим узлам и их пользователям.

Достижения

У EMBnet были первые серверы Gopher и World Wide Web в области биологии (CSC BioBox).

EMBnet была первой, кто предложил решения для ежедневного обновления баз данных с использованием Интернета (NDT), распределенных вычислений (HASSLE), а также эффективного просмотра и связывания баз данных (Sequence Retrieval System, SRS).

Проект Ping был создан как средство для непрерывного получения информации об эффективности сети по всей Европе .

EMBnet стремится бесплатно предоставлять пользователям новейшие программные алгоритмы (Extended GCG или EGCG) и продолжает разрабатывать современное общедоступное программное обеспечение ( EMBOSS ).

EMBER : европейский образовательный ресурс по мультимедийной биоинформатике. EMBER - это финансируемый Европейским Союзом (ЕС) проект, направленный на разработку набора мультимедийных образовательных инструментов по биоинформатике. EMBER включает в себя автономное интерактивное веб-руководство по биоинформатике и эквивалентный автономный курс на компакт-диске .

Сообщество EMBnet участвовало в создании рецензируемого журнала Briefings in Bioinformatics (BiB). BiB также была поддержана образовательным грантом от EMBnet.

Глобальная организация по биоинформатике обучению, образованию и подготовке кадров (КУБОК) была сформирована как некоммерческий фонд на ежегодной встрече EMBnet 2012.

Журнал

EMBnet.journal
EMBnet.journal cover.jpg
Дисциплина Биоинформатика
Язык английский
Под редакцией  по Эрик Бонгкам-Рудлофф
Детали публикации
История 2010-настоящее время
Издатель
EMBnet
Частота Ежеквартальный
да
Стандартные сокращения
ISO 4 EMBnet.journal
Индексирование
ISSN 2226-6089
Ссылки

С 1994 по 2009 год EMBnet издавал EMBnet.news . Его основная цель заключалась в том, чтобы донести до сообщества пользователей информацию и отчеты о последних новостях и событиях в сети.

Основанный в 2010 году в качестве преемника EMBnet.news (с нумерацией объема продолжает бесперебойно), EMBnet.journal является рецензируемым открытым доступом научного журналом публикации оригинальных исследований и технических документов в области биоинформатики . Журнал содержит два основных раздела: один для исследовательских статей, обзоров и технических заметок, а другой - для нерецензируемых комментариев, репортажей, руководств пользователя, обучающей информации и новостей. EMBnet.journal также публикует материалы конференций и аннотации собраний в качестве приложений.

Рекомендации

Внешние ссылки