Семейство факторов транскрипции ETS - ETS transcription factor family
| Ets-домен | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура аутоингибирования связывания ДНК Ets-1.
| |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Условное обозначение | Ets | ||||||||||
| Pfam | PF00178 | ||||||||||
| Клан пфам | CL0123 | ||||||||||
| ИнтерПро | IPR000418 | ||||||||||
| УМНЫЙ | SM00413 | ||||||||||
| ПРОФИЛЬ | PDOC00374 | ||||||||||
| SCOP2 | 1r36 / СФЕРА / СУПФАМ | ||||||||||
| |||||||||||
В области молекулярной биологии , то ЭТС ( Е26 преобразования конкретный или Е-двадцать шести. (Эритробласты Трансформация Удельной) ) семейство является одним из самых крупных семейств факторов транскрипции и является уникальным для животных . У человека 29 генов , 28 - у мышей, 10 - у Caenorhabditis elegans и 9 - у дрозофилы . Член-основатель этого семейства был идентифицирован как ген, трансдуцированный вирусом лейкемии, E26. Члены семьи были вовлечены в развитие различных тканей, а также в прогрессирование рака.
Подсемейства
Семейство ETS (Erythroblast Transformation Specific) разделено на 12 подсемейств, которые перечислены ниже:
| Подсемейство | Члены семьи млекопитающих | Ортологи беспозвоночных |
|---|---|---|
| ELF | ELF1 , ELF2 (NERF), ELF4 (MEF) | |
| ELG | GABPα | ELG |
| ЭРГ | ЭРГ , ФЛИ1 , ОФВ | |
| ERF | ERF ( PE2 ), ETV3 (PE1) | |
| ESE | ELF3 (ESE1 / ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (EHF) | |
| ETS | ETS1 , ETS2 | УКАЗАЛ |
| PDEF | SPDEF (PDEF / PSE) | |
| PEA3 | ETV4 (PEA3 / E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81) | |
| ER71 | ETV2 (ER71) | |
| SPI | SPI1 (PU.1), SPIB , СПИК | |
| TCF | ELK1 , ELK4 (SAP1), ELK3 (NET / SAP2) | LIN |
| ТЕЛ | ETV6 (TEL), ETV7 (TEL2) | ЯН |
Структура
Все члены семьи ЭТС (эритробласты Преобразование Конкретный) идентифицируются через высоко консервативен ДНК связывающего домен , то домен ЭТСА , который представляет собой крылатая спираль-поворот-спираль структуры , которая связывается с участками ДНК с центральным GGA (А / Т) последовательность ДНК. Помимо функций связывания ДНК, данные свидетельствуют о том, что домен ETS также участвует во взаимодействиях белок-белок . За пределами ДНК-связывающего домена ETS сходство ограничено.
Также присутствуют и другие домены, которые варьируются от члена ETS к члену ETS, включая домен Pointed, подкласс семейства доменов SAM.
Функция
Семьи ЭТС присутствует по всему телу и участвует в самых разнообразных функций , в том числе регуляции клеточной дифференцировки , клеточного цикла контроля, миграции клеток , пролиферации клеток , апоптоз (запрограммированную гибель клеток) и ангиогенеза .
Было обнаружено, что несколько факторов ETS связаны с раком, например, через слияние генов . Например, фактор транскрипции ERG ETS сливается с геном EWS , в результате чего возникает состояние, называемое саркомой Юинга . Слияние TEL с белком JAK2 приводит к раннему пре-B острому лимфоидному лейкозу. ERG и ETV1 - известные слияния генов, обнаруживаемые при раке простаты .
Кроме того, факторы ETS, например позвоночного ETV1 и беспозвоночных Аст-1, было показано, что важными игроками в спецификации и дифференцировки дофаминергических нейронов в обоих C. Элеганс и обонятельных луковиц из мышей .
Способ действия
Среди членов семейства ETS существует обширная консервативность ДНК-связывающего домена ETS и, следовательно, большая избыточность в связывании ДНК. Считается, что взаимодействие с другими белками (например, с модулятором активности Ets, называемым Mae) является одним из способов достижения специфического связывания с ДНК. Фактор транскрипции Ets - это сайт конвергенции сигналов. Факторы ETS действуют как транскрипционные репрессоры , транскрипционные активаторы , или оба.
использованная литература
дальнейшее чтение
- Блэр Д.Г., Афанасиу М. (2000). «Ets и ретровирусы - трансдукция и активация членов семейства онкогенов Ets в вирусном онкогенезе» . Онкоген . 19 (55): 6472–81. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204046 . PMID 11175363 .
- Ли Р., Пей Х., Уотсон Д.К. (2000). «Регулирование функции Ets посредством белок-белковых взаимодействий» . Онкоген . 19 (55): 6514–23. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204035 . PMID 11175367 .
- Мимо М (2000). «Структурно-функциональные исследования факторов транскрипции ETS». Crit Rev Oncog . 11 (3–4): 227–53. DOI : 10,1615 / critrevoncog.v11.i34.20 . PMID 11358268 .
- Оикава Т., Ямада Т. (2003). «Молекулярная биология семейства транскрипционных факторов Ets». Джин . 303 : 11–34. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (02) 01156-3 . PMID 12559563 .
- Семенченко В.И., Ватсон Д.К. (2000). «Гены-мишени Ets: прошлое, настоящее и будущее» . Онкоген . 19 (55): 6533–48. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204034 . PMID 11175369 .
- Верже А, Дютерк-Кокийо М (2002). «Когда факторы транскрипции Ets встречаются со своими партнерами». BioEssays . 24 (4): 362–70. DOI : 10.1002 / bies.10068 . PMID 11948622 .
- Нанн М., Зеебург П., Московичи С., Дюсберг П. (1983). «Трехчастная структура гена, трансформирующего Е26 вируса эритробластоза птиц». Природа . 306 (5941): 391–95. Bibcode : 1983Natur.306..391N . DOI : 10.1038 / 306391a0 . PMID 6316155 . S2CID 4302399 .