Гаплогруппа H (мтДНК) - Haplogroup H (mtDNA)

Гаплогруппа H - это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК). Считается, что клады возникли в Юго-Западной Азии , недалеко от современной Сирии, примерно от 20 000 до 25 000 лет назад. Митохондриальная гаплогруппа H сегодня преимущественно встречается в Европе и, как полагают, эволюционировала до Последнего ледникового максимума (LGM). Вскоре он сначала распространился на север Ближнего Востока и Южного Кавказа , а более поздние миграции из Иберии предполагают, что клады достигли Европы до последнего ледникового максимума. Гаплогруппа также распространилась на части Африки, Сибири и внутренней Азии. Сегодня около 40% всех материнских линий в Европе принадлежат к гаплогруппе H.

Источник

Гаплогруппа H является потомком гаплогруппы HV . Кембридж эталонная последовательность (СКИ), который до недавнего времени был человек митохондриальной последовательностью , в которой сравнивали все остальное, принадлежит к гаплогруппе H2a2a1 (митохондриальные последовательности человека теперь должны быть сопоставлены с родовой реконструированным Sapiens эталонной последовательностью (РВКР)). Несколько независимых исследований пришли к выводу, что гаплогруппа H, вероятно, возникла в Западной Азии c. 25000 лет назад.

В июле 2008 года было обнаружено, что древняя мтДНК человека по имени Пагличчи 23 , останки которого датированы 28000 лет назад и раскопаны в пещере Пагличчи ( Апулия , Италия ), идентична Кембриджской эталонной последовательности в HVR1 . Когда-то считалось, что это указывает на гаплогруппу H, но теперь исследователи признают, что CRS HVR1 также появляется в U или HV, потому что нет мутаций HVR1, которые отделяют CRS от основателя гаплогруппы R. Гаплогруппа HV происходит от гаплогруппы R0, которая, в свою очередь, происходит от гаплогруппы R, является потомком макро-гаплогруппы N, как ее родной брат M, является потомком гаплогруппы L3.

Гаплогруппа H также была обнаружено среди иберо-мавританской культуры образцов , начиная с Epipalaeolithic в самых Taforalt и Afalou доисторических сайтах. Среди тафоральтов около 29% наблюдаемых гаплотипов принадлежали к различным субкладам H, включая H1 (2/24; 8%), H103 (1/24; 4%), H14b1 (1/24; 4%), H2a2a1. (1/24; 4%) и H2a1e1a (1/24; 4%). Еще один 41% из проанализированных гаплотипов может быть назначен либо гаплогруппы H или гаплогруппа U . Среди особей афалу субклады H были представлены H103 (1/9; 11%). Еще 44% проанализированных гаплотипов можно отнести либо к гаплогруппе H, либо к гаплогруппе U (3/9; 33%), либо к гаплогруппе H14b1 или гаплогруппе JT (1/9; 11%).

MtDNA H имела частоту 19% среди неолитических ранних европейских фермеров и практически отсутствовала среди мезолитических европейских охотников-собирателей.

МтДНК H также присутствовала в культуре Cucuteni-Trypillia .

Клады наблюдается среди древних египетских мумий , выкопанных на Абусире эль-Meleq археологических раскопок в Среднем Египте, которые датируются пред- Птолемеев / конца Нового царства и Птолемеев периодов.

Кроме того, гаплогруппа H была обнаружена среди образцов на кладбище на материке в Кулубнарти , Судан , которые датируются раннехристианским периодом (550–800 гг. Нашей эры).

Распределение

Прогнозируемые пространственные частотные распределения для гаплогрупп H *, H1, H2a, H3, H4, H5a, H6a, H7, H8 и H11

Гаплогруппа H является наиболее распространенной кладой мтДНК в Европе . Он встречается примерно у 41% коренных европейцев. Линия также распространена в Северной Африке и на Ближнем Востоке .

У большинства европейского населения общая частота гаплогруппы H составляет 40–50%, с уменьшением частот на юго-востоке. Клада достигает 20% на Ближнем Востоке и Кавказе, 17% в Иране и <10% на Аравийском полуострове, в Северной Индии и Центральной Азии .

Недифференцированная гаплогруппа H была обнаружена среди палестинцев (14%), сирийцев (13,6%), друзов (10,6%), иракцев (9,5%), сомалийцев (6,7%), египтян (5,7% в Эль-Хайезе; 14,7% в Гурне). ), Саудиты (5,3–10%), сокотри (3,1%), нубийцы (1,3%) и йеменцы (0–13,9%).

Субклады

Среди всех этих клад подгаплогруппы H1 и H3 были предметом более детального изучения и будут связаны с магдаленской экспансией из Юго-Восточной Европы c. 13000 лет назад:

H1

Прогнозируемое пространственно-частотное распределение гаплогруппы H1

H1 охватывает важную часть западноевропейских ветвей мтДНК, достигая своего локального пика среди современных басков (27,8%). Клада также встречается с высокой частотой в других местах на Пиренейском полуострове , а также в Магрибе ( Тамазга ). Частота гаплогрупп превышает 10% во многих других частях Европы (Франция, Сардиния, части Британских островов, Альпы, большая часть Восточной Европы) и превышает 5% почти на всем континенте. Его субклад H1b наиболее распространен в Восточной Европе и на северо-западе Сибири.

По состоянию на 2010 год самая высокая частота субклада H1 была обнаружена среди туарегов, населяющих регион Феццан в Ливии (61%). Базальная гаплогруппа H1 * встречается у туарегов, населяющих район Госси в Мали (4,76%).

Редкий субклад H1cb сконцентрирован среди групп фулани, населяющих Сахель.

Гаплогруппа Н была обнаружена в различных ископаемых , которые были проанализированы на древней ДНК, в том числе образцов , связанных с Linearbandkeramik культуры (H1E, Хальберштадта-Sonntagsfeld, 1/22 или ~ 5%; H1 или H1au1b, Карсдорф , 1/2 или 50%) , Германия Средний неолит (H1e1a, Esperstedt, 1/1 или 100%), Иберия, ранний неолит (H1, Эль-Прадо-де-Панкорбо, 1/2 или 50%), Иберия, средний неолит (H1, Ла Мина, 1/4 или 25%). %) и энеолита Иберии (H1t, пещера Эль-Мирадор, 1/12 или ~ 8%). Гаплогруппа H наблюдалась в древних окаменелостях гуанчей, раскопанных на Гран-Канарии и Тенерифе на Канарских островах , которые были датированы радиоуглеродом между 7 и 11 веками нашей эры. На участке Тенерифе эти кладоносные особи принадлежат к субкладе H1cf (1/7; ~ 14%); на стоянке Гран-Канария экземпляры относились к подгаплогруппе H2a (1/4; 25%). Кроме того, было обнаружено, что все древние гуанчи (бимбачи), раскопанные в Пунта-Асуль, Эль-Йерро , Канарские острова, принадлежали к материнскому субкладу H1. Эти местные жители были датированы 10 веком и несли гаплотип H1-16260, который является исключительным для Канарских островов и Алжира .

Частоты гаплогруппы H1 в мире (Ottoni et al. 2010)

H3

H3 встречается по всей Европе и в Магрибе, но не существует на Дальнем Востоке и, как полагают, возник среди мезолитических охотников-собирателей в юго-западной Европе между 9000 и 11000 лет назад. H3 представляет собой вторую по величине фракцию генома H после H1 и имеет несколько похожее распределение с пиками в Португалии, Испании, Скандинавии и Финляндии. Распространен в Португалии (12%), Сардинии (11%), Галисии (10%), Стране Басков (10%), Ирландии (6%), Норвегии (6%), Венгрии (6%) и на юго-западе Франции. (5%). Исследования показали, что гаплогруппа H3 обладает высокой защитой от прогрессирования СПИДа.

Примеры подгрупп H3:

• H3a и H3g, обнаруженные в северо-западной Европе;
• H3b и H3k, обнаруженные на Британских островах и в Каталонии;
• H3c, найденный в Западной Европе, в том числе у басков;
• H3h, найденный по всей Северной Европе, включая останки Сердича (519–534), короля Уэссекса;
• H3i обнаружен в Ирландии и Шотландии;
• H3j найден в Италии;
• H3v встречается особенно в германских странах и;
• H3z найден в Атлантической Европе.

Базальная гаплогруппа H3 * встречается у туарегов, населяющих район Госси в Мали (4,76%).

H5

H5, возможно, возник в Западной Азии, где он наиболее часто и разнообразен на Западном Кавказе. Однако его субклад H5a имеет более сильное представительство в Европе, хотя и на низком уровне.

H2, H6 и H8

Гаплогруппы H2, H6 и H8 довольно распространены в Восточной Европе и на Кавказе. Они могут быть наиболее распространенными субкладами H среди жителей Центральной Азии, а также были обнаружены в Западной Азии. H2a5 был обнаружен в Стране Басков, Испании, Норвегии , Ирландии и Словакии . H6a1a1a распространена среди евреев-ашкенази.

H7 и H13

Эти подгаплогруппы H4, H7 и H13 присутствуют как в Европе, так и в Западной Азии; субклад H13 также встречается на Кавказе; H13c был обнаружен в образце возрастом 9700 лет в мезолитической Грузии. Они довольно редки.

H4

H4 часто встречается на Пиренейском полуострове , в Великобритании и Ирландии на уровне от 1 до 5% населения. Это связано с неолитическими миграциями.

H4 и H13 вместе с H2 составляют 42% линий передачи hgH в Египте.

H10

Гаплогруппа H10 - это субклад, возникший между 6300 и 10900 лет назад. Его дочерними ветвями являются H10a H10b H10c H10d H10e H10f H10g и H10h.

Гаплогруппа H10e была обнаружена на месте неолита, а именно в пещере Бом Санто недалеко от Лиссабона. Это самый старый образец H10, который когда-либо был обнаружен, и он был датирован 3735 годом до нашей эры (+ - 45 лет).

H11

H11 обычно встречается в Центральной Европе.

H18

H18 встречается на Аравийском полуострове.

H20 и H21

Обе эти гаплогруппы находятся в Кавказском регионе. Вода H2O также присутствует в небольших количествах на Пиренейском полуострове (менее 1%), Аравийском полуострове (1%) и на Ближнем Востоке (2%).

С H22 по H95a

Эти субклады встречаются в основном в Европе, Юго-Западной Азии и Центральной Азии.

Дерево

Филогенетическое дерево гаплогруппы H

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы H основано на сборке 16 (февраль 2014 г.) Phylotree, международно признанном стандарте. Полное дерево можно увидеть на Филотрее.

Генетические черты

Гаплогруппа H была обнаружена как возможный фактор риска развития ишемической кардиомиопатии .

Популярная культура

В своей популярной книге Семь дочерей Евы , Брайан Сайкс назвал виновником этого мтДНК гаплогруппы Елены . Стивен Оппенгеймер использует очень похожее имя Хелина в своей книге «Происхождение британцев» .

Смотрите также

• Генеалогический ДНК-тест
• Генетическая генеалогия
• Митохондриальная генетика человека
• Популяционная генетика
• SNPedia

использованная литература

внешние ссылки

• Общий
  • Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
  • Филотрия Манниса ван Овена
• Гаплогруппа H
  • Проект мтДНК гаплогруппы H в генеалогическом древе ДНК
  • National Geographic в Spread гаплогруппы H , от National Geographic
  • Статья о гаплогруппе H мтДНК на SNPedia
  • Хелена Амелии
  • Лоогвяли Е.Л., Роосталу У., Малярчук Б.А., Деренко М.В., Кивисилд Т., Мецпалу Э. и др. (Ноябрь 2004 г.). «Разъединяющее единообразие: пестрый кладистический холст гаплогруппы H мтДНК в Евразии» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (11): 2012–21. DOI : 10.1093 / molbev / msh209 . PMID  15254257 .
  • Учебники по генобазе по гаплогруппе H мтДНК
  • Филогенетическое дерево генобазы гаплогруппы H мтДНК
  • Географическое распределение генобазы гаплогруппы H мтДНК
  • Частоты гаплогрупп и субкластеров для европейских популяций: Helgason A, Hickey E, Goodacre S, Bosnes V, Stefánsson K, Ward R и др. (Март 2001 г.). «МтДНК и острова Северной Атлантики: оценка пропорций норвежского и гэльского происхождения» . Американский журнал генетики человека . 68 (3): 723–37. DOI : 10.1086 / 318785 . PMC  1274484 . PMID  11179019 .
  • Датский региональный проект ДНК Демес: мтДНК гаплогруппа H
  • Опрос / исследование открыто для мужчин, принадлежащих к любой ветви гаплогруппы H
  • Опрос / исследование открыто для женщин, принадлежащих к любой ветви гаплогруппы H
• Гаплогруппа H1
  • Надежда Проект гаплогруппы мтДНК H1