Гаплогруппа Т (мтДНК) - Haplogroup T (mtDNA)

Гаплогруппа T
Возможное время происхождения 25 149 ± 4 668 лет до настоящего времени
Возможное место происхождения Ближний Восток
Предок JT
Потомки Т1 и Т2
Определение мутаций G709A, G1888A, A4917G, G8697A, T10463C, G13368A, G14905A, A15607G, G15928A, C16294T

Гаплогруппа T - это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК). Считается, что он возник около 25 100 лет назад на Ближнем Востоке .

Происхождение

Митохондриальная кладка T происходит от гаплогруппы JT , которая также дала начало гаплогруппе J мтДНК . Считается, что материнская группа T произошла с Ближнего Востока ( Бермишева, 2002 ) .

Распределение

Прогнозируемое пространственное частотное распределение для гаплогруппы T.

Базальной гаплогруппа Т * обнаружен среди алжирцев в Оране (1,67%) и Reguibate Sahrawi (0,93%). Он также распространяется среди сокотрийцев (1,2%).

Гаплогруппа T присутствует в гаплогруппе низких частот по всей Западной и Центральной Азии и Европе, с разной степенью распространенности и, безусловно, могла присутствовать в других группах из окружающих областей. T встречается примерно у 10% коренных европейцев. Это также распространено среди современных иранцев . Основываясь на выборке из более чем 400 современных иранцев ( Kivisild and Metspalu 2003 ) , гаплогруппа T представляет примерно 8,3% населения (примерно 1 из 12 человек), а более конкретный подтип T1 составляет примерно половину из них. Более того, специфический подтип T1, как правило, находится дальше на восток и распространен среди центральноазиатских и современных тюркских народов ( Lalueza-Fox 2004 ), которые населяют большую часть той же территории, что и древние саки , сарматы , андроновцы и другие предполагаемые иранские народы. 2-го и 1-го тысячелетий до нашей эры. Lalueza-Fox et al. (2004) также обнаружили несколько последовательностей T и T1 в древних захоронениях, включая курганы , в казахстанской степи между XIV-X веками до нашей эры, а также позже в I тысячелетии до нашей эры. Они совпадают с последней частью андроновского периода и сакским периодом в регионе.

Географическое распределение внутри субклада T2 сильно варьируется, в зависимости от отношения подгаплогруппы T2e к T2b, которое, как сообщается, варьируется в 40 раз в исследуемых популяциях, от низкого в Великобритании и Ирландии до высокого в Саудовской Аравии ( Bedford 2012 ). В подгаплогруппе T2e очень редкий мотив идентифицирован среди сефардских евреев Турции и Болгарии и подозреваемых конверсос из Нового Света ( Bedford 2012 ).

Встречается у сванской популяции с Кавказа (Грузия) T * 10,4% и T1 4,2%. T1a1a1 особенно распространен в странах с высоким уровнем Y-гаплогруппы R1a, таких как Центральная и Северо-Восточная Европа. Клада также встречается повсюду в Центральной Азии и в глубине Северной Азии, вплоть до Монголии на восток.

T2c и T2d, по-видимому, имеют ближневосточное происхождение примерно во время последнего ледникового максимума (LGM) и более позднего распространения в Европу. Большая часть T2c состоит из гаплогруппы T2c1. Помимо пика на Кипре, T2c1 наиболее распространен в регионе Персидского залива, но также встречается в Леванте и в Средиземноморской Европе с более широким распространением на очень низких уровнях.

Т2 также встречается среди сокотрийцев (7,7%).

Археология

Wilde et al. (2014) протестировали образцы мтДНК из культуры ямна , предполагаемой родины протоиндоевропейских носителей. Они обнаружили T2a1b в Среднем Поволжье и Болгарии , а T1a - в Центральной Украине и Среднем Поволжье. Частота T1a и T2 в выборках ямны составляла 14,5% каждая, что на процент выше, чем в любой стране сегодня, и обнаруживалась на столь же высоких частотах только у удмуртов Волго-Уральского региона.

Гаплогруппа T также была обнаружена среди образцов иберомавров эпохи эпипалеолита в доисторическом месте Афалу в Алжире . У одного древнего человека был субклад T2b (1/9; 11%). Кроме того, гаплогруппа T наблюдается среди древних египетских мумий , выкопанных на Абусире эль-Meleq археологических раскопках в Среднем Египте, датируемый предварительное производство Птолемеев / позднее Новое царство (Т1, Т2), Птолемей (Т1, Т2), и римский (недифференцированные Т, Т1) периоды. Окаменелости, раскопанные на месте позднего неолита Келиф-эль-Боруд в Марокко , датируемые примерно 3000 г. до н.э., также имеют субклад T2. Кроме того, гаплогруппа T наблюдалась в древних окаменелостях гуанчей, обнаруженных на Гран-Канарии и Тенерифе на Канарских островах , которые были датированы радиоуглеродом между 7 и 11 веками нашей эры. Кладоносные особи были ингумированы на стоянке Тенерифе, причем один экземпляр оказался принадлежащим к субкладе T2c1d2 (1/7; 14%).

Африке

В Африке гаплогруппа T в основном встречается среди афро-азиатских популяций, включая базальную кладу T *. Некоторые Т клады , не базальные также часто встречаются среди Niger-Конго -speaking Serer за счет диффузии из Магриба , скорее всего , с распространением ислама.

численность населения Место нахождения Языковая Семья N Частота Источник
Амхара Эфиопия Афро-азиатский> семитский 5/120 4,17% Кивисилд 2004
Бежа Судан Афро-азиатский> кушитский 1/48 2,1% Хасан 2009
Бета Израиль Эфиопия Афро-азиатский> кушитский 0/29 0,00% Бехар 2008a
Копт Египет Афро-азиатский> египетский 29 мая 17,2% Хасан 2009
Давро К. Эфиопия Афро-азиатское> Омотическое 2/137 1,46% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Египтяне (Эль-Хайез) Египет Афро-азиатский> семитский 10/35 28,6% Куянова 2009
Эфиопия Эфиопия Неопределенный 2/77 2,60% Соареш 2011
Эфиопский еврей Эфиопия Афро-азиатский> кушитский 0/41 0,00% Не 2011
Гураге Эфиопия Афро-азиатский> семитский 0/21 0,00% Кивисилд 2004
Хамер Эфиопия Афро-азиатское> Омотическое 0/11 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Онгота Эфиопия Афро-азиатский> кушитский 0/19 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Оромо Эфиопия Афро-азиатский> кушитский 0/33 0,00% Кивисилд 2004
Tigrai Эфиопия Афро-азиатский> семитский 3/44 6,82% Кивисилд 2004
Даасанах Кения Афро-азиатский> кушитский 0/49 0,00% Полони 2009
Эльмоло Кения Афро-азиатский> кушитский 0/52 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Луо Кения Нило-Сахара 0/49 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Масаи Кения Нило-Сахара 0/81 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Найроби Кения Нигер-Конго 0/100 0,00% Brandstatter 2004
Ньянгатом Кения Нило-Сахара 0/112 0,00% Полони 2009
Рендиль Кения Афро-азиатский> кушитский 0/17 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Самбуру Кения Нило-Сахара 0/35 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Туркана Кения Нило-Сахара 0/51 0,00% Кастри 2008 и Боаттини 2013
Хуту Руанда Нигер-Конго 0/42 0,00% Кастри 2009
Динка Судан Нило-Сахара 0/46 0,00% Крингс 1999
Судан Судан Неопределенный 3/102 2,94% Соареш 2011
Бурунге Танзания Афро-азиатский> кушитский 0/38 0,00% Тишкофф 2007
Датога Танзания Нило-Сахара 1/57 1,75% Тишкофф 2007 и Рыцарь 2003
Ирак Танзания Афро-азиатский> кушитский 0/12 0,00% Рыцарь 2003
Сукума Танзания Нигер-Конго 0/32 0,00% Тишкофф 2007 и Рыцарь 2003
Туру Танзания Нигер-Конго 0/29 0,00% Тишкофф 2007
Йеменцы Йемен Афро-азиатский> семитский 1/114 0,88% Кивисилд 2004

Азия

Европа

Субклады

Схематическое дерево гаплогруппы мтДНК T. Указанные возрасты (в тыс. Лет ) являются оценками максимального правдоподобия, полученными для всего генома мтДНК.

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы I основано на статье ( van Oven 2008 ) и последующих опубликованных исследованиях ( Behar 2012b ). Для краткости показаны только первые три уровня субкладов (веток).

  • Т
    • Т1
      • T1a
        • T1a1
      • T1b
    • Т2
      • T2a
        • T2a1
      • T2b
        • T2b1
        • T2b2
        • T2b3
        • T2b4
        • T2b5
        • T2b6
      • T2c
        • T2c1
      • T2d
      • T2e
        • T2e2
      • T2f
        • T2f1
      • T2g

Вопросы здравоохранения

Одно исследование показало, что гаплогруппа T связана с повышенным риском ишемической болезни сердца ( Sanger 2007 ) . Однако некоторые исследования также показали, что люди гаплогруппы T менее склонны к диабету ( Chinnery 2007 и González 2012 ).

Несколько предварительных медицинских исследований показали, что гаплогруппа T может обладать некоторой устойчивостью как к болезни Паркинсона, так и к болезни Альцгеймера .

Одно исследование показало, что среди населения Испании гипертрофическая кардиомиопатия (HCM), также называемая гипертрофической обструктивной кардиомиопатией (HOCM), чаще встречается у тех, кто принадлежит к родословной T2, чем у тех, кто принадлежит к другим материнским гаплогруппам. Неизвестно, является ли это специфическим для этого подкласса гаплогруппы T или является фактором риска, общим для всей гаплогруппы T. Со статистически значимой разницей, обнаруженной в такой небольшой выборке, может быть рекомендовано для тех, кто имеет известную материнскую гаплогруппу T. родословной, чтобы знать об этом и попросить своего врача проверить доказательства этого состояния при обычном обследовании в раннем возрасте. Обычно он протекает бессимптомно и увеличивает риск внезапной сердечной смерти, что часто случается с теми, кто уже в подростковом возрасте, и может повлиять на тех, кто ведет активный образ жизни и не имеет других факторов риска.

Некоторые медицинские исследования показали, что митохондриальная гаплогруппа T связана со снижением подвижности сперматозоидов у мужчин, хотя эти результаты были оспорены ( Mishmar 2002 ) . Согласно Departamento de Bioquimica y Biologica Molecular y Celular, Universidad de Zaragoza, гаплогруппа T может предрасполагать к астенозооспермии ( Ruiz-Pesini 2000 ) . Однако эти результаты были оспорены из-за небольшого размера выборки в исследовании ( Mishmar 2002 ) .

Известные участники

Во время BBC One документального Встретить Izzards , актер и комик Эдди Иззард узнает , что ее митохондриальной ДНК гаплогруппы Т, а именно субклад T2f1a1.

Николай II России

Было показано, что последний русский царь , Николай II , принадлежал к гаплогруппе T, в частности, к субкладу T2 ( Иванов, 1996 ) . Если предположить, что все соответствующие родословные верны, это включает в себя всех потомков по женской линии его предка по женской линии Барбары Целье (1390–1451), жены Сигизмунда, императора Священной Римской империи . Это включает в себя большое количество европейских дворян, в том числе Георга I из Великобритании и Фридриха Вильгельма I из Пруссии (через Электресс Софию Ганноверскую ), Карла I из Англии , Георга III из Соединенного Королевства , Георга V из Соединенного Королевства , Карла X Густав Швеции , Густав Адольф из Швеции , Морис Нассау, принц Оранский , Олав V из Норвегии и Георг I из Греции .

Смотрите также

Генетика

Магистральное дерево мтДНК

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

  Митохондриальная Ева ( L )    
L0 L1–6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
M N  
CZ D E грамм Q   О А S р   я W Икс Y
C Z B F R0   pre-JT   п   U
HV JT K
ЧАС V J Т

использованная литература

Сноски

Цитаты

  1. ^ a b Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тахрия Деба; Франческ Калафель; Сорайя Бенхамамуш; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая неоднородность в алжирских популяциях человека» . PLOS ONE . 10 (9): e0138453. Bibcode : 2015PLoSO..1038453B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0138453 . PMC  4581715 . PMID  26402429 .; Стол S5
  2. ^ a b Черный, Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, выявленное генетическим разнообразием митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. DOI : 10.1002 / ajpa.20960 . PMID  19012329 . Архивировано из оригинального (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 13 июня +2016 .
  3. Брайан Сайкс (2001). Семь дочерей Евы . Лондон; Нью-Йорк: Bantam Press. ISBN 978-0393020182.
  4. ^ "Материнское происхождение" . Оксфордские предки. Архивировано из оригинала 15 июля 2017 года . Проверено 7 февраля 2013 года .
  5. ^ Беннетт, Кейси; Кестле, Фредерика А. (2010). «Исследование древней ДНК Западной Сибири и саргатской культуры». Биология человека . 82 (2): 143–156. arXiv : 1112.2014 . DOI : 10.3378 / 027.082.0202 . PMID  20649397 . S2CID  54566651 .
  6. ^ Пала, М; Olivieri, A; Ахилли, А; Accetturo, M; Мецпалу, Э; Рейдла, М; Тамм, Э; Кармин, М; Райсберг, Т; Хушиар Кашани, B; Перего, UA; Каросса, V; Гандини, Ф; Pereira, JB; Соарес, П; Angerhofer, N; Рычков, С; Аль-Захери, Н. Карелли, V; Санати, MH; Houshmand, M; Hatina, J; Маколей, V; Перейра, L; Вудворд, SR; Дэвис, Вт; Гэмбл, C; Baird, D; Семино, О; Виллемс, Р. Торрони, А; Ричардс, МБ (4 мая 2012 г.). «Сигналы митохондриальной ДНК поздней ледниковой реколонизации Европы из ближневосточных рефугиумов» . Американский журнал генетики человека . 90 (5): 915–924. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2012.04.003 . PMC  3376494 . PMID  22560092 .http://haplogroup.org/sources/mitochondrial-dna-signals-of-late-glacial-recolonization-of-europe-from-near-eastern-refugia/
  7. ^ Уайлд, Сандра (2014). «Прямые доказательства положительного отбора пигментации кожи, волос и глаз у европейцев за последние 5000 лет» . Труды Национальной академии наук . 111 (13): 4832–4837. Bibcode : 2014PNAS..111.4832W . DOI : 10.1073 / pnas.1316513111 . PMC  3977302 . PMID  24616518 .
  8. ^ Кефи, Рим; и другие. (2018). «О происхождении иберомавров: новые данные на основе древней митохондриальной ДНК и филогенетического анализа популяций афалу и тафоральта». Митохондриальная ДНК Часть А . 29 (1): 147–157. DOI : 10.1080 / 24701394.2016.1258406 . PMID  28034339 . S2CID  4490910 .
  9. ^ Schuenemann, Верена J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды» . Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo ... 815694S . DOI : 10.1038 / ncomms15694 . PMC  5459999 . PMID  28556824 .
  10. ^ Фрегель; и другие. (2018). «Древние геномы из Северной Африки свидетельствуют о доисторических миграциях в Магриб как из Леванта, так и из Европы». bioRxiv  10.1101 / 191569 .
  11. ^ Родригес-Варела; и другие. (2017). «Геномный анализ человеческих останков с Канарских островов до европейского завоевания показывает близкое родство с современными североафриканцами» . Текущая биология . 27 (1–7): 3396–3402.e5. DOI : 10.1016 / j.cub.2017.09.059 . PMID  29107554 .
  12. ^ Болл, Эдвард (2007). Генетическая цепочка: изучение семейной истории через ДНК . Саймон и Шустер. п. 233. ISBN. 978-1416554257. Дата обращения 31 мая 2016 .
  13. Перейти ↑ Castro, M (2006). «Гаплогруппы митохондриальной ДНК у испанских пациентов с гипертрофической кардиомиопатией». Int J Cardiol . 112 (2): 202–6. DOI : 10.1016 / j.ijcard.2005.09.008 . PMID  16313983 .
  14. ^ Чен, Майкл. «Гипертрофическая кардиомиопатия - Медицинская энциклопедия» . Медлайн Плюс . Национальная медицинская библиотека . Проверено 3 октября 2015 .
  15. ^ Встречайте Izzards: Линия маминой . BBC One . 2013-03-12. 48 минут в.


Сайты

дальнейшее чтение

внешние ссылки