Гаплогруппа митохондриальной ДНК человека - Human mitochondrial DNA haplogroup

Распределение современных гаплогрупп мтДНК человека на основе анализа 2054 человек из 26 популяций. (а) Круговые диаграммы на карте. (б) Количество гаплогрупп в табличном формате. Подробные сведения о популяциях см. В разделе « 1000 Genomes Project # Образцы генома человека» .

В области генетики человека , А человек митохондриальная гаплогруппа ДНК является гаплогруппа определяется различиями в митохондриальной ДНК человека . Гаплогруппы используются для обозначения основных точек ветвления митохондриального филогенетического дерева. Понимание эволюционного пути женского происхождения помогло популяционным генетикам проследить матрилинейную наследственность современных людей до происхождения человека в Африке и последующего распространения по всему миру.

Буквенные названия гаплогрупп (не только гаплогрупп митохондриальной ДНК) идут от A до Z. Поскольку гаплогруппы были названы в порядке их открытия, алфавитный порядок не имеет никакого значения с точки зрения реальных генетических отношений.

Гипотетическая женщина, лежащая в основе всех этих групп (имеется в виду только гаплогруппы митохондриальной ДНК), является самым последним общим предком по матрилине (MRCA) для всех ныне живущих людей . Ее обычно называют митохондриальной Евой .

Скорость мутации митохондриальной ДНК известна как митохондриальные молекулярные часы . Это область постоянных исследований, в одном исследовании сообщается об одной мутации за 8000 лет.

Филогения

Дерево гаплогрупп мтДНК и карта распространения. Цифры представляют собой метки гаплогрупп, сообщенные в соответствии с номенклатурой http://www.phylotree.org/ , и указывают местоположение одной из мутаций, приводящих к производному гаплотипу. (Показан только один маркер, определяющий ветвь, предпочтительно из кодирующей области.) Основные географические особенности распределения гаплогрупп выделены цветом.
Путь распространения гаплогрупп мтДНК человека

Это филогенетическое древо основано Ван Овеном (2009).

Хронология

Расчетная карта мира миграций людей на основе гаплогрупп мтДНК.
Гаплогруппа Стандартное восточное время. время происхождения ( тыс. лет назад ) Возможное место происхождения Самые высокие частоты
L 200
L1-6 170 Восточная Африка
L2-6 150 Восточная Африка
L0 150 Восточная Африка
L1 140 Центральная Африка
L3-6 130
L5 120
L2 90
L3 70 Восточная Африка
N 70 Восточная Африка или Западная Азия
M 60 Восточная Африка, Западная Азия или Южная Азия
р 60
U 55 Северо-Восточная Африка или Индия (Южная Азия)
RT'JT 55 Средний Восток
JT 50 Средний Восток
U8 50 Западная Азия
R9 47
B4 44 год
F 43 год
U4'9 42 Центральная Азия
U5 35 год Западная Азия
U6 35 год Северная Африка
J 35 год
Икс 30
K 30
U5a 27
HV 27 Ближний Восток
J1a 27 Ближний Восток
Т 27 Месопотамия
K1 27
я 26
J1 24 Ближний Восток
W 20
U4 20 Центральная Азия
X2 20
ЧАС 20 Западная Азия
U5a1 18 Европа
J1b 11
V 14
X2a 13 Северная Америка
H1 12
H3 12
X1 10

Географическое распределение

В документе 2004 года было высказано предположение, что наиболее распространенными гаплогруппами в современных европейских популяциях были: H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X и W.

Африканские гаплогруппы: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a

Австралийские гаплогруппы: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (ссылки 1, 2, 3, 4, 5, 6)

Азиатские гаплогруппы: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U множество вариантов номеров для каждого раздела

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Rishishwar L, Иордания IK (2017). «Последствия эволюции человека и добавки для митохондриальной заместительной терапии» . BMC Genomics . 18 (1): 140. DOI : 10,1186 / s12864-017-3539-3 . PMC  5299762 . PMID  28178941 .
  2. ^ Loogvali, Eva-Liis; Кивисилд, Тоомас; Маргус, Тыну; Виллемс, Ричард (2009), О'Рурк, Деннис (редактор), «Объясняя несовершенство молекулярных часов митохондрий гоминид», PLOS ONE , 4 (12): e8260, Bibcode : 2009PLoSO ... 4.8260L , doi : 10.1371 / journal.pone.0008260 , PMC  2794369 , PMID  20041137
  3. ^ Кивисильд Т (2015). «Материнское происхождение и история популяции из целых митохондриальных геномов» . Исследование Genet . 6 : 3. DOI : 10,1186 / s13323-015-0022-2 . PMC  4367903 . PMID  25798216 .
  4. ^ a b van Oven M, Kayser M (февраль 2009 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386–94. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID  18853457 . S2CID  27566749 .
  5. ^ «Исправление для очищающего отбора: Дополнение к улучшенным митохондриальным молекулярным часам человека» (PDF) . 2009: 82–83 [89]. Архивировано из оригинального (PDF) 29 декабря 2009 года. Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  6. ^ Виллемс, Ричард; Усанга, Эсиен; Микерези, Илья; Гельге, Мукаддес; Клаустр, Мирей; Michalodimitrakis, Emmanuel N .; Папа, Каллиопи I .; Anagnou, Николас П .; Шавентре, Андре; Мойзан, Жан-Поль; Ричард, Кристель; Гречанина, Елена; Балановская, Елена В .; Рудан, Павао; Пузырев, Валерий; Степанов, Вадим; Хуснутдинова, Эльза К .; Гусар, Владислава; Балановский, Олег П .; Перичич, Марияна; Барак, Ловорка; Голубенко, Мария; Лункина, Арина; Лаос, Сирль; Пеннарун, Эрван; Парик, Юри; Толк, Хелле-Вийви; Рейдла, Маэре; Тамбец, Кристина; Мецпалу, Эне; Кивисилд, Тоомас; Деренко, Мирослава В .; Малярчук, Борис А .; Роосталу, Урмас; Лоогвяли, Ева-Лийс (1 ноября 2004 г.). «Разъединяющая однородность: пестрый кладистический холст гаплогруппы H мтДНК в Евразии» . Молекулярная биология и эволюция . 21 (11): 2012–2021. DOI : 10.1093 / molbev / msh209 . PMID  15254257 - через Acade.oup.com .

внешние ссылки

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

  Митохондриальная Ева ( L )    
L0 L1–6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
M N  
CZ D E грамм Q   О А S р   я W Икс Y
C Z B F R0   pre-JT   п   U
HV JT K
ЧАС V J Т