Циклогидролаза IMP - IMP cyclohydrolase
| Циклогидролаза IMP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 3.5.4.10 | ||||||||
| Количество CAS | 9013-81-4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | Amigo / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Циклогидролазоподобный белок IMP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура пуро из methanothermobacter thermoautotrophicus
| |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Условное обозначение | IMP_cyclohyd | ||||||||
| Pfam | PF07826 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR020600 | ||||||||
| |||||||||
В энзимологии , циклогидролаза МВП ( EC 3.5.4.10 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
- IMP + H 2 O 5-формамидо-1- (5-фосфо-D-рибозил) имидазол-4-карбоксамид
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются IMP и H 2 O , тогда как его продуктом является 5-формамидо-1- (5-фосфо-D-рибозил) имидазол-4-карбоксамид .
Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , действующих на связи углерод-азот, отличные от пептидных, особенно в циклических амидинах. Систематическое название данного фермента класса ИМП 1,2-гидролазы (decyclizing) . Другие широко используемые названия включают инозиниказу и инозинатциклогидролазу . Этот фермент катализирует циклизацию 5-formylamidoimidazole-4-карбоксамид рибонуклеотида к IMP, реакция , которая играет важную роль в De Novo пурин биосинтеза в архейных видах .
Структурные исследования
В большинстве случаев это одно- домен белок выполнен с возможностью формировать общий сгиб , который состоит из четырех-слоистой альфа - бета ядра -бета-альфа - структуру . Два антипараллельных бета-листа упираются друг в друга и покрыты альфа-спиралями с одной стороны молекулы . Белок структурно подобен членам суперсемейства N-концевых нуклеофилов (NTN) гидролаз . Фактически был обнаружен глубокий карман на поверхности циклогидролазы IMP в положении, эквивалентном положению активных центров NTN-гидролаз, но N-концевой нуклеофил не был обнаружен. Таким образом, считается, что этот фермент структурно, но не функционально подобен членам семейства NTN-гидролаз.
По состоянию на конец 2007 г. было решено 14 структур для этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1G8M , 1M9N , 1OZ0 , 1P4R , 1PKX , 1PL0 , 1THZ , 2B1G , 2B1I , 2IU0 , 2IU3 , 2NTK , 2NTL и 2NTM .
Рекомендации
дальнейшее чтение
- ФЛАКС ДЖ. Г., ЭРВИН М ДЖ., БУКАНЕН ДЖ. М. (1957). «Биосинтез пуринов. XVIII 5-амино-1-рибозил-4-имидазолкарбоксамид, 5'-фосфаттрансформилаза и инозиниказа». J. Biol. Chem . 229 (2): 603–12. PMID 13502325 .
| Эта статья о ферменте EC 3.5 является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |