Международный консорциум по геному рака - International Cancer Genome Consortium

Международный консорциум генома рака ( ICGC ) является добровольной научной организацией , которая является форумом для сотрудничества между ведущим мировым рака и геномных исследователей. ICGC был запущен в 2008 году для координации крупномасштабных исследований генома рака в опухолях 50 типов и / или подтипов рака, которые имеют большое значение во всем мире.

Систематические исследования более 25000 раковых геномов на геномном , эпигеномном и транскриптомном уровнях позволят выявить репертуар онкогенных мутаций, выявить следы мутагенных влияний, определить клинически значимые подтипы для прогноза и терапевтического управления, а также позволить разработать новые методы лечения рака.

ICGC включает данные из Атласа генома рака (TCGA) и Проекта генома рака Сэнгера.

Профессор Эндрю Бианкин А.О., региональный профессор и директор онкологического исследовательского центра Вольфсона Вола при Университете Глазго, с 2018 года является исполнительным директором и председателем.

Цели

ICGC - одно из самых амбициозных биомедицинских исследований со времен проекта «Геном человека» . Консорциум поможет координировать текущие и будущие крупномасштабные проекты, чтобы понять геномные изменения, связанные с раковыми заболеваниями, вызывающими глобальную озабоченность. Каталоги, составленные членами ICGC, будут быстро и бесплатно предоставлены квалифицированным исследователям, что позволит ученым всего мира использовать новую информацию для разработки более эффективных способов диагностики, лечения и профилактики многих типов рака.

Цель МКГК - дать всестороннее описание соматических (ненаследственных) геномных аномалий, присутствующих в широком спектре опухолей человека. Учитывая наши текущие знания о гетерогенности типов и подтипов опухолей, ICGC поставила цель координировать примерно 50 проектов, каждый из которых будет генерировать геномный анализ примерно 500 образцов рака каждого класса. Однако общепризнано, что рак очень неоднороден, и можно выделить сотни типов / подтипов. Таким образом, заявленная цель 50 проектов ICGC не предназначена и не может исчерпывающе охватить весь спектр типов рака.

Члены ICGC по финансированию и исследованиям, предлагающие проект, должны согласиться с политикой ICGC, которая включает требования к быстрому выпуску данных, строгим стандартам качества и защите участников исследования.

Полный список целей, структуры, политики и руководящих принципов ICGC доступен по адресу http://icgc.org/

Структура и финансирование

ICGC финансируется странами-участницами, каждая из которых специализируется на одной или нескольких формах рака, с целью картирования геномов как минимум 50 типов рака. Секретариат консорциума находится в Институте онкологических исследований Онтарио в Торонто , Канада, который также будет управлять центром координации данных. Правительство провинции Онтарио предоставило финансирование в размере 40 миллионов долларов, и ожидается, что каждый участвующий финансирующий участник внесет 20 миллионов долларов в каждый проект. В 2009 году German Cancer Aid поддержала один проект ICGC на 7,9 миллиона евро. Это была самая большая сумма, которую дала частная организация. Деньги пожертвованы немецким народом.

Членство в ICGC открыто для всех организаций, которые соглашаются следовать его принципам и руководящим принципам. ICGC получила обязательства от финансирующих организаций в Азии, Австралии, Европе и Северной Америке для 47 проектных команд в 15 юрисдикциях для изучения более 21 000 геномов опухолей. Проекты, которые в настоящее время финансируются, исследуют опухоли, поражающие мочевой пузырь, кровь, кости, мозг, грудь, шейку матки, толстую кишку, голову и шею, почки, печень, легкие, полость рта, яичник, поджелудочную железу, простату, прямую кишку, кожу, мягкие ткани, желудок, щитовидная железа и матка. Ожидается, что со временем к ICGC присоединятся другие страны и организации. Геномные анализы опухолей, проведенные членами ICGC в Австралии и Канаде (рак поджелудочной железы), Китае (рак желудка), Франции (рак печени), Германии (рак мозга), Японии (рак печени), Испании (рак крови), Великобритании. (кровь, рак груди, легких и кожи) и США (кровь, мозг, груди, толстой кишки, почек, легких, яичников, прямой кишки, желудка и матки) теперь доступны через Центр координации данных, размещенный на веб-сайте ICGC по адресу http : //www.icgc.org . Наборы данных доступны для просмотра и могут быть загружены по адресу https://dcc.icgc.org/ .

Члены исполкома

Представители со статусом наблюдателя:

Текущие исследовательские проекты

В каждой стране-участнице основной целью исследования является определенный тип опухоли:

Будущая работа

ICGCmed

В контексте масштабных международных усилий по секвенированию и в ожидании новой эры точной медицины Международный консорциум генома рака для медицины (ICGCmed) свяжет множество уже собранных геномных данных, а также новые геномные данные, которые будут генерироваться, с клиническая информация и информация о здоровье, включая образ жизни, анамнез пациента, данные диагностики рака, а также ответ на лечение и выживаемость после лечения по всему спектру рака. Используя эти крупномасштабные интегрированные данные, исследователи, ученые, политики и клиницисты смогут работать с пациентами, поставщиками медицинских услуг и другими лицами для разработки превентивных стратегий, маркеров для раннего обнаружения заболеваний, более конкретных критериев и методов диагностики и прогнозов, а также вмешательства, основанные на сопоставлении молекулярного подтипа заболевания пациента с наиболее эффективными комбинациями терапий.

Это приведет к открытию новых терапевтических целей, более точным определениям заболеваний и улучшенным стратегиям предотвращения лекарственной устойчивости.

Смотрите также

Ссылки