Международный консорциум по геному рака - International Cancer Genome Consortium
Международный консорциум генома рака ( ICGC ) является добровольной научной организацией , которая является форумом для сотрудничества между ведущим мировым рака и геномных исследователей. ICGC был запущен в 2008 году для координации крупномасштабных исследований генома рака в опухолях 50 типов и / или подтипов рака, которые имеют большое значение во всем мире.
Систематические исследования более 25000 раковых геномов на геномном , эпигеномном и транскриптомном уровнях позволят выявить репертуар онкогенных мутаций, выявить следы мутагенных влияний, определить клинически значимые подтипы для прогноза и терапевтического управления, а также позволить разработать новые методы лечения рака.
ICGC включает данные из Атласа генома рака (TCGA) и Проекта генома рака Сэнгера.
Профессор Эндрю Бианкин А.О., региональный профессор и директор онкологического исследовательского центра Вольфсона Вола при Университете Глазго, с 2018 года является исполнительным директором и председателем.
Цели
ICGC - одно из самых амбициозных биомедицинских исследований со времен проекта «Геном человека» . Консорциум поможет координировать текущие и будущие крупномасштабные проекты, чтобы понять геномные изменения, связанные с раковыми заболеваниями, вызывающими глобальную озабоченность. Каталоги, составленные членами ICGC, будут быстро и бесплатно предоставлены квалифицированным исследователям, что позволит ученым всего мира использовать новую информацию для разработки более эффективных способов диагностики, лечения и профилактики многих типов рака.
Цель МКГК - дать всестороннее описание соматических (ненаследственных) геномных аномалий, присутствующих в широком спектре опухолей человека. Учитывая наши текущие знания о гетерогенности типов и подтипов опухолей, ICGC поставила цель координировать примерно 50 проектов, каждый из которых будет генерировать геномный анализ примерно 500 образцов рака каждого класса. Однако общепризнано, что рак очень неоднороден, и можно выделить сотни типов / подтипов. Таким образом, заявленная цель 50 проектов ICGC не предназначена и не может исчерпывающе охватить весь спектр типов рака.
Члены ICGC по финансированию и исследованиям, предлагающие проект, должны согласиться с политикой ICGC, которая включает требования к быстрому выпуску данных, строгим стандартам качества и защите участников исследования.
Полный список целей, структуры, политики и руководящих принципов ICGC доступен по адресу http://icgc.org/
Структура и финансирование
ICGC финансируется странами-участницами, каждая из которых специализируется на одной или нескольких формах рака, с целью картирования геномов как минимум 50 типов рака. Секретариат консорциума находится в Институте онкологических исследований Онтарио в Торонто , Канада, который также будет управлять центром координации данных. Правительство провинции Онтарио предоставило финансирование в размере 40 миллионов долларов, и ожидается, что каждый участвующий финансирующий участник внесет 20 миллионов долларов в каждый проект. В 2009 году German Cancer Aid поддержала один проект ICGC на 7,9 миллиона евро. Это была самая большая сумма, которую дала частная организация. Деньги пожертвованы немецким народом.
Членство в ICGC открыто для всех организаций, которые соглашаются следовать его принципам и руководящим принципам. ICGC получила обязательства от финансирующих организаций в Азии, Австралии, Европе и Северной Америке для 47 проектных команд в 15 юрисдикциях для изучения более 21 000 геномов опухолей. Проекты, которые в настоящее время финансируются, исследуют опухоли, поражающие мочевой пузырь, кровь, кости, мозг, грудь, шейку матки, толстую кишку, голову и шею, почки, печень, легкие, полость рта, яичник, поджелудочную железу, простату, прямую кишку, кожу, мягкие ткани, желудок, щитовидная железа и матка. Ожидается, что со временем к ICGC присоединятся другие страны и организации. Геномные анализы опухолей, проведенные членами ICGC в Австралии и Канаде (рак поджелудочной железы), Китае (рак желудка), Франции (рак печени), Германии (рак мозга), Японии (рак печени), Испании (рак крови), Великобритании. (кровь, рак груди, легких и кожи) и США (кровь, мозг, груди, толстой кишки, почек, легких, яичников, прямой кишки, желудка и матки) теперь доступны через Центр координации данных, размещенный на веб-сайте ICGC по адресу http : //www.icgc.org . Наборы данных доступны для просмотра и могут быть загружены по адресу https://dcc.icgc.org/ .
Члены исполкома
- Австралия: Уорик Андерсон, Национальный совет здравоохранения и медицинских исследований
- Канада: Томас Хадсон , Институт исследования рака Онтарио , Сьюзан Ланглуа, Канада по раку простаты, и Синди Белл, Геном Канады.
- Китай: Генри Ян и Юйонг Лу, Китайский консорциум генома рака
- Европейская комиссия: Жак Ремакль, Патрик Колар и Ииро Эерола
- Франция: Фабьен Кальво, Национальный институт рака (INCa)
- Германия: Аксель Арец и Франк Лаплас, Федеральное министерство образования и исследований . Герд Nettekoven , Deutsche Krebshilfe ( German Cancer Aid ), основанная бей Милдред Шеель , Бонн и Берлин .
- Индия: М.К. Бхан и Т.С. Рао, Министерство науки и технологий , Департамент биотехнологии.
- Италия: Мария Кристина Фальвелла Министерство образования, университетов и исследований Италии (MIUR) и Веронский университет Джампаоло Тортора
- Япония: Соноко Ватанабе, RIKEN , Тацухиро Сибата, Национальный онкологический центр Сатико Суэмацу, Рие Цучида и Национальный институт биомедицинских инноваций Хидео Ино.
- Мексика: Институт Мигеля Бетанкура Карлос Слим де ла Салуд
- Саудовская Аравия: Специализированная больница и исследовательский центр имени Султана бин Турки Аль Седайри короля Фейсала
- Южная Корея: Национальный центр геномики рака Хён-Лэ Кима , Национальный проект персонализированной геномной медицины, Министерство здравоохранения и социального обеспечения Южной Кореи
- Испания: Элиас Кампо и Роза Родригес Бернабе, Министерство науки и инноваций Испании
- Великобритания: Майкл Данн и Майкл Стрэттон , Институт Wellcome Trust Sanger
- Великобритания: Дэвид Скотт и Ник Джонс, Cancer Research UK
- США: Жан Клод Зенклюзен и Луи Стаудт, Национальный институт рака, Эрик Грин, и Кэролайн Хаттер, Национальный исследовательский институт генома человека.
Представители со статусом наблюдателя:
- Гонконг: Джозеф Ли, Гонконгский университет науки и технологий
Текущие исследовательские проекты
В каждой стране-участнице основной целью исследования является определенный тип опухоли:
- Австралия: Рак поджелудочной железы - Ductal аденокарциномы и рак яичников - Серозный цистаденокарцинома
- Канада: рак поджелудочной железы - аденокарцинома протоков и рак простаты - аденокарцинома
- Китай: рак желудка - кишечного и диффузного типа
- Европейский Союз / Франция: рак почек - почечно-клеточная карцинома (акцент на подтипе светлоклеточных клеток, но не ограничиваясь им)
- Европейский Союз / Великобритания: рак груди - ER + ve, HER2-ve
- Франция: рак груди - подтип, определенный путем амплификации гена HER2
- Франция: рак печени - гепатоцеллюлярная карцинома (вторичная по отношению к алкоголю и ожирению)
- Германия: педиатрические опухоли головного мозга - Медуллобластома и педиатрический волосовидную астроцитом и злокачественная лимфома и рак простаты
- Индия: рак полости рта - гингивобуккал
- Италия: редкие опухоли поджелудочной железы - энтеропанкреатические эндокринные опухоли и редкие экзокринные опухоли поджелудочной железы.
- Япония: рак печени - гепатоцеллюлярная карцинома (ассоциированная с вирусом)
- Испания: хронический лимфоцитарный лейкоз - ХЛЛ с мутированным и немутантным IgVH
- Соединенное Королевство: рак груди - тройной отрицательный / дольчатый / другое
- США: легких плоскоклеточный рак , почечная папиллярный рак , ясно карцинома почки , карциномы протоков молочной железы , рак почки , рак шейки матки (плоскоклеточный), аденокарциномы толстой кишки , желудка аденокарциномы , ректальный рак , гепатоцеллюлярной карциномы головы и шеи (устно) плоскоклеточный клеточный рак, рак щитовидной железы , мочевой пузырь уротелиальная карциномы - nonpapillary, маточный корпус ( рак эндометрия ), протоки поджелудочной железы аденокарцинома , острый миелоидный лейкоз , аденокарцинома предстательной железы , аденокарцинома легкого , кожная меланома , молочная железа очаговой карциномы и более низкий класс глиома , карциномы пищевода , яичники серозна цистаденокарцинома , плоскоклеточный рак легкого , карцинома коры надпочечников , диффузная крупноклеточная лимфома , параганглиома и феохромоцитома , холангиокарцинома , карциносаркома матки , увеальная меланома , тимома , саркома , мезотелиома и рак половых клеток яичек.
Будущая работа
ICGCmed
В контексте масштабных международных усилий по секвенированию и в ожидании новой эры точной медицины Международный консорциум генома рака для медицины (ICGCmed) свяжет множество уже собранных геномных данных, а также новые геномные данные, которые будут генерироваться, с клиническая информация и информация о здоровье, включая образ жизни, анамнез пациента, данные диагностики рака, а также ответ на лечение и выживаемость после лечения по всему спектру рака. Используя эти крупномасштабные интегрированные данные, исследователи, ученые, политики и клиницисты смогут работать с пациентами, поставщиками медицинских услуг и другими лицами для разработки превентивных стратегий, маркеров для раннего обнаружения заболеваний, более конкретных критериев и методов диагностики и прогнозов, а также вмешательства, основанные на сопоставлении молекулярного подтипа заболевания пациента с наиболее эффективными комбинациями терапий.
Это приведет к открытию новых терапевтических целей, более точным определениям заболеваний и улучшенным стратегиям предотвращения лекарственной устойчивости.