Mycobacterium africanum -Mycobacterium africanum
| Mycobacterium africanum | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: |
« Актинобактерии »
|
| Класс: | |
| Порядок: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: |
М. africanum
|
| Биномиальное имя | |
|
Mycobacterium africanum Castets et al. 1969, ATCC 25420
|
|
Mycobacterium africanum - это вид Mycobacterium, который чаще всего встречается в странах Западной Африки, где, по оценкам, вызывает до 40% случаев туберкулеза легких. Симптомы инфекции напоминают симптомы M. tuberculosis .
Он является членом комплекса Mycobacterium tuberculosis .
Таксономия
В комплексе Mycobacterium tuberculosis (MTBC) есть семь основных линий , из которых линии 5 и 6 классифицируются как Mycobacterium africanum . Линия 5 MTBC представляет собой M. africanum типа 1, западноафриканский 1 (MAF1) и классифицируется на основе характерной делеции региона дифференцировки (RD) 711. MAF1 обычно встречается в районе Гвинейского залива. Линия 6 MTBC также известна как M. africanum типа 1, западноафриканская 2 (MAF2) и классифицируется на основе делеции RD702. MAF2 распространен в Западной Африке. M. africanum типа 2, восточноафриканский, ранее был признан штаммом Mycobacterium africanum ; недавно он был реклассифицирован как генотип Mycobacterium tuberculosis «Уганда» в подлинии линии MTBC 4.
История
M. africanum был впервые описан как подвид в рамках MTBC с фенотипическими характеристиками, промежуточными между M. tuberculosis и M. bovis , на основе биохимического тестирования Castets в 1968 году. Ранний генетический анализ показал, что он отличался от M. tuberculosis из-за геномная делеция RD9 и отличная нуклеотидная последовательность GyrB , отличная от M. bovis из-за интактных RD12 и RD4.
Микробиология
M. africanum выращивают в среде, содержащей пируват, в условиях низкого содержания кислорода и образуют характерные «дисгонические» колонии. В отличие от M. tuberculosis , M. africanum проявляет каталазную активность, является нитрат-отрицательным и чувствителен к гидразиду тиопен-2-карбоновой кислоты (TCH) и пиразинамиду (PZA). M. africanum также растет медленнее, чем M. tuberculosis , для образования колоний обычно требуется 10 недель, а не 3–4 для M. tuberculosis .
Эпидемиология
M. africanum чаще всего встречается в странах Западной Африки. Это инфекция только у людей, которая передается воздушно-капельным путем от людей с открытыми случаями заболевания.
Не совсем понятно, почему распространение M. africanum ограничено Западной Африкой, и только спорадические случаи обнаруживаются в других регионах. Филогенетические данные показывают, что M. africanum на ранней стадии разветвился от современных линий Mtb в Америке, Европе и Азии. Некоторые исследования показывают, что M. africanum адаптирован к западноафриканскому населению. M. africanum, возможно, проигрывает другим линиям Mtb в других регионах; однако генетические исследования не обнаружили разницы в количестве генов вирулентности или генетическом разнообразии между M. tuberculosis и M. africanum . Животных- резервуаров для Mycobacterium africanum выявлено не было, несмотря на то, что были обнаружены различные дикие животные.
Он имеет такую же степень инфекционности, что и обычный микроорганизм M. tuberculosis, но с меньшей вероятностью прогрессирует до клинического заболевания у иммунокомпетентного индивидуума. Однако M. africanum с большей вероятностью перейдет от инфекции к заболеванию у ВИЧ-положительного пациента. В странах, где M. africanum является эндемичным, он представляет собой важную оппортунистическую инфекцию на более поздних стадиях заболевания ВИЧ.
Патогенез
Не совсем понятно, как генетические различия между M. africanum и M. tuberculosis приводят к более низкой патогенности первых. Однако известно, что область различия 9 (RD9) отсутствует у M. africanum, но присутствует у M. tuberculosis .
M. africanum также имеет заметные различия в катаболизме и метаболизме липидов. Кроме того, у M. africanum нарушаются пути вирулентности, такие как регулон dosR / Rv0081 или регуляция ESAT-6 .
Уход
Из-за схожих симптомов и различных условий роста Mycobacterium tuberculosis и africanum методы культивирования ненадежны для диагностики. Генотипирование на основе молекулярной биологии улучшило идентификацию. В частности, «сполиготипирование» или «типирование спейсерного олигонуклеотида» представляет собой основанный на быстрой полимеразной цепной реакции метод генотипирования штаммов в MTBC. Недавно были разработаны экспресс-тесты бокового кровотока на основе антигена mpt64, обнаруженного у всех членов MTBC.
M. africanum имеет более низкую скорость прогрессирования от латентного периода к активной болезни, чем M. tuberculosis . Лечение M. africanum tuberculosis осуществляется по той же схеме, что и туберкулез, вызываемый M. tuberculosis . Общая скорость излечения аналогична, но поскольку больше пациентов с M. africanum , вероятно, будут ВИЧ-положительными, у них может быть более высокая смертность от других заболеваний, связанных с ВИЧ.
Тип штамма
ATCC 25420 = CIP 105147
использованная литература
Библиография
- Скерман, ВБД; McGowan, V .; Sneath, PHA (январь 1980 г.). «Утвержденные списки бактериальных названий» . Int. J. Syst. Бактериол . 30 (1): 225–420. DOI : 10.1099 / 00207713-30-1-225 .