NS2 (HCV) - NS2 (HCV)
Неструктурные белки 2 ( NS2 ) представляет собой вирусный белок найден в вирусе гепатит С . Он также продуцируется вирусами гриппа и также известен как ядерный экспортный белок (NEP) .
Роль вируса гепатита С
NS2 является одним из семи неструктурных белков ВГС, каждый из которых кодируется рядом с карбокси-концом РНК вируса с положительной цепью. После трансляции он составляет 217 аминокислот в длину и имеет молекулярную массу примерно 23 кДа. NS2 обладает гидрофобным аминоконцевым субдоменом, а также карбоксиконцевым цитоплазматическим доменом, причем аминоконцевой субдомен содержит до трех предполагаемых трансмембранных сегментов.
Белки NS2 посттрансляционно процессируются кодируемой ВПЧ цистеиновой протеазой NS2-3, которая образована остатками 94–217 самого NS2, а также остатками 1–181 неструктурного белка 3 (NS3). Автопротеаза NS2-3 действует путем однократного расщепления между стыком NS2 и NS3. Хотя сам белок NS2 не нужен для репликации вируса HCV (как продемонстрировали репликоны HPV, которые были способны к саморепликации после удаления всей кодирующей области C к NS2), это расщепление соединения NS2 / NS3 является критическим.
Несмотря на то, что NS2 незаменим в репликации HCV, он действительно играет важную роль в производстве новых частиц HCV. Многочисленные исследования показали, что полная последовательность РНК NS2 (и, следовательно, белок) необходима для сборки вируса. Хотя до некоторой степени неясно, почему это так, одна группа продемонстрировала, что продукция вирусных частиц в химерах HPV была наиболее эффективной, когда химерные слияния проводились непосредственно после первого трансмембранного домена NS2. Это открытие подразумевает, что первый трансмембранный сегмент гидрофобного аминоконцевого субдомена NS2 физически взаимодействует с вышележащими структурными компонентами последовательности HPV. Его структура действительно высококонсервативна между генотипами HCV, с гибкой спиралью в остатках 3-11 и альфа-спиралью в остатках 12-21. Следующее значение состоит в том, что карбокси-концевой домен, который также является домом для протеасомной области NS2, не важен для образования частиц. Эта теория подтверждается данными о том, что мутации в области протеазы NS2 не влияют на продукцию вируса.
Дополнительные исследования показывают, что SN2 участвует в производстве частиц ВПЧ. Было определено, что замена одного высококонсервативного остатка NS2, Ser-168, либо на аланин, либо на глицин приводит к нарушению продукции вируса, но не к нарушению репликации РНК. Нарушение или устранение образования частиц определяли по количеству инфекционных частиц HPV, высвобождаемых трансфицированными клетками после мутации генома. Этот результат дополнительно демонстрирует, что NS2 имеет решающее значение для сборки вируса, но не репликации вирусной РНК (на которую, однако, влияет расщепление соединения NS2 / NS3, как обсуждалось ранее). Кроме того, в том же исследовании было высказано предположение, что мутация Ser-168 влияет на сборку вируса с точки зрения высвобождения: собранные мутанты NS2 не могли покинуть клетку (и, таким образом, не были инфекционными), предполагая, что важность NS2 заключается в очень поздних стадиях сборки. .
Роль в подавлении апоптоза
NS2 - ингибитор апоптоза клеток печени . Вирусный белок взаимодействует с CIDE-B, проапоптотическим белком, специфичным для печени, чей карбоксиконцевой домен киллинга вызывает активность клеточной гибели. Специфичность связывания достаточно высока, чтобы противодействовать индуцированному CIDE-B высвобождению митохондриального цитохрома c , что продемонстрировано одиночными делеционными мутациями, которые приводят к потере интерференции. Эта активность была интерпретирована как важная стратегия выживания HCV в клетках-хозяевах.