SDHA - SDHA

SDHA
SuccDeh.svg
Идентификаторы
Псевдонимы SDHA , CMD1GG, FP, PGL5, SDH1, SDH2, SDHF, субъединица A флавопротеина комплекса сукцинатдегидрогеназы, MC2DN1, NDAXOA
Внешние идентификаторы OMIM : 600857 MGI : 1914195 HomoloGene : 3073 GeneCards : SDHA
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001294332
NM_004168
NM_001330758

NM_023281

RefSeq (белок)

NP_001281261
NP_001317687
NP_004159

NP_075770

Расположение (UCSC) Chr 5: 0,22 - 0,26 Мб Chr 13: 74,32 - 74,35 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сукцинатдегидрогеназы комплекс, субъединица А, флавопротеида вариант представляет собой белок , который у человека кодируется SDHA гена . Этот ген кодирует главную каталитическую субъединицу сукцинат-убихинон оксидоредуктазы, комплекса дыхательной цепи митохондрий. Комплекс состоит из четырех субъединиц, кодируемых ядром, и локализован во внутренней мембране митохондрий. SDHA содержит сайт связывания FAD, где сукцинат депротонируется и превращается в фумарат . Мутации в этом гене были связаны с формой дефицита митохондриальной дыхательной цепи, известной как синдром Ли. Псевдоген был идентифицирован на хромосоме 3q29. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.

Состав

Ген SDHA расположен на плече p хромосомы 5 в локусе 15 и состоит из 16 экзонов. Белок SDHA, кодируемый этим геном, имеет длину 664 аминокислоты и вес 72,7 кДа.

Белок SDHA имеет четыре субдомена, включая кэпирующий домен, спиральный домен, С-концевой домен и, в первую очередь, β-стволовый FAD-связывающий домен на N-конце . Следовательно, SDHA является флавопротеином (Fp) из-за простетической группы флавинадениндинуклеотида ( FAD ). Кристаллическая структура предполагает, что FAD ковалентно связан с остатком гистидина (His99) и дополнительно координируется водородными связями с рядом других аминокислотных остатков в FAD-связывающем домене. Таким образом, FAD, который является производным рибофлавина ( витамин B 2 ), является важным кофактором для функции SDHA и всего комплекса II.

Функция

SuccDeh.svg

Комплекс SDH расположен на внутренней мембране митохондрий и участвует как в цикле лимонной кислоты, так и в дыхательной цепи . Сукцинатдегидрогеназы (СЙ) белковый комплекс катализирует окисление сукцината (сукцинат + убихинон => фумарат + убихинол). Электроны, удаленные из сукцината, переносятся на SDHA, переносятся через SDHB через кластеры серы железа к субъединицам SDHC / SDHD на гидрофобном конце комплекса, закрепленного в митохондриальной мембране.

Первоначально SDHA окисляет сукцинат посредством депротонирования в сайте связывания FAD , образуя FADH 2 и оставляя фумарат , слабо связанный с активным центром, свободным для выхода из белка. Электроны выходят из сукцинатного туннеля вдоль реле [Fe-S] в субъединице SDHB, пока не достигнут кластера [3Fe-4S] железо-сера . Затем электроны передаются ожидающей молекуле убихинона в активном центре Q-пула в димере SDHC / SDHD . Карбонильный кислород O1 убихинона ориентирован в активном центре (изображение 4) за счет взаимодействия водородных связей с Tyr83 SDHD . Присутствие электронов в кластере железа и серы [3Fe-4S] вызывает движение убихинона во вторую ориентацию. Это способствует взаимодействию второй водородной связи между карбонильной группой O4 убихинона и Ser27 SDHC . После первой стадии восстановления одним электроном образуется радикальная разновидность семихинона . Второй электрон прибывает из кластера [3Fe-4S], чтобы обеспечить полное восстановление убихинона до убихинола .

SDHA действует как промежуточное звено в основном действии фермента SDH:

  1. SDHA превращает сукцинат в фумарат в рамках цикла лимонной кислоты . Эта реакция также превращает FAD в FADH 2 .
  2. Электроны из FADH 2 переносятся на кластеры железа субъединицы SDHB [2Fe-2S], [4Fe-4S], [3Fe-4S]. Эта функция является частью дыхательной цепи.
  3. Наконец электроны переносятся на убихинон (Q) через бассейн SDHC / SDHD субъединиц.

Клиническое значение

Биаллельные мутации (т.е. обе копии гена мутированы) были описаны при синдроме Ли , прогрессирующем заболевании головного мозга, которое обычно проявляется в младенчестве или раннем детстве. У пораженных детей могут наблюдаться рвота, судороги, задержка развития, мышечная слабость и проблемы с движением. У людей с этим заболеванием также могут возникать сердечные заболевания, проблемы с почками и затрудненное дыхание. Мутации гена SDHA, ответственные за синдром Ли, изменяют отдельные аминокислоты в белке SDHA, такие как мутация G555E, наблюдаемая у нескольких пациентов, или приводят к аномально короткому белку. Эти генетические изменения нарушают активность фермента SDH, нарушая способность митохондрий вырабатывать энергию. Однако неизвестно, как мутации в гене SDHA связаны с особенностями синдрома Ли.

SDHA является геном-супрессором опухоли, и гетерозиготные носители имеют повышенный риск параганглиом, а также феохромоцитом и рака почек. Управление рисками для гетерозиготных носителей мутации SDHA может включать ежегодные анализы мочи на метанефрины и 3-метокситирамин и МРТ.

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.

[[Файл:
TCACycle_WP78Go to article Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to WikiPathways Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
TCACycle_WP78Go to article Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to WikiPathways Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article
| alt = TCACycle_WP78 править ]]
TCACycle_WP78 править

использованная литература

дальнейшее чтение