HLA-DQB1 - HLA-DQB1

HLA-DQB1
1UVQ.png
Доступные конструкции
PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы HLA-DQB1 , CELIAC1, HLA-DQB, IDDM1, главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ beta 1, HLA-DRB1
Внешние идентификаторы OMIM: 604305 MGI: 103070 HomoloGene: 1603 Генные карты : HLA-DQB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr. Хромосома 6 (человек)
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение HLA-DQB1
Геномное расположение HLA-DQB1
Группа 6п21.32 Начало 32 659 467 п.н.
Конец 32 668 383 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE HLA-DQB1 209823 x в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
Виды Человек Мышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_002123
NM_001243961
NM_001243962

NM_207105

RefSeq (белок)

NP_001230890
NP_001230891
NP_002114

NP_996988

Расположение (UCSC) Chr 6: 32,66 - 32,67 Мб Chr 17: 34,26 - 34,27 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Главный комплекс гистосовместимости, класс II, DQ beta 1 , также известный как HLA-DQB1 , является геном человека и также обозначает генетический локус , содержащий этот ген. Белок , кодируемый этим геном является одним из двух белков, которые необходимы для формирования DQ гетеродимер , клеточной поверхности рецептора важное значение для функции системы иммунитета .

Функция

HLA-DQB1 принадлежит к паралогам бета-цепей HLA класса II . Эта молекула класса II представляет собой гетеродимер, состоящий из альфа (DQA) и бета цепи (DQB), которые закреплены в мембране. Он играет центральную роль в иммунной системе, представляя пептиды, полученные из внеклеточных белков. Молекулы класса II экспрессируются в антигенпрезентирующих клетках (APC: B-лимфоциты, дендритные клетки, макрофаги).

Структура гена и полиморфизмы

Бета-цепь составляет приблизительно 26-28 кДа и содержит 6 экзонов . Первый экзон кодирует лидерный пептид, экзоны 2 и 3 кодируют два внеклеточных белковых домена , экзон 4 кодирует трансмембранный домен, а экзон 5 кодирует цитоплазматический хвост. Внутри молекулы DQ как альфа-цепь, так и бета-цепь содержат полиморфизмы, определяющие специфичность связывания пептида, что приводит к образованию до 4 различных молекул. Типирование этих полиморфизмов обычно выполняется при трансплантации костного мозга .

Ассоциация болезней

Диабет

Несколько аллелей HLA-DQB1 связаны с повышенным риском развития диабета 1 типа . Этот локус также имеет генетическое название IDDM1, так как это самый высокий генетический риск диабета 1 типа. Опять же, аллели DQB1 * 0201 и DQB1 * 0302, особенно фенотип DQB1 * 0201 / * 0302, имеют высокий риск позднего начала диабета 1 типа. Риск частично разделяется с локусом HLA-DR (серотипы DR3 и DR4).

Глютеновая болезнь

Celiac1 - это генетическое название DQB1, HLA DQB1 * 0201, * 0202 и * 0302 кодируют гены, которые опосредуют аутоиммунную целиакию . Гомозиготы DQB1 * 0201 имеют более высокий риск развития целиакии по сравнению с любым другим генетическим локусом.

Рассеянный склероз

Некоторые аллели HLA-DQB1 также связаны с умеренно повышенным риском рассеянного склероза .

Нарколепсия

Другие аллели HLA-DQB1 связаны с предрасположенностью к нарколепсии , в частности HLA-DQB1 * 0602, который переносится более чем 90% пациентов с нарколепсией-катаплексией.

Аллели

Аллели HLA-DQB1
Серотип Аллель DQB1
DQ2 * 0201
* 0202
* 0203
DQ4 * 0401
* 0402
DQ5 * 0501
* 0502
* 0503
* 0504
DQ6 * 0601
* 0602
* 0603
* 0604
* 0605
* 0609
DQ7 * 0301
* 0304
DQ8 * 0302
* 0305
DQ9 * 0303

Смотрите также

Рекомендации

внешние ссылки

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P01920 (антиген гистосовместимости HLA класса II, цепь DQ beta 1) в PDBe-KB .