Домен PAN - PAN domain

PAN_1
PDB 1hky EBI.jpg
состав раствора модуля поддона из eimeria tenella
Идентификаторы
Условное обозначение PAN_1
Pfam PF00024
Клан пфам CL0168
ИнтерПро IPR003014
PROSITE PDOC00376
SCOP2 1bht / SCOPe / SUPFAM

Домены PAN обладают значительной функциональной универсальностью, выполняя разнообразные биологические роли, опосредуя взаимодействия белок-белок и белок-углевод . Эти домены содержат структуру, похожую на шпильку, аналогичную структуре узловатых, но с другим рисунком дисульфидных связей .

Было показано, что N-концевые домены членов семейства факторов роста плазминогена / гепатоцитов , яблочные домены семейства прекалликреина / фактора свертывания крови XI плазмы и домены различных белков нематод принадлежат одному и тому же суперсемейству модулей - модулю PAN. . Домен PAN содержит консервативное ядро из трех дисульфидных мостиков. У некоторых членов семейства есть дополнительный четвертый дисульфидный мостик, который связывает N- и C-концы домена.

Домен яблока, как и другие примеры домена PAN, состоит из 7 β-нитей, которые складываются в изогнутый антипараллельный лист, удерживающий α-спираль . Две дисульфидные связи фиксируют спираль на центральных цепях β4 и β5, тогда как третья соединяет N- и C-концы домена. В яблочном домене петля β4-β5 и петля кроссовера β5-β6 создают небольшой карман на противоположной стороне листа от α-спирали.

В природном плазминогене домен PAN связан с пятью крингл- доменами. Взаимодействия между доменом PAN и кринглами играют решающую роль в стабилизации четвертичного комплекса природного плазминогена;

Рекомендации

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR003014