Пегивирус -Pegivirus
Пегивирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Kitrinoviricota |
Класс: | Flasuviricetes |
Порядок: | Амарилловиралес |
Семья: | Flaviviridae |
Род: | Пегивирус |
Разновидность | |
Пегивирус A |
Пегивирус - это одобренное название для рода вирусов с одноцепочечной РНК в семействе Flaviviridae . Название является производным один: «П» означает «постоянная» и «г» является ссылкой на гепатит G , бывшее имя C вида.
Таксономия
Одиннадцать названных видов относятся к роду Pegivirus . Изоляты, принадлежащие к виду Pegivirus C, являются монофилетическими и демонстрируют <50% расхождения нуклеотидных (55% аминокислотных) последовательностей между выровненными последовательностями полипротеина друг от друга. Однако все они отличаются более чем на 50% нуклеотидного (> 55% аминокислотного) расхождения от других представителей этого рода. Пегивирусы, отнесенные к этому виду ( Pegivirus A ), происходят от приматов-хозяев (людей, шимпанзе и нескольких видов обезьян Нового Света). Последовательность U22303 была отнесена к типу данного вида, поскольку это был первый пегивирус, описанный для этого вида. Терминология для описания вирусов с разными хозяевами не одобрена Международным комитетом по таксономии вирусов; однако вирусы пегивируса А были названы HPgV для пегивируса человека, SPgV для пегивирусов обезьян нового мира и SPgVcpz для обезьяньего вируса шимпанзе.
А второй вид в пределах pegiviruses называется Pegivirus B . В предложение по названию был включен только один вирус - полный геном вируса, обнаруженного у летучих мышей вида Pteropus giganteus . Эта последовательность отличается более чем на 50% нуклеотидной (> 55% аминокислотной) дивергенцией от всех предполагаемых представителей производных от приматов видов пегивируса С, которые происходят от видов-приматов-хозяев (люди, шимпанзе и несколько видов обезьян Нового Света). Последовательность GU566734 была отнесена к типу данного вида, поскольку это был первый пегивирус, описанный для этого вида.
Использование технологий глубокого секвенирования позволило идентифицировать дополнительные вирусы, которые отличаются от видов пегивируса В более чем на 50% нуклеотидов (> 55% аминокислот) и пегивируса С у грызунов, лошадей и у различных видов летучих мышей, а также у обезьян Старого Света и количества Количество видов пегивирусов увеличено до одиннадцати.
Пересмотренная таксономия
Виды, известные в 2016 году, с тех пор были разделены на 11 видов - Pegivirus A – K.
- Пегивирус A включает вирус GBV-A
- Пегивирус B включает вирус GBV-D
- Пегивирус C включает вирус GBV-C
- Пегивирус D включает вирус, связанный с болезнью Тейлера.
- Пегивирус Е включает вирус Пегивирус лошадей.
- Pegivirus F включает вирус Bat pegivirus.
- Pegivirus G включает вирус Bat pegivirus.
- Пегивирус Н включает вирус Пегивирус человека 2
- Pegivirus I включает вирус Bat pegivirus
- Пегивирус J включает вирус пегивирус грызунов.
- Пегивирус К включает вирус свиной пегивирус.
История
- В 1967 году сообщалось , что экспериментальная инокуляция сыворотки 34-летнего хирурга (Джордж Баркер) с острым гепатитом на тамарины привела к гепатиту .
- В 1995 году два новых члена семейства Flaviviridae (GBV-A и GBV-B) были идентифицированы у тамаринов, у которых развился гепатит после инокуляции 11-м пассажем GB. Позже был обнаружен ряд вариантов GBV-A у пойманных диких обезьян Нового Света.
- Впоследствии, в 1995 году, был идентифицирован человеческий вирус [GBV-C или вирус гепатита G (HGV)].
- Более отдаленно родственный вирус (GBV-D) был позже обнаружен у летучих мышей ( Pteropus giganteus ).
- Род Pegivirus был предложен в 2011 году. GBV-B был отнесен к роду Hepacivirus , тогда как GBV-A вместе с GBV-C были отнесены к новому роду Pegivirus .
- В 2016 году род Pegivirus был разделен на 11 видов - пегивирусы A – K с GBV-C, отнесенными к видам пегивируса C.
Примечания
- Болезнь Тейлера - форма гепатита лошадей - также, по-видимому, вызывается пегивирусом - вирусом, ассоциированным с болезнью Тейлера .
- Гепегивирус человека 1 или пегивирус человека 2 (HPgV2) - это вирус, выделенный у 2 больных гемофилией, которым повторно переливали кровь, и у двух пациентов, которым переливали кровь. Этот вирус, по-видимому, принадлежит к новой кладе пегивирусов.
- Родственный вирус был изолирован от изящной кошачьей акулы ( Proscyllium habereri ).
- Пегивирусы человека, по-видимому, связаны с нечеловеческими видами приматов.
- В 2019 году исследователи описали пегивирус-1 человека как «причину энцефалита человека ( лейкоэнцефалита )»; а также передаются половым путем и от матери ребенку .
- Другой вирус - пегавирус грызунов - был выделен от белозубой вудрысы ( Neotoma albigula ).
- Пегивирус (пегивирус лошадей) также был выделен от лошади.