TAF7l - TAF7l
ТАТА-бокс - связывающий белок , связанный фактор 7, как также известный как CT40 является белком , который в организме человека кодируется TAF7l гена . Это близкий гомолог гену TAF7 , хотя его функция может отличаться. В настоящее время об этом гене известно немного. Первоначально было продемонстрировано, что это ген, специфичный для семенников, на основе экспериментов с ОТ-ПЦР на тканевых экстрактах, однако теперь он был обнаружен в белой и коричневой жировой ткани, а также при некоторых типах рака.
Функция
Функция в формировании жировой ткани
Исследования, проведенные на животных с нокаутом, показали, что Taf7l вносит важный вклад в определение судьбы мезенхимальных стволовых клеток. Важно отметить, что Zhou et al. обнаружили, что у животных с Taf7L - / - (нокаутом по Taf7L) уменьшаются жировые подушечки, которые инфильтрируются тканью скелетных мышц. Используя RNA-seq и Gene Ontology Enrichment (GO), эта же группа обнаружила увеличение количества терминов GO (и, следовательно, категорий генов), которые были вовлечены в развитие скелета и мышц. В сочетании с данными in vitro выясняется, что Taf7l способен инициировать производство бурого жира (так называемого здорового жира). Кроме того, они обнаружили, что вместе с PPARgamma, Taf7l, вероятно, может регулировать связывание комплекса TFIID / РНК-полимераза II (RNAP II). В частности, присутствие Taf7l может изменять образование петель хроматина и, таким образом, ассоциацию дистальных энхансерных последовательностей с промоторами BAT-специфических генов, такими как Cidea и Scd1.
Функция при раке
Недавно было обнаружено , что мутация сдвига рамки считывания присутствует у 3 пациентов с колоректальным раком . В частности, было обнаружено, что в области мононуклеотидного повтора поли-A в экзоне 6 Taf7l отсутствует один нуклеотид (делеционная мутация), что приводит к мутации со сдвигом рамки считывания. Кроме того, было обнаружено, что он снижается в 58% случаев острого миелогенного лейкоза (AML).
Функция в сперматогенезе: взаимность с TAF7
Большая часть первоначальной работы была проведена Pointud et al. Они обнаружили, что Taf7l выполняет двойную функцию во время сперматогенеза. В сперматоцитах на ранней стадии, например, в первичных сперматоцитах (все еще диплоидных на данный момент), TAF7l находится в цитоплазме, а комплекс TATA-связывающего белка (TBP) расположен в ядре. Затем TAF71 медленно переходит в ядро во время средней стадии пахитеновой клетки, где также наблюдается резкое увеличение экспрессии белка ТВР в ядре. Кроме того, существует обратная взаимосвязь с экспрессией TAF7 : в отличие от TAF7l, TAF7 на ранних стадиях экспрессируется в ядре и, таким образом, отделяется от TAF71. Затем, на более поздних стадиях, когда TAF7l переходит в ядро, что происходит примерно в то время, когда происходит соматический (диплоидный) переход в зародышевую клетку (гаплоидный), TAF7 резко снижается. Это может указывать на то, что TAF7l играет важную роль в регуляции TFIID во время развития сперматозоидов. Pointud et al. (2003) предполагают, что TAF7l может «закладывать» определенные гены для экспрессии или репрессии в гаплоидных сперматоцитах.
Функция во время транскрипции
Окончательная роль TAF7l во время транскрипции все еще остается неясной. Скрининг дрожжей-2-гибридов выявил, что TAF71 сильно взаимодействует с TAF1 точно в той же области (аминокислоты 1170-1226 TAF1), с которой TAF7 связывается и инактивирует функцию ацетилтрансферазы (AT) TAF1. Таким образом, вероятно, что TAF71 играет роль, аналогичную TAF7, в ингибировании TAF1 и, таким образом, активности комплекса TFIID. TAF7l локализуется в другом компартменте относительно TBP во время раннего сперматогенеза, подразумевая, что TBP-независимая функция, которая требует дальнейшего изучения. Кроме того, Chromosome Conformation Capture идентифицировал роль TAF7 в непосредственном опосредовании связывания энхансерных элементов с промоторными последовательностями, с которыми связывается TFIID. Это также предполагает, что TAF7l заменяет функцию TAF7, поскольку TAF7 также, как было показано, связывается и регулирует экспрессию гена (например, витамина D3 или гормона щитовидной железы) промотор-специфическим образом.
- GS Gupta (2 июля 2006 г.). Протеомика сперматогенеза . Springer Science & Business Media. п. 327. ISBN. 9780387276557.