Трансферно-матричный метод - Transfer-matrix method
В статистической механике метод трансфер-матрицы - это математический прием, который используется для записи статистической суммы в более простую форму. Он был введен в 1941 году Гансом Крамерсом и Грегори Ванье . Во многих моделях одномерной решетки статистическая сумма сначала записывается как n- кратное суммирование по каждому возможному микросостоянию , а также содержит дополнительное суммирование вклада каждого компонента в энергию системы в каждом микросостоянии.
Обзор
Модели более высокой размерности содержат еще больше суммирований. Для систем с более чем несколькими частицами такие выражения могут быстро стать слишком сложными для непосредственной обработки даже с помощью компьютера.
Вместо этого функцию распределения можно переписать аналогичным образом. Основная идея состоит в том, чтобы записать функцию распределения в виде
где v 0 и v N + 1 являются векторами размерности р и р × р матриц W к являются так называемые матрицы переноса . В некоторых случаях, особенно для систем с периодическими граничными условиями, статистическая сумма может быть записана проще как
где «tr» обозначает след матрицы . В любом случае статистическая сумма может быть решена точно с использованием собственного анализа . Если все матрицы являются одной и той же матрицей W , статистическая сумма может быть аппроксимирована как N- я степень наибольшего собственного значения W , поскольку след представляет собой сумму собственных значений, а собственные значения произведения двух диагональных матриц равны произведению их индивидуальных собственных значений.
Метод трансфер-матрицы используется, когда вся система может быть разбита на последовательность подсистем, которые взаимодействуют только со смежными подсистемами. Например, трехмерная кубическая решетка спинов в модели Изинга может быть разложена на последовательность двумерных плоских решеток спинов, которые взаимодействуют только смежно. Размерности р из р × р передаточной матрицы равно числу состояний подсистема может иметь; сама матрица передачи W k кодирует статистический вес, связанный с конкретным состоянием подсистемы k - 1, находящимся рядом с другим состоянием подсистемы k .
В качестве примера наблюдаемых, которые могут быть вычислены с помощью этого метода, вероятность возникновения определенного состояния в позиции x определяется как:
Где матрица проекции состояния , имеющая элементы
Методы трансфер-матрицы было критическим для многих точных решений проблем статистической механики , в том числе Зимм-Брэгга и моделей Lifson-Roig в переходе спираль-клубок , передача матричные модели для связывания белок-ДНК , а также известного точного решения в двумерной модели Изинга по Онзагер .
Смотрите также
использованная литература
Примечания
- Родни Дж. Бакстер (1982). Точно решаемые модели в статистической механике . Академическая пресса. ISBN 978-0-12-083182-1.
- Тейф В.Б. (2007). «Общий формализм матрицы переноса для расчета связывания ДНК-белок-лекарственное средство в регуляции генов» . Nucleic Acids Res . 35 (11): e80. DOI : 10.1093 / NAR / gkm268 . PMC 1920 246 . PMID 17526526 .
- Ефремов А.К., Винарди Р.С., Ян Дж. (2016). «Трансфер-матричные расчеты микромеханики полимеров ДНК в условиях растяжения и крутящего момента» . Phys. Rev. E . 94 (3): 032404. Bibcode : 2016PhRvE..94c2404E . DOI : 10.1103 / PhysRevE.94.032404 . PMID 27739846 .
- Ефремов А.К., Ян Дж. (2018). «Трансфер-матричные расчеты влияния ограничений натяжения и крутящего момента на ДНК-белковые взаимодействия» . Nucleic Acids Res . 46 (13): 6504–6527. DOI : 10.1093 / NAR / gky478 . PMC 6061897 . PMID 29878241 .