Цистром - Cistrome
Проще говоря, цистром относится к набору регуляторных элементов набора генов, включая сайты связывания факторов транскрипции и модификации гистонов. Более конкретно, «набор цис-действующих мишеней транс-действующего фактора в масштабе всего генома, также известный как локализация сайтов связывания факторов транскрипции или модификаций гистонов in vivo в масштабе всего генома ». Термин cistrome является портманто из cistr (от цистрона ) + Ома (от генома ). Термин цистром был придуман исследователями из Института рака Дана-Фарбер и Гарвардской медицинской школы .
Такие технологии, как иммунопреципитация хроматина в сочетании с анализом микроматрицы « ChIP-on-chip » или с массовым параллельным секвенированием ДНК « ChIP-Seq », значительно облегчили определение цистрома факторов транскрипции и других белков, связанных с хроматином .
Рекомендации
дальнейшее чтение
- Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M (март 2008 г.). «FoxA1 переводит эпигенетические сигнатуры в транскрипцию, специфичную для клонов, управляемую энхансером» . Cell . 132 (6): 958–70. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.01.018 . PMC 2323438 . PMID 18358809 .
- Lupien M, Brown M (июнь 2009 г.). «Цистромики гормонозависимого рака» . Endocr. Relat. Рак . 16 (2): 381–9. DOI : 10.1677 / ERC-09-0038 . PMID 19369485 .