MMP9 - MMP9

MMP9
Белок MMP9 PDB 1itv.png
Доступные конструкции
PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы MMP9 , CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, коллагеназа типа IV 92 кДа, желатиназа 92 кДа, желатиназа B, матричная металлопептидаза 9
Внешние идентификаторы OMIM : 120361 MGI : 97011 HomoloGene : 3659 GeneCards : MMP9
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004994

NM_013599

RefSeq (белок)

NP_004985

NP_038627

Расположение (UCSC) Chr 20: 46.01 - 46.02 Мб Chr 2: 164.94 - 164.96 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Матрица metallopeptidase 9 (ММП-9), также известный как 92 кДа типа IV коллагеназы , 92 кДа , желатиназа или желатиназа B (GELB), является matrixin, класс ферментов , которые принадлежат к цинка - металлопротеиназы семьи , участвующие в деградации внеклеточный матрикс . У человека ген MMP9 кодирует сигнальный пептид , пропептид , каталитический домен со вставленными тремя повторами домена фибронектина типа II, за которыми следует С-концевой гемопексиноподобный домен .

Функция

Белки семейства матриксных металлопротеиназ (ММП) участвуют в разрушении внеклеточного матрикса в нормальных физиологических процессах, таких как эмбриональное развитие , размножение , ангиогенез , развитие костей , заживление ран , миграция клеток, обучение и память , а также в патологических процессах. , например, артрит , внутримозговое кровоизлияние и метастазы . Большинство ММП секретируются в виде неактивных пропротеинов, которые активируются при расщеплении внеклеточными протеиназами . Фермент, кодируемый этим геном, разрушает коллагены IV и V типов и другие белки внеклеточного матрикса. Исследования на макаках-резус предполагают, что фермент участвует в индуцированной IL-8 мобилизации гемопоэтических клеток-предшественников из костного мозга, а исследования на мышах предполагают его роль в ремоделировании ткани, связанной с опухолью.

Тромбоспондины , белки межпозвоночного диска, регулируют взаимодействие с матриксными металлопротеиназами (ММП) 2 и 9, которые являются ключевыми эффекторами ремоделирования ВКМ .

Действие нейтрофилов

MMP9, наряду с эластазой, по-видимому, является регуляторным фактором миграции нейтрофилов через базальную мембрану .

MMP9 выполняет несколько важных функций в рамках действия нейтрофилов, таких как разрушение внеклеточного матрикса, активация IL-1β и расщепление нескольких хемокинов . В модели на мышах дефицит MMP9 привел к устойчивости к эндотоксиновому шоку, что позволяет предположить, что MMP9 важен при сепсисе .

Ангиогенез

MMP9 может играть важную роль в ангиогенезе и неоваскуляризации. Например, MMP9, по-видимому, участвует в ремоделировании, связанном с неоваскуляризацией злокачественной глиомы . Он также является ключевым регулятором формирования пластинки роста - как ангиогенеза пластинки роста, так и образования гипертрофических хондроцитов . Нокаут-модели MMP9 приводят к замедленному апоптозу, васкуляризации и оссификации гипертрофических хондроцитов. Наконец, есть убедительные доказательства того, что желатиназа B необходима для рекрутирования эндотелиальных стволовых клеток, критического компонента ангиогенеза.

Ремонт раны

MMP9 значительно активируется во время заживления респираторного эпителия человека . Используя модель мышей с дефицитом MMP9, было замечено, что MMP9 скоординированное заживление эпителиальной раны, а мыши с дефицитом MMP9 были неспособны удалить матрикс фибриногена во время заживления ран. При взаимодействии с TGF-β1 желатиназа B также стимулирует сокращение коллагена, способствуя закрытию ран.

Состав

ProMMP9 (пропептид (красный), каталитический домен (зеленый) с доменами фибронектина (голубой), с деталями «цистеинового переключателя» (из записи PDB 1L6J)

MMP9 синтезируется как препрофермент из 707 аминокислотных остатков, включая сигнальный пептид из 19 аминокислот, и секретируется как неактивный про-MMP. MMP9 людей Профермент состоит из пяти областей. Амино-концевой пропептид , цинк-связывающий каталитический домен и карбоксильной-концевой гемопексина-подобный домен сохраняются. Его первичная структура состоит из нескольких доменных мотивов . Пропептидный домен характеризуется консервативной последовательностью PRCGVPD. Cys в этой последовательности известен как «цистеиновый переключатель». Он связывает каталитический цинк, чтобы поддерживать фермент в неактивном состоянии.

Каталитический домен MMP-9 в комплексе с флуорогенным синтетическим пептидным субстратом. Из записи PDB 4JIJ.

Активация достигается за счет каскада взаимодействующих протеаз с участием плазмина и стромелизина 1 (MMP-3) . Плазмин генерирует активную ММР-3 из своего зимогена. Активная ММР-3 отщепляет пропептид от про-ММП-9 массой 92 кДа с образованием ферментативно активного фермента массой 82 кДа. В активном ферменте субстрат или зонд флуорогенной активности заменяет пропетид в активном центре фермента, где он расщепляется. Каталитический домен содержит два атома цинка и три атома кальция. Каталитический цинк координируется тремя гистидинами из консервативного связывающего мотива HEXXHXXGXXH. Другой атом цинка и три атома кальция являются структурными. Консервированный метионин, который образует уникальную структуру «Met-Turn», относит MMP9 к категории метцинцин. Три повтора фибронектина типа II вставлены в каталитический домен, хотя эти домены опущены в большинстве кристаллографических структур MMP9 в комплексе с ингибиторами. Активная форма MMP9 также содержит С-концевой гемопексиноподобный домен. Этот домен имеет форму эллипса и образован четырьмя лопастями β-винта и α-спиралью . Каждое лезвие состоит из четырех антипараллельных β-нитей, расположенных вокруг туннеля в форме воронки, содержащего два иона кальция и два иона хлорида. Домен гемопексина важен для облегчения расщепления тройных спиральных интерстициальных коллагенов. .

Клиническое значение

Было обнаружено, что MMP9 связан с многочисленными патологическими процессами, включая рак, плацентарную малярию, иммунологические и сердечно-сосудистые заболевания.

Артрит

Повышенные уровни MMP9 могут быть обнаружены в случаях ревматоидного артрита и очаговой ишемии головного мозга.

Рак

Одна из наиболее широко ассоциированных патологий MMP9 связана с раком из-за его роли в ремоделировании внеклеточного матрикса и ангиогенезе. Например, его повышенная экспрессия наблюдалась в линии клеток метастатического рака молочной железы. Желатиназа B играет центральную роль в прогрессировании опухоли, от ангиогенеза до ремоделирования стромы и, в конечном итоге, метастазирования. Однако из-за его физиологической функции может быть трудно использовать ингибирование желатиназы B в методах лечения рака. Тем не менее, желатиназа B была исследована при диагностике метастазов опухолей - видно, что комплексы желатиназы B / тканевые ингибиторы металлопротеиназ повышаются при раке желудочно-кишечного тракта и гинекологических злокачественных новообразованиях.

ММП, такие как ММР9, могут быть вовлечены в развитие нескольких злокачественных новообразований человека, поскольку деградация коллагена IV в базальной мембране и внеклеточном матриксе способствует прогрессированию опухоли, включая инвазию, метастазирование, рост и ангиогенез.

Сердечно-сосудистые

Уровни MMP9 повышаются по мере прогрессирования идиопатической фибрилляции предсердий .

Было обнаружено, что MMP9 связан с развитием аневризм аорты, а его нарушение предотвращает развитие аневризм аорты. Доксициклин подавляет рост аневризм аорты на животных моделях за счет ингибирования MMP9, уменьшая воспаление аорты у людей.

Малярия, связанная с беременностью (плацентарная малярия)

Исследование населения Ганы показало, что однонуклеотидный полиморфизм 1562 C> T (rs3918242) MMP-9 защищает от плацентарной малярии, что предполагает возможную роль MMP-9 в восприимчивости к малярии.

Сухой глаз

У пациентов с синдромом сухого глаза , особенно с дисфункцией мейбомиевых желез, наблюдается более высокий уровень ММП-9.

использованная литература

дальнейшее чтение

внешние ссылки

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: M10.009
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P14780 (матричная металлопротеиназа-9) в PDBe-KB .