NCI-60 - NCI-60
Панель линий раковых клеток NCI-60 представляет собой группу из 60 линий раковых клеток человека, используемых Национальным институтом рака (NCI) для скрининга соединений для выявления потенциальной противоопухолевой активности.
Цель
Процедура скрининга называется «Скрининг линий опухолевых клеток человека NCI-60» и является одной из услуг по открытию и развитию программы терапевтического развития NCI (DTP). Показатели скрининга для каждой клеточной линии цитостатического и цитотоксического воздействия тестируемых веществ.
Из-за разнообразия клеточных линий можно сравнивать тестируемые соединения по характеру их действия, высокая корреляция потенциально соответствует сходным механизмам действия. Автоматическое сравнение с базой данных, содержащей более 88000 чистых соединений и более 34000 сырых экстрактов (по состоянию на 6 января 2017 г.), обеспечивается инструментом COMPARE , который показывает список веществ, ранжированных по коэффициентам корреляции Пирсона для данного исследуемого вещества.
Та же панель используется в программе Molecular Target Program для характеристики молекулярных мишеней. Измерения включают уровни белка, измерения РНК, статус мутации и уровни активности ферментов .
Сотовые линии
Панель содержит клеточные линии, представляющие лейкоз , меланому , немелкоклеточную карциному легкого и рак мозга , яичников , груди , толстой кишки , почек и простаты .
13 дополнительных клеточных линий оцениваются для использования в программе скрининга, среди них две линии, происходящие от пока еще не представленной мелкоклеточной карциномы легкого .
Все линии клеток, кроме одной (по состоянию на 6 января 2017 г.), доступны другим лабораториям, включая дополнительные линии клеток.
Неправильная идентификация и неправильная классификация
Примерно на рубеже тысячелетий было обнаружено, что несколько линий клеток были неправильно идентифицированы или неправильно классифицированы во время расследования или ранее:
MDA-MB-435 , первоначально классифицированный как линия клеток рака груди, был идентифицирован как линия клеток меланомы. При дальнейшем исследовании выяснилось, что текущий MDA-MB-435 произошел от того же человека, что и клеточная линия M14 . Исследование клонов показало, что смешение с M14 произошло очень рано в истории MDA-MB-435, еще до того, как оно было включено в программу развития терапии.
NCI / ADR-RES , первоначально классифицированная как линия клеток рака груди, была идентифицирована как линия клеток опухоли яичника. NCI / ADR-RES, по-видимому, произошел в определенный момент времени из клеточной линии OVCAR-8 . Первоначально клеточная линия была названа MCF-7 / ADR-RES ; он был переименован вместе с изменением классификации.
Было обнаружено, что две линии клеток рака мозга, SNB-19 и U251 , принадлежат одному человеку. Это делает возможной путаницу.
Было подтверждено, что 61-я линия клеток, MDA-N , произошла от неправильно классифицированной линии клеток MDA-MB-435. Таким образом, он также ошибочно классифицирован, поскольку на самом деле является линией клеток меланомы, но по состоянию на 6 января 2018 года на официальном сайте он все еще числится как линия клеток рака груди. Эта клеточная линия недоступна по состоянию на 6 января 2018 года.
International Cell Line Комитет аутентификации поддерживает список зараженных клеточных линий . Он включает в себя приведенные выше клеточные линии, хотя обычно даты и статьи отчетности значительно позже первых дат и статей, вызывающих особую озабоченность в отношении соответствующей клеточной линии.
Продолжение использования неправильной классификации
По состоянию на 2014 год в сотнях научных исследований MDA-MB-435 все еще используется в качестве модели рака груди, даже после того, как в 2007 году он был официально объявлен линией клеток меланомы, и даже в международных рецензируемых журналах с самым высоким рейтингом. То же верно и для других ошибочно идентифицированных клеточных линий.
Список сотовых линий NCI-60
| Клеточная линия | Классификация опухолей | (Возможно) неправильно идентифицировано | Исходная классификация | Недоступен | Время удвоения (часы) | Плотность посева | Идентификатор целлозавра и ссылка |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CCRF-CEM | Лейкемия | 26,7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID: CVCL_0207) | |||
| HL-60 (ТБ) | Лейкемия | 28,6 | 40000 | HL-60 (TB) (RRID: CVCL_A794) | |||
| К-562 | Лейкемия | 19,6 | 5000 | К-562 (RRID: CVCL_0004) | |||
| МОЛТ-4 | Лейкемия | 27,9 | 30000 | МОЛТ-4 (RRID: CVCL_0013) | |||
| RPMI-8226 | Лейкемия | 33,5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID: CVCL_0014) | |||
| SR | Лейкемия | 28,7 | 20000 | SR (RRID: CVCL_1711) | |||
| A549 / ATCC | Немелкоклеточное легкое | 22,9 | 7500 | A-549 (RRID: CVCL_0023) | |||
| EKVX | Немелкоклеточное легкое | 43,6 | 20000 | EKVX (RRID: CVCL_1195) | |||
| HOP-62 | Немелкоклеточное легкое | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID: CVCL_1285) | |||
| HOP-92 | Немелкоклеточное легкое | 79,5 | 20000 | HOP-92 (RRID: CVCL_1286) | |||
| NCI-H226 | Немелкоклеточное легкое | 61 | 20000 | NCI-H226 (RRID: CVCL_1544) | |||
| NCI-H23 | Немелкоклеточное легкое | 33,4 | 20000 | NCI-H23 (RRID: CVCL_1547) | |||
| NCI-H322M | Немелкоклеточное легкое | 35,3 | 20000 | NCI-H322M (RRID: CVCL_1557) | |||
| NCI-H460 | Немелкоклеточное легкое | 17,8 | 7500 | NCI-H460 (RRID: CVCL_0459) | |||
| NCI-H522 | Немелкоклеточное легкое | 38,2 | 20000 | NCI-H522 (RRID: CVCL_1567) | |||
| COLO 205 | Двоеточие | 23,8 | 15000 | COLO 205 (RRID: CVCL_0218) | |||
| HCC-2998 | Двоеточие | 31,5 | 15000 | HCC2998 (RRID: CVCL_1266) | |||
| HCT116 | Двоеточие | 17,4 | 5000 | HCT 116 (RRID: CVCL_0291) | |||
| HCT-15 | Двоеточие | 20,6 | 10000 | HCT 15 (RRID: CVCL_0292) | |||
| HT-29 | Двоеточие | 19,5 | 5000 | HT-29 (RRID: CVCL_0320) | |||
| KM12 | Двоеточие | 23,7 | 15000 | KM12 (RRID: CVCL_1331) | |||
| SW-620 | Двоеточие | 20,4 | 10000 | SW620 (RRID: CVCL_0547) | |||
| SF-268 | ЦНС | 33,1 | 15000 | SF268 (RRID: CVCL_1689) | |||
| SF-295 | ЦНС | 29,5 | 10000 | SF295 (RRID: CVCL_1690) | |||
| SF-539 | ЦНС | 35,4 | 15000 | SF539 (RRID: CVCL_1691) | |||
| СНБ-19 | ЦНС | да | ЦНС | 34,6 | 15000 | СНБ-19 (RRID: CVCL_0535) | |
| СНБ-75 | ЦНС | 62,8 | 20000 | СНБ-75 (RRID: CVCL_1706) | |||
| U251 | ЦНС | да | ЦНС | 23,8 | 7500 | U-251MG (RRID: CVCL_0021) | |
| LOX IMVI | Меланома | 20,5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID: CVCL_1381) | |||
| МАЛЬМ-3М | Меланома | 46,2 | 20000 | Мальме-3М (RRID: CVCL_1438) | |||
| M14 | Меланома | 26,3 | 15000 | M14 (RRID: CVCL_1395) | |||
| MDA-MB-435 | Меланома | да | Грудь | 25,8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID: CVCL_0417) | |
| СК-МЭЛ-2 | Меланома | 45,5 | 20000 | SK-MEL-2 (RRID: CVCL_0069) | |||
| СК-МЭЛ-28 | Меланома | 35,1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID: CVCL_0526) | |||
| СК-МЭЛ-5 | Меланома | 25,2 | 10000 | SK-MEL-5 (RRID: CVCL_0527) | |||
| UACC-257 | Меланома | 38,5 | 20000 | UACC-257 (RRID: CVCL_1779) | |||
| UACC-62 | Меланома | 31,3 | 10000 | UACC-62 (RRID: CVCL_1780) | |||
| ИГР-ОВ1 | Яичников | 31 год | 10000 | ИГРОВ-1 (RRID: CVCL_1304) | |||
| ОВКАР-3 | Яичников | 34,7 | 10000 | OVCAR-3 (RRID: CVCL_0465) | |||
| ОВКАР-4 | Яичников | 41,4 | 15000 | OVCAR-4 (RRID: CVCL_1627) | |||
| ОВКАР-5 | Яичников | 48,8 | 20000 | OVCAR-5 (RRID: CVCL_1628) | |||
| OVCAR-8 | Яичников | 26,1 | 10000 | OVCAR-8 (RRID: CVCL_1629) | |||
| NCI / ADR-RES (первоначально MCF-7 / ADR-RES) | Яичников | да | Грудь | 34 | 15000 | NCI-ADR-RES (RRID: CVCL_1452) | |
| СК-ОВ-3 | Яичников | 48,7 | 20000 | СК-ОВ-3 (RRID: CVCL_0532) | |||
| 786-О | Почечный | 22,4 | 10000 | 786-O (RRID: CVCL_1051) | |||
| A498 | Почечный | 66,8 | 25000 | A-498 (RRID: CVCL_1056) | |||
| ACHN | Почечный | 27,5 | 10000 | ACHN (RRID: CVCL_1067) | |||
| CAKI-1 | Почечный | 39 | 10000 | Caki-1 (RRID: CVCL_0234) | |||
| RXF 393 | Почечный | 62,9 | 15000 | RXF 393L (RRID: CVCL_1673) | |||
| SN12C | Почечный | 29,5 | 15000 | SN12C (RRID: CVCL_1705) | |||
| ТК-10 | Почечный | 51,3 | 15000 | ТК-10 (RRID: CVCL_1773) | |||
| UO-31 | Почечный | 41,7 | 15000 | UO-31 (RRID: CVCL_1911) | |||
| ПК-3 | Предстательная железа | 27,1 | 7500 | PC-3 (RRID: CVCL_0035) | |||
| ДУ-145 | Предстательная железа | 32,3 | 10000 | DU145 (RRID: CVCL_0105) | |||
| MCF7 | Грудь | 25,4 | 10000 | MCF-7 (RRID: CVCL_0031) | |||
| MDA-MB-231 / ATCC | Грудь | 41,9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID: CVCL_0062) | |||
| MDA-MB-468 | Грудь | 62 | 2000 г. | MDA-MB-468 (RRID: CVCL_0419) | |||
| HS 578T | Грудь | 53,8 | 20000 | HS 578T (RRID: CVCL_0332) | |||
| МДА-Н | Меланома | да | Грудь | недоступен | 22,5 | 15000 | MDA-N (RRID: CVCL_1910) |
| БТ-549 | Грудь | 53,9 | 20000 | BT-549 (RRID: CVCL_1092) | |||
| Т-47Д | Грудь | 45,5 | 20000 | Т-47Д (RRID: CVCL_0553) |
Список дополнительных линий сотовой связи
| Клеточная линия | Классификация опухолей | Виды | Плотность посева | Идентификатор целлозавра и ссылка |
|---|---|---|---|---|
| LXFL 529 | Немелкоклеточное легкое | человек | 10000 | LXFL 529L (RRID: CVCL_D085) |
| DMS 114 | Мелкоклеточное легкое | человек | 20000 | DMS 114 (RRID: CVCL_1174) |
| ШП-77 | Мелкоклеточное легкое | человек | 40000 | ШП-77 (RRID: CVCL_1693) |
| DLD-1 | Двоеточие | человек | 50000 | DLD-1 (RRID: CVCL_0248) |
| КМ20Л2 | Двоеточие | человек | 10000 | KM20L2 (RRID: CVCL_D889) |
| СНБ-78 | ЦНС | человек | 20000 | СНБ-78 (RRID: CVCL_B321) |
| XF 498 | ЦНС | человек | 20000 | XF 498 (RRID: CVCL_8928) |
| RPMI-7951 | Меланома | человек | 20000 | RPMI-7951 (RRID: CVCL_1666) |
| M19-MEL | Меланома | человек | 10000 | M19-MEL (RRID: CVCL_B415) |
| RXF-631 | Почечный | человек | 10000 | RXF 631L (RRID: CVCL_A780) |
| SN12K1 | Почечный | человек | 10000 | SN12K1 (RRID: CVCL_D106) |
| P388 | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 (RRID: CVCL_7222) |
| P388 / ADR | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 / ADR (RRID: CVCL_IZ75) |