Ингибитор синтеза белка - Protein synthesis inhibitor

Упрощенная схема трансляции мРНК

А ингибитор синтеза белка представляет собой соединение , которое останавливает или замедляет рост или пролиферацию клеток, нарушая процессы , которые приводят непосредственно к генерации новых белков .

Рибосома является биологической машина , которая использует динамику белка на наномасштабах чтобы перевести РНК в белках

Хотя широкая интерпретация этого определения может использоваться для описания практически любого соединения в зависимости от концентрации, на практике оно обычно относится к соединениям, которые действуют на молекулярном уровне на трансляционный аппарат (либо на саму рибосому, либо на фактор трансляции), используя преимущества основные различия между прокариотическими и эукариотическими структурами рибосом.

Механизм

В общем, ингибиторы синтеза белка работают на разных стадиях трансляции бактериальной мРНК в белки, таких как инициация, элонгация (включая вход аминоацил тРНК , проверка считывания , перенос пептидила и бактериальная транслокация ) и терминация:

Более ранние стадии

Рифамицин подавляет транскрипцию бактериальной ДНК в мРНК, ингибируя ДНК-зависимую РНК-полимеразу , связывая ее бета-субъединицу.
Альфа-аманитин является мощным ингибитором транскрипции эукариотической ДНК.

Посвящение

Линезолид действует на стадии инициации, вероятно, предотвращая образование комплекса инициации , хотя механизм до конца не изучен.

Сборка рибосом

Аминогликозиды предотвращают сборку рибосом за счет связывания с бактериальной 30S-субъединицей рибосомы .

Запись аминоацил тРНК

Тетрациклины и тигециклин ( глицилциклин, относящийся к тетрациклинам) блокируют сайт A на рибосоме, предотвращая связывание аминоацил тРНК .

Корректура

Аминогликозиды , среди других потенциальных механизмов действия, мешают процессу корректуры , вызывая повышенный уровень ошибок в синтезе с преждевременным прекращением.

Перенос пептидила

Хлорамфеникол блокирует стадию переноса пептидила на 50S рибосомную субъединицу как в бактериях, так и в митохондриях .
Макролиды (а также ингибирующие транслокацию рибосом и другие потенциальные механизмы) связываются с 50-ю рибосомными субъединицами, ингибируя перенос пептидила .
Хинупристин / далфопристин действуют синергетически с далфопристином, усиливая связывание хинупристина, а также ингибируя перенос пептидила . Хинупристин связывается с соседним сайтом на 50S субъединице рибосомы и предотвращает удлинение полипептида , а также вызывает высвобождение неполных цепей.
Генетицин , также называемый G418, ингибирует стадию удлинения как в прокариотических, так и в эукариотических рибосомах.
Микотоксины трихотецена являются мощными и неселективными ингибиторами удлинения пептидов.

Рибосомная транслокация

Макролиды , клиндамицин и аминогликозиды (у всех этих трех также есть другие потенциальные механизмы действия) имеют доказательства ингибирования рибосомной транслокации .
Фузидиевая кислота препятствует обороту фактора удлинения G ( EF-G ) из рибосомы .
Рицин ингибирует удлинение путем ферментативной модификации рРНК эукариотической 60S рибосомной субъединицы .

Прекращение

Макролиды и клиндамицин (оба также имеют другие потенциальные механизмы) вызывают преждевременную диссоциацию пептидил-тРНК из рибосомы.
Пуромицин имеет структуру, аналогичную тирозиниламиноацил -тРНК. Таким образом, он связывается с сайтом рибосомы A и участвует в образовании пептидной связи, продуцируя пептидилпуромицин. Однако он не участвует в транслокации и быстро отделяется от рибосомы, вызывая преждевременное прекращение синтеза полипептида.
Стрептограмин также вызывает преждевременное высвобождение пептидной цепи.

Ингибиторы синтеза белка неуточненного механизма

Связывающий сайт

Следующие антибиотики связываются с 30S субъединицей рибосомы :

Следующие антибиотики связываются с 50S рибосомной субъединицей:

Languages

In other projects