Циклинзависимая киназа 9 - Cyclin-dependent kinase 9

CDK9
Доступные конструкции
PDB	Ортолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3BLH , 3BLQ , 3BLR , 3LQ5 , 3MI9 , 3MIA , 3MY1 , 3TN8 , 3TNH , 3TNI , 4BCF , 4BCG , 4BCH , 4BCI , 4BCJ , 4EC8 , 4EC9 , 4IMY , 4OGR , 4OR5
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK9 , C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, циклин-зависимая киназа 9, циклин-зависимая киназа 9
Внешние идентификаторы	OMIM : 603251 MGI : 1328368 HomoloGene : 55566 GeneCards : CDK9
Расположение гена ( человек )
Chr.	Хромосома 9 (человек)
Конец	127 790 792 б.п.
Расположение гена ( Мышь )
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	32 713 076 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция	• нуклеотид связывание ; • трансферазной активность ; • протеинкиназа активность ; • 7SK мяРНК связывание ; • транскрипция коактиватор связывание ; • связывание мяРНКа ; • АТФ связывание ; • связывания РНК - полимераза Ядро ДНК-последовательность промотора II ; • ДНК связывание ; • транскрипционный фактор связывания ; • GO: связывание 0001948 белка ; • белка серин / треонин киназы ; • хроматина связывания ; • активность киназы ; • циклин-зависимый белок серин / треонин киназы ; • РНК - полимеразы II , ОТД гептапептид повтор активности киназы ; • протеинкиназа связывания ; • циклин связывания ; • GO: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторной области sequence- специфическое связывание ДНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма ; • ядро ; • мембрана ; • нуклеоплазма ; • комплекс факторов элонгации транскрипции ; • комплекс положительных факторов элонгации транскрипции с циклином / CDK ; • тело PML ; • хромосома ; • гранула цитоплазматического рибонуклеопротеина ; • комплекс холоферментных циклин-зависимых протеинкиназ;
Биологический процесс	• позитивная регуляция гипертрофии сердечной мышцы ; • позитивная регуляция связывания 3'-UTR мРНК ; • регуляция дифференцировки мышечных клеток ; • негативная регуляция полиаденилирования мРНК ; • репарация ДНК ; • клеточный ответ на цитокиновый стимул ; • позитивная регуляция вирусной транскрипции ; • процессинг репликационной вилки ; • белок фосфорилирование ; • регуляция модификации гистонов ; • регуляция митотического клеточного цикла ; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК ; • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II ; • регуляция репарации ДНК ; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон ; • пролиферация клеточной популяции ; • ответ на лекарство ; • транскрипция с помощью РНК-полимеразы II ; • фосфорилирование ; • позитивная регуляция фосфорилирования гистонов ; • позитивная регуляция убиквитинирования гистона H2B ; • позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II ; • транскрипция, ДНК-шаблон ; • транскрипция мяРНК с помощью РНК-полимеразы II ; • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II ; • фосфорил действие С-концевого домена РНК-полимеразы II ; • позитивная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
	1025
	107951
	ENSG00000136807
	ENSMUSG00000009555
	P50750
	Q99J95
	NM_001261
	NM_130860
	NP_001252 ; NP_001252.1
	NP_570930
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Циклин-зависимая киназа 9 или CDK9 представляет собой циклин-зависимую киназу, связанную с P-TEFb .

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства циклин-зависимых киназ (CDK). Члены семейства CDK очень похожи на генные продукты S. cerevisiae cdc28 и S. pombe cdc2 и известны как важные регуляторы клеточного цикла. Было обнаружено, что эта киназа является компонентом мультибелкового комплекса TAK / P-TEFb, который представляет собой фактор элонгации для транскрипции, управляемой РНК-полимеразой II, и функционирует путем фосфорилирования С-концевого домена самой большой субъединицы РНК-полимеразы II . Этот белок образует комплекс и регулируется его регуляторной субъединицей циклином Т или циклином К. Было обнаружено, что белок Tat ВИЧ-1 взаимодействует с этим белком и циклином Т, что предполагает возможное участие этого белка в развитии СПИДа.

CDK9, как известно, связывается с другими белками, такими как TRAF2 , и участвует в дифференцировке скелетных мышц.

Ингибиторы

На основании результатов молекулярного докинга лиганды-3, 5, 14 и 16 были проверены среди 17 различных слитых с пирролоном соединений бензосуберена в качестве сильнодействующих и специфических ингибиторов без какой-либо перекрестной реактивности против различных изоформ CDK. Анализ МД-моделирования и исследований MM-PBSA выявил профили энергии связи всех выбранных комплексов. Выбранные лиганды показали лучшие результаты, чем экспериментальный лекарственный препарат-кандидат (Росковитин). Лиганды-5 и 16 проявляют специфичность к CDK9. Ожидается, что эти лиганды обладают меньшим риском побочных эффектов из-за их естественного происхождения.

Взаимодействия

CDK9 взаимодействует с:

дальнейшее чтение

Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. DOI : 10.1007 / BF02253352 . PMID 9570510 .
Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции» . Curr. Биол . 8 (13): R447–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1 . PMID 9651670 . S2CID 15480646 .
Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж. И др. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». J. Cell. Biochem . 75 (3): 357–68. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K . PMID 10536359 .
Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором HIV-1 Tat». IUBMB Life . 51 (3): 175–81. DOI : 10.1080 / 152165401753544241 . PMID 11547919 . S2CID 10931640 .
Хьюген М.С., Камп В., Ноттет Х.С. (2004). «Множественные эффекты трансактиваторного белка ВИЧ-1 на патогенез инфекции ВИЧ-1». Евро. J. Clin. Инвестируйте . 34 (1): 57–66. DOI : 10.1111 / j.1365-2362.2004.01282.x . PMID 14984439 . S2CID 29713968 .
Райс А.П., Херрманн СН (2004). «Регулирование TAK / P-TEFb в CD4 + Т-лимфоцитах и макрофагах». Curr. HIV Res . 1 (4): 395–404. DOI : 10.2174 / 1570162033485159 . PMID 15049426 .
Мингетти Л., Визентин С., Патрицио М. и др. (2004). «Множественные действия белка Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 на функции микроглиальных клеток». Neurochem. Res . 29 (5): 965–78. DOI : 10,1023 / Б: NERE.0000021241.90133.89 . PMID 15139295 . S2CID 25323034 .
Лиу Л.Ю., Херрманн СН, Райс А.П. (2005). «ВИЧ-1 инфекция и регуляция функции Tat в макрофагах». Int. J. Biochem. Cell Biol . 36 (9): 1767–75. DOI : 10.1016 / j.biocel.2004.02.018 . PMID 15183343 .
Пульезе А., Видотто В., Бельтрамо Т. и др. (2005). «Обзор биологических эффектов белка Tat ВИЧ-1». Cell Biochem. Функц . 23 (4): 223–7. DOI : 10.1002 / cbf.1147 . PMID 15473004 . S2CID 8408278 .
Баннварт С., Гатиньол А (2005). «РНК TAR ВИЧ-1: мишень молекулярных взаимодействий между вирусом и его хозяином». Curr. HIV Res . 3 (1): 61–71. DOI : 10.2174 / 1570162052772924 . PMID 15638724 .
Гибеллини Д., Витоне Ф, Скьявоне П., Ре MC (2005). «Белок tat ВИЧ-1, пролиферация и выживаемость клеток: краткий обзор». New Microbiol . 28 (2): 95–109. PMID 16035254 .
Перуцци F (2006). «Множественные функции Tat ВИЧ-1: пролиферация против апоптоза». Фронт. Biosci . 11 : 708–17. DOI : 10,2741 / 1829 . PMID 16146763 .

Внешние ссылки

Cyclin-Dependent + Kinase + 9 в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Циклинзависимая киназа 9 дрозофилы - Интерактивная муха
CDK9 местоположение гена человеческого в браузере УСК генома .
CDK9 детали гена человеческого в браузере УСК генома .

Эта статья о ферментах EC 2.7 является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Languages

In other projects