Малая ядрышковая РНК SNORD115 - Small nucleolar RNA SNORD115
| Малая ядрышковая РНК SNORD115 | |
|---|---|
 Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности SNORD115
| |
| Идентификаторы | |
| Условное обозначение | SNORD115 |
| Альт. Символы | snoHBII-52; HBII-52 |
| Рфам | RF00105 |
| Прочие данные | |
| Тип РНК | Джин ; мяРНК ; snoRNA ; CD-бокс |
| Домен (ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | GO: 0006396 GO: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| Структуры PDB | PDBe |
SNORD115 (также известный как HBII-52 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), известную как небольшая ядрышковая РНК, которая обычно управляет модификацией других некодирующих РНК . Этот тип модифицирующей РНК обычно располагается в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным участком биогенеза мяРНК. HBII-52 относится к гену человека, тогда как RBII-52 используется для гена крысы, а MBII-52 используется для наименования гена мыши.
HBII-52 принадлежит к классу snoRNA C / D-бокса, который содержит консервативные мотивы последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства C / D-боксов управляют сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК.
В геноме человека HBII-52 кодируется тандемно повторяющимся массивом с другой C / D box snoRNA, HBII-85 (SNORD116) , в области синдрома Прадера-Вилли (PWS) хромосомы 15 . Однако микроделеция в одном семействе кластера snoRNA HBII-52 исключила его роль в развитии болезни. HBII-52 обнаружен в 47 тандеме рядом с идентичными копиями на хромосоме 15q11-13 человека. Этот локус импринтируется по материнской линии, что означает, что транскрибируется только отцовская копия локуса. HBII-52 экспрессируется исключительно в головном мозге, но отсутствует у пациентов с PWS. HBII-52 лишен какой-либо значительной комплементарности с рибосомными РНК , но имеет 18 нуклеотидную область консервативной комплементарности к мРНК рецептора серотонина 2С . Рецептор серотонина 2C также экспрессируется в головном мозге. Было показано, что эта snoRNA, вероятно, связывается с сайленсирующим элементом экзона Vb, увеличивая его включение и продуцирование функциональной формы сплайсинга рецептора серотонина 2C.
Хромосомный локус, содержащий кластер генов SNORD115, был дублирован у многих людей с аутичными признаками . Модель мыши, созданная так, чтобы дублировать кластер SNORD115, демонстрирует аутичное поведение.
Есть свидетельства того, что усеченная форма MBII-52 (SNORD115, обнаруженная у мышей) регулирует альтернативный сплайсинг генов, кодирующих белок DPM2 , TAF1 , RALGPS1 , PBRM1 и CRHR1 .
использованная литература
- ^ Галарди, S .; Fatica, A .; Бачи, А .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Боззони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные бокс-C / D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. DOI : 10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002 . PMC 134041 . PMID 12215523 .
- ^ Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M и др. (2000). «Идентификация специфичных для мозга и импринтированных генов малых ядрышек РНК, демонстрирующих необычную геномную организацию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (26): 14311–6. Bibcode : 2000PNAS ... 9714311C . DOI : 10.1073 / pnas.250426397 . PMC 18915 . PMID 11106375 .
- ^ Runte М, Варон R, Хорн D, Horsthemke В, Buiting К (2005). «Исключение генного кластера HBII-52 C / D box snoRNA из основной роли в синдроме Прадера-Вилли». Hum Genet . 116 (3): 228–30. DOI : 10.1007 / s00439-004-1219-2 . PMID 15565282 . S2CID 23190709 .
- Перейти ↑ Kishore S, Stamm S (январь 2006 г.). «SnoRNA HBII-52 регулирует альтернативный сплайсинг серотонинового рецептора 2C». Наука . 311 (5758): 230–2. Bibcode : 2006Sci ... 311..230K . DOI : 10.1126 / science.1118265 . PMID 16357227 . S2CID 44527461 .
- ^ Bolton PF, Veltman MW, Weisblatt E, et al. (Сентябрь 2004 г.). «Аномалии хромосомы 15q11-13 и другие заболевания у людей с расстройствами аутистического спектра». Психиатр. Genet . 14 (3): 131–7. DOI : 10.1097 / 00041444-200409000-00002 . PMID 15318025 . S2CID 37344935 .
- ^ Кук EH, Шерер SW (октябрь 2008). «Вариации числа копий, связанные с психоневрологическими состояниями». Природа . 455 (7215): 919–23. Bibcode : 2008Natur.455..919C . DOI : 10,1038 / природа07458 . PMID 18923514 . S2CID 4377899 .
- ^ Накатани Дж, Тамада К, Хатанака Ф и др. (Июнь 2009 г.). «Аномальное поведение в модели мышей, созданной с помощью хромосом, для дупликации 15q11-13 человека, наблюдаемой при аутизме» . Cell . 137 (7): 1235–46. DOI : 10.1016 / j.cell.2009.04.024 . PMC 3710970 . PMID 19563756 .
- ↑ Кишор С., Ханна А., Чжан З., Хуэй Дж., Бальвеж П.Дж., Стефан М., Пляж С, Николлс Р.Д., Заволан М., Штамм С. (2010). «SnoRNA MBII-52 (SNORD 115) преобразуется в более мелкие РНК и регулирует альтернативный сплайсинг» . Hum Mol Genet . 19 (7): 1153–64. DOI : 10,1093 / HMG / ddp585 . PMC 2838533 . PMID 20053671 .