Цистатионин гамма-лиаза - Cystathionine gamma-lyase

цистатионин гамма-лиаза
Биосинтез цистеина.svg
Метаболизм цистеина. Цистатионаза катализирует низшую реакцию.
Идентификаторы
Номер ЕС 4.4.1.1
Количество CAS 9012-96-8
Базы данных
IntEnz Просмотр IntEnz
BRENDA BRENDA запись
ExPASy Просмотр NiceZyme
КЕГГ Запись в KEGG
MetaCyc метаболический путь
ПРИАМ профиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология Amigo / QuickGO
цистатионаза (цистатионин гамма-лиаза)
2nmp.jpg
Идентификаторы
Символ CTH
Ген NCBI 1491
HGNC 2501
OMIM 607657
RefSeq NM_001902
UniProt P32929
Прочие данные
Номер ЕС 4.4.1.1
Locus Chr. 1 п. 31.1

Цистатионин-гамма-лиаза ( CTH или CSE ; также цистатионаза ) - это фермент, расщепляющий цистатионин на цистеин , α-кетобутират и аммиак . Пиридоксальфосфат - простетическая группа этого фермента.

Цистатионин гамма-лиаза также катализирует следующие реакции элиминации:

У некоторых бактерий и млекопитающих , включая человека, этот фермент участвует в образовании сероводорода . Сероводород - один из немногих газов, который, как недавно было обнаружено, играет роль в передаче сигналов клетками в организме.

Ферментный механизм

Цистатионаза использует пиридоксальфосфат для облегчения расщепления связи сера-гамма-углерод цистатионина, что приводит к высвобождению цистеина. После этого внешний кетимин гидролизуется, вызывая высвобождение α-кетобутирата. Лизин остатки реформы внутренного Альдимина путем сбрасывая аммиак уходящего группы.

Аминогруппа цистатионина депротонирована и подвергается нуклеофильной атаке внутреннего альдимина. Дополнительное депротонирование общим основанием приводит к образованию внешнего альдимина и удалению остатка лизина. Затем основной остаток лизина способен депротонировать альфа-углерод, перемещая электронную плотность в азот пиридинового кольца. Пиридоксальфосфат необходим для стабилизации этого карбанионного интермедиата; в противном случае pKa протона будет слишком высоким. Затем бета-углерод депротонируется, создавая альфа-бета-ненасыщенность и выталкивая неподеленную пару на альдиминовый азот. Чтобы преобразовать альдимин, эта неподеленная пара отталкивается, разрывая связь сера-гамма-углерод, что приводит к высвобождению цистеина.

Пиридоксаминовое производное винилглиоксилата остается после гамма- элиминирования . Неподеленная пара из пиридинового азота подталкивает электронную плотность к гамма-углероду, который протонируется лизином. Затем лизин атакует внешний альдимин, подталкивая электронную плотность к бета-углероду, который протонируется общей кислотой. Затем имин гидролизуют с высвобождением α-кетобутирата. Депротонирование остатка лизина вызывает удаление аммиака, завершая каталитический цикл .

Цистатионин-гамма-лиаза также проявляет гамма-синтазную активность в зависимости от присутствующих концентраций реагентов. Механизмы остаются такими же, пока они не расходятся после образования производного винилглиоксилата. В механизме гамма-синтазы гамма-углерод атакуется нуклеофилом серы, что приводит к образованию новой связи сера-гамма-углерод.

Механизм цистатионин гамма-лиазы.

Структура фермента

Цистатионин-гамма-лиаза является членом семейства PLP-зависимых ферментов метаболизма Cys / Met. Другие члены включают цистатионин-гамма-синтазу, цистатионин-бета-лиазу и метионин-гамма-лиазу. Он также является членом более широкого семейства аспартатаминотрансфераз . Как и многие другие PLP-зависимые ферменты, цистатионин-гамма-лиаза представляет собой тетрамер с симметрией D2 .

Пиридоксальфосфат связывается в активном центре с помощью Lys 212 .

Актуальность болезни

Ингибированный активный центр цистатионазы. Ингибитор и Tyr 114 выделены голубым цветом, PLP - фиолетовым, а Lys 121 - желтым.

Цистеин является субстратом, ограничивающим скорость синтеза глутатиона в глазу. Глутатион - антиоксидант, который защищает кристаллины глаза от активных форм кислорода; денатурированные кристаллины могут привести к катаракте . Цистатионаза также является мишенью для активных форм кислорода. Таким образом, по мере окисления цистатионазы ее активность снижается, вызывая уменьшение цистеина и, в свою очередь, глутатиона в глазу, что приводит к снижению доступности антиоксидантов, вызывая дальнейшее снижение активности цистатионазы. Также было показано, что недостаточность цистатионазной активности способствует истощению запасов глутатиона у пациентов с раком и СПИДом .

Мутации и дефицит цистатионазы связаны с цистатионинурией . Мутации T67I и Q240E ослабляют сродство фермента к пиридоксальфосфату, кофактору, жизненно важному для ферментативной функции. Низкие уровни H 2 S также были связаны с гипертензией у мышей.

Пропаргилглицин (явно показан кислый бета-водород).

Чрезмерные уровни H 2 S, из - за повышенной активности cystathionase, связаны с эндотоксемии , острый панкреатит , геморрагический шок , и сахарный диабет .

Propargylglycine и β-cyanoalanine два необратимые ингибиторы из cystathionase , используемых для лечения повышенной Н 2 уровня S. Механически аминогруппа пропаргилглицина атакует альдимин с образованием внешнего альдимина. Затем β-положение алкина депротонируется с образованием аллена , который затем подвергается атаке фенолом Tyr 114 . Внутренний альдимин может регенерироваться, но вновь созданный виниловый эфир стерически препятствует активному центру , блокируя цистеин от атаки пиридоксальфосфата.

Регулирование

H 2 S снижает транскрипцию цистатионазы при концентрациях от 10 до 80 мкМ. Однако транскрипция увеличивается при концентрациях около 120 мкМ и полностью подавляется при концентрациях, превышающих 160 мкМ.

Смотрите также

Рекомендации

внешняя ссылка