Фибрилларин - Fibrillarin
| Фибрилларин | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 pyrococcus horikoshii, фибрилларин, пре-РРНК, процессирующий белок
| |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Условное обозначение | Фибрилларин | ||||||||
| Pfam | PF01269 | ||||||||
| Клан пфам | CL0063 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000692 | ||||||||
| ПРОФИЛЬ | PDOC00489 | ||||||||
| SCOP2 | 1fbn / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
рРНК 2'-О-метилтрансферазы фибрилларин представляет собой фермент , который у человека кодируется FBL гена .
Функция
Этот генный продукт является компонентом ядрышковой частицы малого ядерного рибонуклеопротеина (snRNP), которая, как предполагается, участвует на первом этапе процессинга прерибосомной (r) РНК. Он связан с небольшими ядрышковыми РНК U3 , U8 и U13 и расположен в плотном фибриллярном компоненте (DFC) ядрышка . Кодируемый белок содержит N-концевой повторяющийся домен, который богат остатками глицина и аргинина, как и фибрилларины у других видов. Его центральная область напоминает РНК-связывающий домен и содержит консенсусную последовательность РНП. Антисыворотки примерно 8% людей с аутоиммунным заболеванием склеродермией распознают фибрилларин.
Фибрилларин является компонентом нескольких рибонуклеопротеидов, включая ядрышковый малый ядерный рибонуклеопротеин ( SnRNP ) и один из двух классов малых ядрышковых рибонуклеопротеидов (snoRNP). SnRNAs участвуют в сплайсинге РНК, тогда как snoRNPs участвуют в процессинге рибосомной РНК .
Фибрилларин связан с малыми ядерными РНК U3, U8 и U13 у млекопитающих и подобен дрожжевому белку NOP1. Фибрилларин имеет хорошо консервативную последовательность из примерно 320 аминокислот и содержит 3 домена: N-концевую область, богатую Gly / Arg; центральный домен, напоминающий другие РНК-связывающие белки и содержащий консенсусную последовательность, подобную РНП-2; и С-концевой альфа-спиральный домен. Эволюционно связанный белок процессинга пре-рРНК, который лишен Gly / Arg-богатого домена, был обнаружен у различных архей.
Исследование Schultz et al. показали, что белок 15,5 кДа, связывающий K-поворот (называемый Snu13 в дрожжах), взаимодействует со сплайсосомными белками hPRP31, hPRP3, hPRP4, CYPH и небольшими ядрышковыми рибонуклеопротеинами NOP56 , NOP58 и фибрилларином. Белок 15,5 кДа имеет сходство последовательностей с другими РНК-связывающими белками, такими как рибосомные белки S12, L7a и L30 и белок snoRNP NHP2 . SnRNP U4 / U6 содержит белок массой 15,5 кДа. Белок 15,5 кДа также существует в рибонуклеопротеидном комплексе, который связывает мотив B / C U3-бокса. Белок 15,5 кДа также существует как один из четырех ядерных белков небольшого ядрышкового рибонуклеопротеина C / D, который опосредует метилирование прерибосомных РНК.
Были рассмотрены структурные доказательства, подтверждающие идею о том, что фибрилларин является метилтрансферазой мяРНК.
Взаимодействия
Было показано, что фибрилларин взаимодействует с DDX5 и SMN1 .
использованная литература
дальнейшее чтение
- Baserga SJ, Yang XD, Steitz JA (сентябрь 1991 г.). «Неповрежденная последовательность Box C в мяРНК U3 необходима для связывания фибрилларина, белка, общего для основного семейства ядрышковых мяРНП» . Журнал EMBO . 10 (9): 2645–51. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07807.x . PMC 452965 . PMID 1714385 .
- Окано Ю., Стин В.Д., Медсгер Т.А. (январь 1992 г.). «Аутоантитела к ядрышечному рибонуклеопротеину U3 (фибрилларин) у пациентов с системным склерозом» . Артрит и ревматизм . 35 (1): 95–100. DOI : 10.1002 / art.1780350114 . PMID 1731817 .
- Lischwe MA, Ochs RL, Reddy R, Cook RG, Yeoman LC, Tan EM, Reichlin M, Busch H (ноябрь 1985 г.). «Очистка и частичная характеристика антигена ядрышковой склеродермии (Mr = 34000; pI, 8,5), богатого NG, NG-диметиларгинином» . Журнал биологической химии . 260 (26): 14304–10. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (17) 38718-5 . PMID 2414294 .
- Méhes G, Pajor L (июнь 1995 г.). «Экспрессия нуклеолина и фибрилларина в стимулированных лимфоцитах и дифференцирующихся клетках HL-60. Анализ проточной цитометрии». Клеточная пролиферация . 28 (6): 329–36. DOI : 10.1111 / j.1365-2184.1995.tb00074.x . PMID 7626687 . S2CID 34753195 .
- Лю Кью, Дрейфус Джи (июль 1996 г.). «Новая ядерная структура, содержащая выживание белка мотонейронов» . Журнал EMBO . 15 (14): 3555–65. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00725.x . PMC 451956 . PMID 8670859 .
- Магулас С., Зацепина О.В., Джордан П.В., Джордан Э.Г., Фрид М. (февраль 1998 г.). «Белок SURF-6 является компонентом ядрышкового матрикса и обладает высокой способностью связывания нуклеиновых кислот in vitro». Европейский журнал клеточной биологии . 75 (2): 174–83. DOI : 10.1016 / s0171-9335 (98) 80059-9 . PMID 9548374 .
- Ай Л.С., Линь С.Х., Се М., Ли К. (октябрь 1999 г.). «Метилирование аргинина глицина и богатого аргинином пептида, полученного из последовательностей человеческого FMRP и фибрилларина». Труды Национального научного совета Китайской Республики. Часть B, Науки о жизни . 23 (4): 175–80. PMID 10518318 .
- Пинтар Л., Кресслер Д., Лапейр Б. (февраль 2000 г.). «Spb1p представляет собой ядрышковый белок дрожжей, связанный с Nop1p и Nop58p, который способен связывать S-аденозил-L-метионин in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (4): 1370–81. DOI : 10.1128 / MCB.20.4.1370-1381.2000 . PMC 85287 . PMID 10648622 .
- Николь С.М., Кэушевич М., Прескотт А.Р., Фуллер-Пейс Ф.В. (июнь 2000 г.). «Ядерная DEAD-бокс-РНК-геликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и специфически колокализуется в формирующихся ядрышках во время телофазы». Экспериментальные исследования клеток . 257 (2): 272–80. DOI : 10.1006 / excr.2000.4886 . PMID 10837141 .
- Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Белок выживания мотонейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1» . Текущая биология . 11 (14): 1079–88. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5 . PMID 11509230 . S2CID 12392702 .
- Чжоу X, Тан Ф.К., Сюн М., Милевич Д.М., Фегали, Калифорния, Фрицлер М.Дж., Ревейл Д.Д., Арнетт ФК (декабрь 2001 г.). «Системный склероз (склеродермия): определенные аутоантигенные гены избирательно сверхэкспрессируются в фибробластах склеродермии» . Журнал иммунологии . 167 (12): 7126–33. DOI : 10.4049 / jimmunol.167.12.7126 . PMID 11739535 .
- Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х., Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Текущая биология . 12 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
- Cimato TR, Tang J, Xu Y, Guarnaccia C, Herschman HR, Pongor S, Aletta JM (февраль 2002 г.). «Опосредованное фактором роста нервов увеличение метилирования белка происходит преимущественно на сайтах метилирования аргинина I типа и включает протеин-аргининметилтрансферазу 1». Журнал неврологических исследований . 67 (4): 435–42. DOI : 10.1002 / jnr.10123 . PMID 11835310 . S2CID 8041481 .
- Фудзияма С., Янагида М., Хаяно Т., Миура Ю., Исобе Т., Фудзимори Ф., Учида Т., Такахаши Н. (июнь 2002 г.). «Выделение и протеомная характеристика человеческих парвулин-ассоциированных прерибосомных рибонуклеопротеиновых комплексов» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23773–80. DOI : 10.1074 / jbc.M201181200 . PMID 11960984 .
- Whitehead SE, Jones KW, Zhang X, Cheng X, Terns RM, Terns MP (декабрь 2002 г.). «Детерминанты взаимодействия белка SMN, вызывающего мышечную атрофию позвоночника, с диметиларгинин-модифицированным боксом H / ACA малым ядрышковым рибонуклеопротеином GAR1» . Журнал биологической химии . 277 (50): 48087–93. DOI : 10.1074 / jbc.M204551200 . PMID 12244096 .
- Эррера-Эспарса Р., Крузе Л., фон Эссен М., Кампос Л., Барбоса О., Боллен Дж. Дж., Бадилло И., Авалос-Диас Е. (октябрь 2002 г.). «U3 snoRNP ассоциируется с фибрилларином, компонентом комковатого ядрышкового домена склеродермии». Архив дерматологических исследований . 294 (7): 310–7. DOI : 10.1007 / s00403-002-0338-7 . PMID 12373336 . S2CID 10316081 .
- Chen M, Rockel T, Steinweger G, Hemmerich P, Risch J, von Mikecz A (октябрь 2002 г.). «Субклеточное рекрутирование фибрилларина в нуклеоплазматические протеасомы: последствия для процессинга ядрышкового аутоантигена» . Молекулярная биология клетки . 13 (10): 3576–87. DOI : 10.1091 / mbc.02-05-0083 . PMC 129967 . PMID 12388758 .
- Watkins NJ, Dickmanns A, Lührmann R (декабрь 2002 г.). «Консервативный стебель II бокс-мотива C / D важен для локализации ядрышка и необходим вместе с белком 15.5K для иерархической сборки бокс-C / D snoRNP» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (23): 8342–52. DOI : 10.1128 / MCB.22.23.8342-8352.2002 . PMC 134055 . PMID 12417735 .