HDAC3 - HDAC3
Гистондеацетилазу 3 представляет собой фермент , кодируемый гистондеацетилаза 3 гена в обоих людей и мышей.
Функция
Гистоны - это высокощелочные белки, которые упаковывают и упорядочивают ДНК в структурные единицы, называемые нуклеосомами, которые составляют основной белковый компонент хроматина. Посттрансляционное и ферментативно опосредованное ацетилирование лизина и деацетилирование гистоновых хвостов изменяет локальную структуру хроматина за счет изменения электростатического притяжения между отрицательно заряженным остовом ДНК и гистонами. HDAC3 является членом класса I суперсемейства гистондеацетилаз (включающего четыре класса на основе функции и гомологии последовательностей ДНК), который задействован в энхансерах для модуляции как эпигенома, так и экспрессии близлежащих генов. HDAC3 обнаруживается исключительно в ядре клетки, где это единственная эндогенная гистон-деацетилаза, биохимически очищенная в корепрессорном комплексе ядерного рецептора, содержащем NCOR и SMRT (NCOR2). Таким образом, HDAC3 в отличие от других HDAC играет уникальную роль в модулировании транскрипционной активности ядерных рецепторов.
Альтернативные функции
Гистоновые деацетилазы могут регулироваться эндогенными факторами, пищевыми компонентами, синтетическими ингибиторами и сигналами бактериального происхождения. Исследования на мышах со специфической делецией HDAC3 в эпителиальных клетках кишечника (IEC) показывают нарушение регуляции экспрессии гена IEC. У этих мышей с делецией-мутантами наблюдалась потеря клеток Панета , нарушение функции IEC и изменения в составе кишечника комменсальными бактериями. Эти отрицательные эффекты не наблюдались у мышей, свободных от микробов, что указывает на то, что эффекты делеции наблюдаются только при наличии кишечной микробной колонизации. Но отрицательные эффекты делеции HDAC3 не связаны с присутствием измененной микробиоты, потому что нормальные мыши без микробов, колонизированные измененной микробиотой, не проявляли отрицательных эффектов, наблюдаемых у делеционных мутантов.
Хотя точный механизм и конкретные сигналы неизвестны, ясно, что HDAC3 взаимодействует с сигналами, производными от комменсальных бактерий микробиоты кишечника . Эти взаимодействия отвечают за калибровку ответов эпителиальных клеток, необходимых для установления нормальных отношений между хозяином и комменсалом, а также для поддержания гомеостаза кишечника .
Модельные организмы
| Характерная черта | Фенотип |
|---|---|
| Жизнеспособность гомозигот | Аномальный |
| Рецессивное летальное исследование | Аномальный |
| Плодородие | Обычный |
| Масса тела | Обычный |
| Беспокойство | Обычный |
| Неврологическое обследование | Обычный |
| Сила захвата | Обычный |
| Горячая тарелка | Обычный |
| Дисморфология | Обычный |
| Косвенная калориметрия | Обычный |
| Тест толерантности к глюкозе | Обычный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Обычный |
| DEXA | Обычный |
| Рентгенография | Обычный |
| Температура тела | Обычный |
| Морфология глаза | Обычный |
| Клиническая химия | Обычный |
| Плазменные иммуноглобулины | Обычный |
| Гематология | Обычный |
| Лимфоциты периферической крови | Обычный |
| Микроядерный тест | Обычный |
| Вес сердца | Обычный |
| Гистопатология кожи | Обычный |
| Гистопатология головного мозга | Обычный |
| Сальмонеллезная инфекция | Обычный |
| Citrobacter инфекция | Обычный |
| Все тесты и анализы от |
Модельные организмы использовались при изучении функции HDAC3. Линия условно нокаутных мышей , названная Hdac3 tm1a (EUCOMM) Wtsi, была создана в рамках программы International Knockout Mouse Consortium , проекта высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения животных моделей болезней среди заинтересованных ученых.
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения эффектов делеции.
На мутантных мышах было проведено 26 тестов, и были обнаружены два значительных отклонения от нормы. Нет гомозиготных мутантных не были идентифицированы эмбрионы во время беременности, так и в отдельном исследовании никто не дожил до отъема . Остальные тесты были выполнены на гетерозиготных мутантных взрослых мышах; у этих животных не наблюдалось никаких значительных отклонений от нормы.
Взаимодействия
Было показано, что HDAC3 взаимодействует с:
Смотрите также
использованная литература
дальнейшее чтение
- Вердин E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). «Гистоновые деацетилазы класса II: универсальные регуляторы». Тенденции Genet . 19 (5): 286–93. DOI : 10.1016 / S0168-9525 (03) 00073-8 . PMID 12711221 .
внешние ссылки
- Белок HDAC3 +, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
