KCTD7 - KCTD7
Калий домен , содержащий канал tetramerisation 7 представляет собой белка в организме человека , который кодируется KCTD7 геном . Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипции.
Описание
Ген KCTD7 кодирует член семейства белков, содержащих домен тетрамеризации калиевых каналов . Члены семейства идентифицируются на структурной основе и содержат амино-концевой домен, аналогичный домену T1, присутствующему в потенциалзависимом калиевом канале . KCTD7 отображает первичную последовательность и профиль гидропатии, указывающие на внутрицитоплазматическую локализацию. Анализ базы данных EST показал, что KCTD7 экспрессируется в мозге человека и мыши .
Функция
Выражение KCTD7 hyperpolarizes на клеточную мембрану и снижает возбудимость нейронов в трансфицированных патч зажимных экспериментов. МРНК и белок KCTD7 экспрессируются в нейронах гиппокампа , глубоких слоях коры головного мозга и клетках Пуркинье головного мозга мышей, как показали эксперименты по гибридизации in situ и иммуногистохимии . Анализы иммунопреципитации демонстрируют, что KCTD7 способен к чистоте и напрямую взаимодействует с кулином-3 ( CUL3 ), компонентом комплекса убиквитин-лигаза. Считается, что эти взаимодействия опосредуются через домен BTB / POZ KCTD7. Однако KCTD7 не обнаруживает взаимодействия cullin-1 ( CUL1 ). Анализы иммунопреципитации также показывают, что KCTD7 не взаимодействует с Ubiquitin-flag, что позволяет предположить потенциальную роль KCTD7 в комплексе убиквитин-лигазы, не будучи сам по себе подверженным uiquitination. Иммунофлуоресцентная микроскопия показывает цитозольную экспрессию рекомбинантного белка GFP -KCTD7 в трансфицированных клетках COS-7 .
Одна из возможных гипотез состоит в том, что KCTD7 косвенно регулирует уровень мембранной экспрессии калиевого канала . Конъюгируя с комплексом убиквитин-лигазы кулин -3 , KCTD7 может модулировать уровень экспрессии отрицательного регулятора калиевого канала. Следовательно, сверхэкспрессия KCTD7 в нейронах будет увеличивать деградацию этой регуляторной молекулы, приводя к увеличению тока калия через клеточную мембрану, как это наблюдается в экспериментах с зажимом заплатки.
В культивируемых клетках гиппокампа мышей экспрессия обнаруживается в соме клеток, варикозном расширении нейритов вдоль развивающихся отростков нейронов и в конусах роста нейритов, но не в ядре. Kctd7 широко экспрессируется в нейронах интактного мозга мышей, в том числе в нейронах коры, в слоях гранулярных и пирамидных клеток гиппокампа и в клетках Пуркинье мозжечка. Однако не все нейрональные клетки иммунопозитивны для Kctd7, и экспрессия не наблюдается в астроцитах или микроглиальных клетках. Экспрессия в лизатах мозжечка постоянна от Р5 до 2 месяцев. Сверхэкспрессия KCTD7 в клетках HeLa и COS-1, которые не экспрессируют эндогенный KCTD7, демонстрирует диффузную цитозольную локализацию без совместной локализации с маркерами эндосом, ER, Гольджи, лизосом или цитоскелета.
Помимо домена BTB / POZ KCTD7, другие остатки имеют решающее значение для его правильного взаимодействия с cullin-3. Кроме того, в мозге мышей экспрессируется изоформа Kctd7 полной длины 31 кДа. Другие основные иммунореактивные полосы включали виды массой 28 кДа в селезенке, печени и почках, виды массой 37 кДа в почках и формы массой 62 кДа, наиболее вероятно соответствующие стабильному димеру. Наличие нескольких полос соответствовало альтернативному сплайсингу и тканеспецифической регуляции.
Клиническое значение
У 3 пострадавших членов большой кровной марокканской семьи с прогрессирующей миоклонической эпилепсией -3 была выявлена гомозиготная нонсенс-мутация в гене KCTD7 (R99X).
У 2 мексиканских братьев и сестер с младенческим началом прогрессирующей миоклонической эпилепсии и патологическими проявлениями нейронального цероидного липофусциноза в нескольких типах клеток была выявлена гомозиготная мутация в гене KCTD7 (R184C). Мутация была идентифицирована путем секвенирования всего экзома и подтверждена секвенированием по Сэнгеру . Этот фенотип был идентифицирован как CLN14. Мутации KCTD7 не были обнаружены в 32 дополнительных образцах CLN.
Рекомендации
дальнейшее чтение
- Wineinger NE, Patki A, Meyers KJ, Broeckel U, Gu CC, Rao DC, Devereux RB, Arnett DK, Tiwari HK (2011). «Полногеномный совместный анализ SNP и CNV диаметра корня аорты у афроамериканцев: исследование HyperGEN» . BMC Medical Genomics . 4 : 4. DOI : 10,1186 / 1755-8794-4-4 . PMC 3027088 . PMID 21223598 .
- Krabichler B, Rostasy K, Baumann M, Karall D, Scholl-Bürgi S, Schwarzer C, Gautsch K, Spreiz A, Kotzot D, Zschocke J, Fauth C, Haberlandt E (июль 2012 г.). «Новая мутация в гене KCTD7, связанном с калиевым каналом, и прогрессирующая миоклоническая эпилепсия». Анналы генетики человека . 76 (4): 326–31. DOI : 10.1111 / j.1469-1809.2012.00710.x . PMID 22606975 . S2CID 24179893 .
- Блюмкин Л., Кивив С., Лев Д., Коэн С., Шомрат Р., Лерман-Саги Т., Лешинский-Сильвер Е. (декабрь 2012 г.). «Сложная гетерозиготная миссенс-мутация и большая делеция в гене KCTD7, проявляющаяся как синдром, подобный атаксии opsoclonus-myoclonus». Журнал неврологии . 259 (12): 2590–8. DOI : 10.1007 / s00415-012-6545-z . PMID 22638565 . S2CID 20358443 .
- Choy KW, Wang CC, Ogura A, Lau TK, Rogers MS, Ikeo K, Gojobori T, Lam DS, Pang CP (март 2006 г.). «Геномная аннотация 15 809 EST, идентифицированных из объединенных человеческих глаз на ранней стадии беременности». Физиологическая геномика . 25 (1): 9–15. DOI : 10.1152 / physiolgenomics.00121.2005 . PMID 16368877 .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в свободном доступе .