Родопсиноподобные рецепторы - Rhodopsin-like receptors
Родопсиноподобные рецепторы | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Структура родопсина: рецептор, связанный с белком AG.
| |||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||
Условное обозначение | 7тм_1 | ||||||||||
Pfam | PF00001 | ||||||||||
Клан пфам | GPCR_A | ||||||||||
ИнтерПро | IPR000276 | ||||||||||
PROSITE | PDOC00211 | ||||||||||
SCOP2 | 1f88 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
OPM суперсемейство | 6 | ||||||||||
Белок OPM | 1гм | ||||||||||
CDD | cd00637 | ||||||||||
|
Родопсин-подобные рецепторы представляют собой семейство из белков , которые образуют самую большую группу G-белком рецепторов .
Объем
Рецепторы, сопряженные с G-белками, GPCR, составляют обширное семейство белков, выполняющих широкий спектр функций (включая различные аутокринные, паракринные и эндокринные процессы). Они демонстрируют значительное разнообразие на уровне последовательностей, на основании чего их можно разделить на отдельные группы. GPCR обычно описываются как «суперсемейства», потому что они охватывают группу семейств, для которых есть признаки эволюционного родства, но между которыми нет статистически значимого сходства в последовательности. Известные в настоящее время члены суперсемейств включают родопсин-типа (GPCRs этого семейства), то секретин, как GPCRs , на цАМФа рецепторы , с грибковыми спариванием рецепторов феромона , и метаботропным глутаматный рецептором семейство. Существует специализированная база данных для GPCR .
Функция
Сами родопсиноподобные GPCR представляют собой широко распространенное семейство белков, которое включает гормональные, нейропептидные, нейротрансмиттерные и световые рецепторы, все из которых передают внеклеточные сигналы посредством взаимодействия с белками, связывающими гуанин-нуклеотид (G). Хотя их активирующие лиганды широко различаются по структуре и характеру, аминокислотные последовательности рецепторов очень похожи и, как полагают, принимают общую структурную основу, состоящую из 7 трансмембранных (TM) спиралей.
Классы
Родопсин-подобные GPCR были разделены на следующие 19 подгрупп (A1-A19) на основе филогенетического анализа.
Подсемейство A1
-
Хемокиновый рецептор InterPro : IPR000355
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 1 ( CCR1 , CKR1)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 2 ( CCR2 , CKR2)
- Хемокинов (CC мотив) рецептора 3 ( CCR3 , CKR3)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 4 ( CCR4 , CKR4)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 5 ( CCR5 , CKR5)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 8 ( CCR8 , CKR8)
- Хемокин (мотив CC), подобный рецептору 2 ( CCRL2 , CKRX)
- хемокиновый (мотив C) рецептор 1 ( XCR1 , CXC1) InterPro : IPR005393
- хемокин (мотив C-X3-C) рецептор 1 ( CX3CR1 , C3X1) InterPro : IPR005387
- GPR137B ( GPR137B , TM7SF1)
Подсемейство A2
-
Хемокиновый рецептор InterPro : IPR000355
- Хемокин (мотив CC), подобный рецептору 1 ( CCRL1 CCRL1 , CCR11)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 6 ( CCR6 , CKR6)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 7 ( CCR7 , CKR7)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 9 ( CCR9 , CKR9)
- Хемокиновый (мотив СС) рецептор 10 ( CCR10 , CKRA)
-
Хемокиновые рецепторы CXC InterPro : IPR001053
- Хемокиновый (мотив CXC) рецептор 3 ( CXCR3 )
- Хемокиновый (мотив CXC) рецептор 4 ( CXCR4 , Fusin)
- Хемокиновый (мотив CXC) рецептор 5 ( CXCR5 )
- Хемокиновый (мотив CXC) рецептор 6 ( CXCR6 , BONZO)
- Хемокин (мотив CXC) рецептор 7 ( CXCR7 , RDC1) InterPro : IPR001416
- Интерлейкин-8 InterPro : IPR000174 (IL8R)
- Рецептор адреномедуллина ( GPR182 )
- Группа крови Даффи, хемокиновый рецептор ( DARC , DUFF)
- G-белок-связанный рецептор 30 ( GPER , CML2, рецептор эстрогена GPCR)
Подсемейство A3
-
Рецептор ангиотензина II InterPro : IPR000248
- Рецептор ангиотензина II, тип 1 ( AGTR1 , AG2S)
- Рецептор ангиотензина II, тип 2 ( AGTR2 , AG22)
- Рецептор апелина ( AGTRL1 , APJ) InterPro : IPR003904
-
Рецептор брадикинина InterPro : IPR000496
- Рецептор брадикинина B1 ( BDKRB1 , BRB1)
- Рецептор брадикинина B2 ( BDKRB2 , BRB2)
- GPR15 ( GPR15 , GPRF)
- GPR25 ( GPR25 )
Подсемейство A4
-
Опиоидный рецептор InterPro : IPR001418
- дельта-опиоидный рецептор ( OPRD1 , OPRD)
- каппа-опиоидный рецептор ( OPRK1 , OPRK)
- мю Опиоидный рецептор ( OPRM1 , OPRM )
- Рецептор ноцицептина ( OPRL1 , OPRX)
-
Рецептор соматостатина InterPro : IPR000586
- Рецептор соматостатина 1 ( SSTR1 , SSR1 )
- Рецептор соматостатина 2 ( SSTR2 , SSR2)
- Рецептор соматостатина 3 ( SSTR3 , SSR3)
- Рецептор соматостатина 4 ( SSTR4 , SSR4)
- Рецептор соматостатина 5 ( SSTR5 , SSR5)
-
GPCR нейропептидный рецептор InterPro : IPR009150
- Нейропептиды Ч / Б рецептора 1 ( NPBWR1 , GPR7)
- Нейропептиды Ч / Б рецептора 2 ( NPBWR2 , GPR8)
- Сиротский рецептор GPR1 ( GPR1 ) InterPro : IPR002275
Подсемейство A5
- Рецептор галанина InterPro : IPR000405
- Цистеиниловый рецептор лейкотриена InterPro : IPR004071
-
Рецептор лейкотриена B4 InterPro : IPR003981
- Рецептор лейкотриена B4 ( LTB4R , P2Y7)
- Рецептор 2 лейкотриена B4 ( LTB4R2 )
-
Рецептор релаксина InterPro : IPR008112
- Релаксин / рецептор пептида семейства инсулиноподобного семейства 1 ( RXFP1 , LGR7)
- Релаксин / инсулиноподобный пептидный рецептор 2 семейства ( RXFP2 , GPR106)
- Релаксин / рецептор пептида семейства инсулиноподобного семейства 3 ( RXFP3 , SALPR)
- Релаксин / рецептор пептида семейства инсулиноподобного семейства 4 ( RXFP4 , GPR100 / GPR142)
- Пептидный рецептор на основе KiSS1 (GPR54) ( KISS1R ) InterPro : IPR008103
- Рецептор меланин -концентрирующего гормона 1 ( MCHR1 , GPRO) InterPro : IPR008361
- Рецептор уротензина-II ( UTS2R , UR2R) InterPro : IPR000670
Подсемейство A6
-
Рецептор холецистокинина InterPro : IPR009126
- Рецептор холецистокинина А ( CCKAR , CCKR)
- Рецептор холецистокинина B ( CCKBR , GASR)
-
Нейропептидный рецептор FF InterPro : IPR005395
- Нейропептидный рецептор FF 1 ( NPFFR1 , FF1R)
- Нейропептидный рецептор FF 2 ( NPFFR2 , FF2R)
-
Рецептор орексина InterPro : IPR000204
- Гипокретин (орексин) рецептор 1 ( HCRTR1 , OX1R)
- Гипокретиновый (орексин) рецептор 2 ( HCRTR2 , OX2R)
-
Рецептор вазопрессина InterPro : IPR001817
- Аргинин вазопрессин рецептор 1А ( AVPR1A , V1AR)
- Рецептор аргининового вазопрессина 1B ( AVPR1B , V1BR)
- Рецептор 2 аргинина вазопрессина ( AVPR2 , V2R)
- Рецептор окситоцина ( OXTR )
- Рецептор гонадотропин-рилизинг-гормона ( GNRHR , GRHR) InterPro : IPR001658
- Пироглутамилированный рецептор пептида RF-амида ( QRFPR , GPR103)
- GPR22 ( GPR22 , GPRM )
- GPR176 ( GPR176 , GPR)
Подсемейство A7
- Рецептор бомбезина InterPro : IPR001556
-
Рецептор эндотелина InterPro : IPR000499
- Рецептор эндотелина типа A ( EDNRA , ET1R)
- Рецептор эндотелина типа B ( EDNRB , ETBR)
- GPR37 ( GPR37 , ETBR-LP2) InterPro : IPR003909
- Рецептор нейромедина U InterPro : IPR005390
-
Рецептор нейротензина InterPro : IPR003984
- Рецептор нейротензина 1 ( NTSR1 , NTR1)
- Рецептор нейротензина 2 ( NTSR2 , NTR2)
- Рецептор тиротропин-рилизинг-гормона ( TRHR , TRFR) InterPro : IPR009144
- Рецептор стимулятора секреции гормона роста ( GHSR ) InterPro : IPR003905
- GPR39 ( GPR39 )
- Рецептор мотилина ( MLNR , GPR38)
Подсемейство A8
-
Рецепторы анафилатоксина InterPro : IPR002234
- Рецептор C3a ( C3AR1 , C3AR)
- Рецептор C5a ( C5AR1 , C5AR)
- Хемокиноподобный рецептор 1 ( CMKLR1 , CML1) InterPro : IPR002258
-
Формилпептидный рецептор InterPro : IPR000826
- Формилпептидный рецептор 1 ( FPR1 , FMLR)
- Формилпептидный рецептор-подобный 1 ( FPRL1 , FML2)
- Формилпептидный рецептор-подобный 2 ( FPRL2 , FML1)
- Онкоген MAS1 InterPro : IPR000820
- GPR1 ( GPR1 )
- GPR32 ( GPR32 , GPRW)
- GPR44 ( GPR44 )
- GPR77 ( GPR77 , C5L2)
Подсемейство A9
-
Рецептор мелатонина InterPro : IPR000025
- Рецептор мелатонина 1A ( MTNR1A , ML1A )
- Рецептор мелатонина 1B ( MTNR1B , ML1B)
-
Рецептор нейрокинина InterPro : IPR001681
- Рецептор тахикинина 1 ( TACR1 , NK1R)
- Рецептор тахикинина 2 ( TACR2 , NK2R)
- Рецептор тахикинина 3 ( TACR3 , NK3R)
-
Рецептор нейропептида Y InterPro : IPR000611
- Рецептор Y1 нейропептида Y ( NPY1R , NY1R)
- Нейропептид Y рецептора Y2 ( NPY2R , NY2R)
- Рецептор полипептида 1 поджелудочной железы ( PPYR1 , NY4R)
- Нейропептид Y рецептора Y5 ( NPY5R , NY5R)
- Рецептор пролактин-высвобождающего пептида ( PRLHR , GPRA) InterPro : IPR001402
- Рецептор прокинетицина 1 ( PROKR1 , GPR73)
- Рецептор прокинетицина 2 ( PROKR2 , PKR2)
- GPR19 ( GPR19 , GPRJ)
- GPR50 ( GPR50 , ML1X)
- GPR75 ( GPR75 )
- GPR83 ( GPR83 , GPR72)
Подсемейство A10
- Рецептор гликопротеинового гормона InterPro : IPR002131
- Рецептор 4, связанный с G-белком, содержащий богатые лейцином повторы ( LGR4 , GPR48)
- Рецептор 5, связанный с G-белком, содержащий богатые лейцином повторы ( LGR5 , GPR49)
- Рецептор 6, связанный с G-белком, содержащий богатые лейцином повторы ( LGR6 )
Подсемейство A11
-
Связанный с GPR40 рецептор InterPro : IPR013312
- Рецептор свободных жирных кислот 1 ( FFAR1 , GPR40)
- Рецептор свободных жирных кислот 2 ( FFAR2 , GPR43)
- Рецептор свободных жирных кислот 3 ( FFAR3 , GPR41)
- GPR42 ( GPR42 , FFAR1L)
- Пуриноцептор P2 InterPro : IPR002286
- Рецептор гидроксикарбоновой кислоты 1 ( HCAR1 , GPR81)
- Рецептор гидроксикарбоновой кислоты 2, рецептор ниацина 1 ( HCAR2 , GPR109A)
- Рецептор гидроксикарбоновой кислоты 3, рецептор ниацина 2 ( HCAR3 , GPR109B, HM74)
- GPR31 ( GPR31 , GPRV)
- GPR82 ( GPR82 )
- Оксоглутарат (альфа-кетоглутарат) рецептор 1 ( OXGR1 , GPR80)
- Сукцинатный рецептор 1 ( SUCNR1 , GPR91)
Подсемейство A12
-
Пуриноцептор P2 InterPro : IPR002286
- Пуринергический рецептор P2Y 12 ( P2RY12 )
- Пуринергический рецептор P2Y 13 ( P2RY13 , GPR86) InterPro : IPR008109
- Пуринергический рецептор P2Y 14 ( P2RY14 , UDP-рецептор глюкозы, KI01) InterPro : IPR005466
- GPR34 ( GPR34 )
- GPR87 ( GPR87 )
- GPR171 ( GPR171 , H963)
- Рецептор фактора активации тромбоцитов ( PTAFR , PAFR) InterPro : IPR002282
Подсемейство A13
-
Каннабиноидный рецептор InterPro : IPR002230
- Каннабиноидный рецептор 1 (мозг) ( CNR1 , CB1R)
- Каннабиноидный рецептор 2 (макрофаг) ( CNR2 , CB2R)
- Рецептор лизофосфатидной кислоты InterPro : IPR004065
- Сфингозин-1-фосфатный рецептор InterPro : IPR004061
-
Рецептор меланокортина / АКТГ InterPro : IPR001671
- Рецептор меланокортина 1 ( MC1R , MSHR)
- Рецептор меланокортина 3 ( MC3R )
- Рецептор меланокортина 4 ( MC4R )
- Рецептор меланокортина 5 ( MC5R )
- Рецептор АКТГ ( MC2R ), ACTR)
- GPR3 ( GPR3 )
- GPR6 ( GPR6 )
- GPR12 ( GPR12 , GPRC)
Подсемейство A14
-
Рецептор эйкозаноидов InterPro : IPR008365
- Рецептор простагландина D 2 ( PTGDR , PD2R)
- Рецептор простагландина E 1 ( PTGER1 , PE21)
- Простагландина Е 2 рецептора ( PTGER2 , PE22)
- Рецептор простагландина E 3 ( PTGER3 , PE23)
- Рецептор простагландина E 4 ( PTGER4 , PE24)
- Рецептор простагландина F ( PTGFR , PF2R)
- Рецептор простагландина I 2 (простациклина) ( PTGIR , PI2R)
- Рецептор тромбоксана A 2 ( TBXA2R , TA2R)
Подсемейство A15
- Рецептор лизофосфатидной кислоты InterPro : IPR004065
-
Пуриноцептор P2 InterPro : IPR002286
- Пуринергический рецептор P2Y 10 ( P2RY10 , P2Y10)
- Рецептор, активируемый протеазой InterPro : IPR003912
- Ген 2, индуцированный вирусом Эпштейна-Барра (рецептор, связанный с лимфоцитами G-белка) ( GPR183 )
- Протон-чувствительные рецепторы G-белка
- GPR17 ( GPR17 , GPRH)
- GPR18 ( GPR18 , GPRI)
- GPR20 ( GPR20 , ГПРК)
- GPR35 ( GPR35 )
- GPR55 ( GPR55 )
- Рецептор фактора коагуляции II ( F2R , THRR)
Подсемейство A16
-
Opsins InterPro : IPR001760
- Родопсин ( RHO , OPSD)
- Опсин 1 (пигменты колбочек), чувствительный к коротким волнам (дальтонизм, тритан) ( OPN1SW , OPSB) (опсин, чувствительный к синему)
- Опсин 1 (пигменты колбочек), средне-чувствительный (дальтонизм, дейтан) ( OPN1MW , OPSG) ( опсин , чувствительный к зеленому)
- Опсин 1 (пигменты колбочек), длинноволновый (дальтонизм, протан) ( OPN1LW , OPSR) (опсин, чувствительный к красному)
- Опсин 3, Панопсин ( OPN3 )
- Опсин 4, меланопсин ( OPN4 )
- Опсин 5 ( OPN5 , GPR136)
- Рецептор, связанный с G-белком сетчатки ( RGR )
- Гомолог родопсина, производный от пигментного эпителия сетчатки ( RRH , OPSX) (опсин визуального пигментоподобного рецептора) InterPro : IPR001793
Подсемейство A17
- Рецептор 5-гидрокситриптамина (5-HT) InterPro : IPR002231
- Адренергические рецепторы InterPro : IPR002233
- Дофаминовые рецепторы InterPro : IPR000929
- Рецептор следовых аминов InterPro : IPR009132
- Рецептор гистамина H 2 ( HRH2 , HH2R) InterPro : IPR000503
Подсемейство A18
- Гистаминовый рецептор H 1 ( HRH1 , HH1R) InterPro : IPR000921
- Рецептор гистамина H 3 ( HRH3 ) InterPro : IPR003980
- Рецептор гистамина H 4 ( HRH4 ) InterPro : IPR008102
- Аденозиновый рецептор InterPro : IPR001634
- Мускариновый ацетилхолиновый рецептор InterPro : IPR000995
- GPR21 ( GPR21 , GPRL)
- GPR27 ( GPR27 )
- GPR45 ( GPR45 , PSP24)
- GPR52 ( GPR52 )
- GPR61 ( GPR61 )
- GPR62 ( GPR62 )
- GPR63 ( GPR63 )
- GPR78 ( GPR78 )
- GPR84 ( GPR84 )
- GPR85 ( GPR85 )
- GPR88 ( GPR88 )
- GPR101 ( GPR101 )
- GPR161 ( GPR161 , RE2)
- GPR173 ( GPR173 , SREB3)
Подсемейство A19
Неклассифицированный
- Обонятельный рецептор InterPro : IPR000725
- Хеморецептор нематод (несколько, включая InterPro : IPR000344 InterPro : IPR019424 )
- Вкусовой рецептор типа 2 InterPro : IPR007960
- Вомероназальный рецептор типа 1 InterPro : IPR004072
Рекомендации
внешние ссылки
- Vriend G, Horn F, Oliveira L, Bywater RP, Cohen FE. «GPCRDB (база данных рецепторов, связанных с G-белками): данные, полученные из последовательностей» . Архивировано из оригинала на 2007-11-14 . Проверено 10 декабря 2007 .
- Хорн Ф., Беттлер Э., Оливейра Л., Кампань Ф., Коэн Ф. Е., Вринд Г. (2003). «Информационная система GPCRDB для рецепторов, связанных с G-белком» . Nucleic Acids Res . 31 (1): 294–7. DOI : 10.1093 / NAR / gkg103 . PMC 165550 . PMID 12520006 . Эта база данных включает несколько выравниваний последовательностей всех семейств и подсемейств GPCR.