Парагруппа - Paragroup

Парагруппа - это термин, используемый в популяционной генетике для описания родословных внутри гаплогруппы , которые не определяются какими-либо дополнительными уникальными маркерами .

В гаплогруппах ДНК Y-хромосомы человека парагруппы обычно представлены звездочкой ( * ), помещенной после основной гаплогруппы.

Термин «парагруппа» является портманто условий парафилетической гаплогруппы , указывающими , что paragroups образуют парафилетические субклады. Помимо мутаций, которые определяют родительскую гаплогруппу, парагруппы могут не иметь каких-либо дополнительных уникальных маркеров. В качестве альтернативы парагруппы могут обладать уникальными маркерами, которые не были обнаружены. Если уникальный маркер обнаружен в парагруппе, конкретная линия получает уникальное имя и перемещается из парагруппы, чтобы сформировать независимый подклад.

Например, парагруппой гаплогруппы DE Y-ДНК человека является DE *. Член DE * имеет маркер , который определяет DE, но не маркеры , которые определяют только известные непосредственные субклады Дэ, гаплогруппы D и E . Точно так же гаплогруппа E1b1b1g (также известная как E-M293) является примером относительно нового субклада, обнаруженного в ранее обозначенной парагруппе и получившего новое имя. До открытия маркера SNP / UEP M293 в 2008 г. члены субклада были неотличимы от других компонентов парагруппы E1b1b1 * (также известной как E3b * и E-M35 *).

Другой пример - член гаплогруппы R Y-ДНК (определяемой маркером M207) может принадлежать к субгаплогруппе R1 (определяемой маркером M173) или R2 (определяемой маркером M124). Лица, не имеющие ни одной из этих мутаций, будут отнесены к гаплогруппе R *.

использованная литература

  1. ^ a b Консорциум Y-хромосомы, TYC (2002). "Система номенклатуры древа бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека" (PDF) . Геномные исследования . Лабораторный пресс Колд-Спринг-Харбор. 12 (2): 339–48. DOI : 10.1101 / gr.217602 . PMC  155271 . PMID  11827954 .
  2. ^ Уил, Майкл Э .; и другие. (2003). «Редкие глубоко укоренившиеся линии Y-хромосомы у людей: уроки филогеографии» . Генетика . 165 (1): 229–34. DOI : 10.1093 / генетика / 165.1.229 . PMC  1462739 . PMID  14504230 .
  3. ^ Хенн, BM; и другие. (2008). «Y-хромосомное свидетельство миграции скотоводов через Танзанию в южную Африку» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . PNAS. 105 (31): 10693–8. Bibcode : 2008PNAS..10510693H . DOI : 10.1073 / pnas.0801184105 . PMC  2504844 . PMID  18678889 .


Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

  Митохондриальная Ева ( L )    
L0 L1–6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
M N  
CZ D E грамм Q   О А S р   я W Икс Y
C Z B F R0   pre-JT   п   U
HV JT K
ЧАС V J Т


Филогенетическое дерево гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека
« Y-хромосомный Адам »
A00 A0-T 
A0 A1 
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3  GHIJK
грамм HIJK
IJK ЧАС
IJ K
я   J     LT        K2 
L     Т    K2a         K2b      K2c     K2d K2e   
K-M2313      K2b1  п 
НЕТ   S   M     P1     P2
N О Q р