Гаплогруппа E (мтДНК) - Haplogroup E (mtDNA)
Гаплогруппа E | |
---|---|
Возможное время происхождения | От 35 000 до 8 000 YBP |
Возможное место происхождения | восточный Сундаленд или побережье Фуцзянь |
Предок | M9 |
Потомки | E1, E2 |
Определение мутаций | 3027, 3705, 7598, 13626, 16390 |
В митохондриальной генетике человека , гаплогруппа Е является человеческой митохондриальной ДНК (мтДНК) Гаплогруппы характерно для Малайского архипелага . Это подгруппа гаплогруппы M9 .
Источник
Были сделаны два противоположных предложения относительно местоположения и времени происхождения гаплогруппы E. Согласно одной из точек зрения, клада образовалась более 30 000 лет назад, примерно во время последнего ледникового максимума , на северо-восточном побережье Сундаленда (недалеко от современного Борнео). ). В этой модели гаплогруппа была рассеяна повышением уровня моря во время позднего ледникового периода.
В 2014 году было обнаружено, что митохондриальная ДНК 8000-летнего скелета, обнаруженного на острове Лян , одном из островов Мацу у юго-восточного побережья Китая, принадлежит к гаплогруппе E с двумя из четырех мутаций, характерных для подгруппы E1. Исходя из этого, Ко и его коллеги утверждают, что гаплогруппа E возникла от 8000 до 11000 лет назад у северного побережья Фуцзянь , отправилась на Тайвань с неолитическими поселенцами 6000 лет назад, а оттуда распространилась в Приморскую Юго-Восточную Азию с распространением австронезийского языка . Соарес и др. Предостерегают от чрезмерного акцента на одном образце и утверждают, что постоянные молекулярные часы предполагают более раннюю дату (и более южное происхождение), что остается более вероятным.
Распределение
Гаплогруппа E встречается по всей Приморской Юго-Восточной Азии . Он почти отсутствует на материковой части Восточной Азии, где распространена его сестринская группа M9a (также найденная в Японии). В частности, он встречается среди носителей австронезийских языков и редко встречается даже в Юго-Восточной Азии среди членов других языковых семей. Он был обнаружен в популяциях Тайване , на Филиппинах , Индонезии , Малайзии ( в том числе Сабах на острове Борнео , но не орангасли полуостровной Малайзии), прибрежные Папуа - Новой Гвинеи , и особенно в чаморро из Марианских островов .
Из четырех основных субкладов E1b и E2a находятся в основном в Приморской Юго-Восточной Азии, в то время как только E1a и E2b также находятся на Тайване. E2b имеет низкое разнообразие на Тайване, что позволяет предположить, что он прибыл туда около 5000 лет назад. Наиболее распространенный субклад E, E1a1a, наиболее разнообразен на Тайване, за ним следуют Филиппины и Сулавеси. Более того, другие ответвления E1a1 в основном приурочены к Тайваню.
численность населения | Частота | Считать | Источник | Подтипы |
---|---|---|---|---|
Чаморро (85 Гуам , 14 Сайпан и 6 Рота ) | 0,924 | 105 | Вилар и др., 2013 г. | E2a = 68, E1a2 = 29 |
Восточно-индонезийский ( Сулавеси , включая 89 Манадо , 64 Тораджа , 46 Уджунг Паданг и 38 Палу ) | 0,266 | 237 | Хилл и др., 2007 г. | E1a = 42, E1b = 9, E2 = 7, E1 (xE1a, E1b) = 5 |
Филиппинский ( Минданао ) | 0,214 | 70 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 10, E2 (xE2b) = 4, E1b = 1 |
Филиппинский ( Висайские острова ) | 0,214 | 112 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 18, E2 (xE2b) = 5, E1 (xE1a1a, E1a2, E1b) = 1 |
Восточно-индонезийский ( Амбон ) | 0,163 | 43 год | Хилл и др., 2007 г. | E1 (xE1a, E1b) = 3, E1a = 2, E2 = 2 |
Восточно-индонезийский ( Waingapu , Sumba ) | 0,160 | 50 | Хилл и др., 2007 г. | E1b = 6, E1a = 1, E2 = 1 |
Индонезийский ( Bangka ) | 0,147 | 34 | Хилл и др., 2006 г. | E = 5 |
Борнео (89 Банджармасин и 68 Кота-Кинабалу ) | 0,146 | 157 | Хилл и др., 2007 г. | E1a = 14, E2 = 5, E1b = 3, E1 (xE1a, E1b) = 1 |
Филиппинский | 0,125 | 64 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 5, E2 (xE2b) = 2, E1a2 = 1 |
Филиппинский ( Лусон ) | 0,124 | 177 | Таббада и др., 2010 г. , стр. 24 | E1a1a = 14, E1b = 5, E2 (xE2b) = 2, E2b = 1 |
Тайвань (абориген) | 0,120 | 640 | Пэн и др., 2011 г. | E = 77 |
Восточно-индонезийский ( Алор ) | 0,111 | 45 | Хилл и др., 2007 г. | E1a = 3, E1b = 2 |
Восточно-индонезийский ( Матарам , Ломбок ) | 0,091 | 44 год | Хилл и др., 2007 г. | E1b = 3, E1a = 1 |
Индонезийский ( Паданг , Суматра ) | 0,083 | 24 | Хилл и др., 2006 г. | E = 2 |
Индонезийский ( Медан , Суматра ) | 0,071 | 42 | Хилл и др., 2006 г. | E = 3 |
Индонезийский ( Пеканбару , Медан , Бангка , Палембанг и Паданг ) | 0,067 | 180 | Хилл и др., 2007 г. | E1a = 6, E1b = 4, E1 (xE1a, E1b) = 1, E2 = 1 |
Индонезийский ( Бали ) | 0,061 | 82 | Хилл и др., 2007 г. | E1a = 3, E1b = 1, E1 (xE1a, E1b) = 1 |
Филиппинский ( Палаван ) | 0,050 | 20 | Скоулз и др., 2011 г. | E1a = 1 |
Индонезийский ( Палембанг , Суматра ) | 0,036 | 28 год | Хилл и др., 2006 г. | E = 1 |
Туцзя ( округ Яньхэ , Гуйчжоу ) | 0,034 | 29 | Ли и др., 2007 г. | E = 1 |
Гелао (округ Даочжэнь, Гуйчжоу) | 0,032 | 31 год | Ли и др., 2007 г. | E = 1 |
Индонезийский ( Ява , в т.ч. 36 из Тенгерского языка ) | 0,022 | 46 | Хилл и др., 2007 г. | E1b = 1 |
Индонезийский ( Пеканбару , Суматра ) | 0,019 | 52 | Хилл и др., 2006 г. | E = 1 |
Чам ( Bình Thuận , Вьетнам ) | 0,012 | 168 | Peng et al 2010 | E1a1a = 1, E2a = 1 |
Каролинский ( Сайпан ) | 0,000 | 17 | Вилар и др., 2013 г. | - |
И ( уезд Хэчжан , Гуйчжоу ) | 0,000 | 20 | Ли и др., 2007 г. | - |
Дун ( уезд Тяньчжу, Гуйчжоу ) | 0,000 | 28 год | Ли и др., 2007 г. | - |
Батек ( Малайзия ) | 0,000 | 29 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Цунь ( Хайнань ) | 0,000 | 30 | Пэн и др., 2011 г. | - |
Батак ( Палаван ) | 0,000 | 31 год | Скоулз и др., 2011 г. | - |
Лингао ( Хайнань ) | 0,000 | 31 год | Пэн и др., 2011 г. | - |
Мендрик ( Малайзия ) | 0,000 | 32 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Темуан ( Малайзия ) | 0,000 | 33 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Данга ( Хайнань ) | 0,000 | 40 | Пэн и др., 2011 г. | - |
Джахаи ( Малайзия ) | 0,000 | 51 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Сеной ( Малайзия ) | 0,000 | 52 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Семелаи ( Малайзия ) | 0,000 | 61 | Хилл и др., 2006 г. | - |
Гелао (округ Даочжэнь, Гуйчжоу) | 0,000 | 102 | Лю и др. 2011 г. | - |
Ли ( Хайнань ) | 0,000 | 346 | Пэн и др., 2011 г. | - |
Субклады
Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы E основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека и последующие опубликованные исследования.
- E
- E1
- E1a
- E1a1
- E1a1a
- E1a1a1
- E1a1a
- E1a2
- E1a1
- E1b
- E1b1
- E1a
- E2
- E2a
- E2b
- E2b1
- E2b2
- E1
Смотрите также
- Генеалогический ДНК-тест
- Генетическая генеалогия
- Митохондриальная генетика человека
- Популяционная генетика
- Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека
Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная Ева ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | грамм | Q | О | А | S | р | я | W | Икс | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pre-JT | п | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ЧАС | V | J | Т |
использованная литература
- Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Михан, Уильям; Блэкберн, Джеймс; Кларк, Дуглас; Раджа, Джозеф Марипа; Исмаил, Патима; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2006). «Филогеография и этногенез аборигенов Юго-Восточной Азии» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (12): 2480–2491. DOI : 10.1093 / molbev / msl124 . PMID 16982817 .
- Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Кларк, Дуги; Блюмбах, Петя Б .; Визуете-Форстер, Матье; Форстер, Питер; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2007). «Митохондриальная стратиграфия островов Юго-Восточной Азии» . Американский журнал генетики человека . 80 (1): 29–43. DOI : 10.1086 / 510412 . PMC 1876738 . PMID 17160892 .
- Ко, Альберт Мин-Шан; Чен, Чун-Ю; Фу, Цяомэй; Дельфин, Фредерик; Ли, Минкун; Чиу, Хун-Линь; Стоункинг, Марк; Ко, Инь-Чин (2014). «Ранние австронезийцы: на Тайвань и из Тайваня» . Американский журнал генетики человека . 94 (3): 426–436. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2014.02.003 . PMC 3951936 . PMID 24607387 .
- Ли, Бинбин; Чжун, Фугуан; Йи Хуншэн; Ван, Сяньрань; Ли, Лянфан; Ван, Лилан; Ци, Сяолань; Ву, Лифу (2007). «Генетический полиморфизм митохондриальной ДНК в этнических популяциях донг, гелао, туцзя и йи из Гуйчжоу, Китай». Журнал генетики и геномики . 34 (9): 800–811. DOI : 10.1016 / S1673-8527 (07) 60091-5 . PMID 17884690 .
- Лю, Чанг; Ван, Ша-Ян; Чжао, Миан; Сюй, Чжи-Юн; Ху, Ю-Хуа; Чен, Фэн; Чжан, Жуань-Чжан; Гао, Го-Фэн; Юй Юэ-Шэн; Конг, Цин-Пэн (2011). «Полиморфизмы митохондриальной ДНК в этнической группе Гелао, проживающей в Юго-Западном Китае». Международная судебная медицина: генетика . 5 (1): PE4 – E10. DOI : 10.1016 / j.fsigen.2010.04.007 . PMID 20494640 .
- Пэн, Мин-Шэн; Куанг, Хай Хо; Данг, Кхоа Фам; Trieu, An Vu; Ван, Хуа-Вэй; Яо, Юн-Ган; Конг, Цин-Пэн; Чжан, Я-Пин (2010). «Прослеживание австронезийского следа в материковой части Юго-Восточной Азии: взгляд на митохондриальную ДНК» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (10): 2417–2430. DOI : 10.1093 / molbev / msq131 . PMID 20513740 .
- Пэн, Мин-Шэн; Он, Джун-Донг; Лю, Хай-Синь; Чжан, Я-Пин (2011). «Прослеживание наследия первых жителей острова Хайнань - взгляд на митохондриальную ДНК» . BMC Evolutionary Biology . 11 (46): 46. DOI : 10.1186 / 1471-2148-11-46 . PMC 3048540 . PMID 21324107 .
- Скоулз, Кларисса; Сиддл, Кэтрин; Дюкурно, Аксель; Кривелларо, Федерика; Ярве, Мари; Рутси, Сиири; Беллатти, Мэгги; Таббада, Кристина; Мормина, Мару; Рейдла, Маэре; Виллемс, Ричард; Кивисилд, Тоомас; Лар, Марта Миразон; Мильяно, Андреа Бамберг (2011). «Генетическое разнообразие и данные о примеси популяции в Batak Negritos из Палавана». Американский журнал физической антропологии . 146 (1): 62–72. DOI : 10.1002 / ajpa.21544 . PMID 21796613 .
- Соарес, Педро; Трежо, Жан Ален; Лоо, Цзюнь-Хун; Хилл, Кэтрин; Мормина, Мару; Ли, Цзянь-Лян; Чен, Яо-Мин; Худжашов, Георгий; Форстер, Питер; Маколей, Винсент; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2008). «Изменение климата и расселение людей после ледникового периода в Юго-Восточной Азии» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (6): 1209–1218. DOI : 10.1093 / molbev / msn068 . PMID 18359946 .
- Соарес, Педро А .; Trejaut, Жан А .; Рито, Тереза; Кавадас, Бруно; Хилл, Кэтрин; Энг, Кен Хонг; Мормина, Мару; Брандао, Андрей; Фрейзер, Росс М .; Ван, Цзе-И; Лоо, Цзюнь-Хун; Снелл, Кристофер; Ко, Цанг-Мин; Аморим Антониу; Пала, Мария; Маколей, Винсент; Бульбек, Дэвид; Уилсон, Джеймс Ф .; Гужман, Леонор; Перейра, Луиза; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2016). «Разрешение происхождения населения, говорящего на австронезийском языке» . Генетика человека . 135 (3): 309–326. DOI : 10.1007 / s00439-015-1620-z . PMC 4757630 . PMID 26781090 .
- Таббада, Кристина А .; Trejaut, Жан; Лоо, Цзюнь-Хун; Чен, Яо-Мин; Лин, Мари; Миразон-Лар, Марта; Кивисилд, Тоомас; Де Унгриа, Мария Коразон А. (2010). "Разнообразие митохондриальной ДНК Филиппин: густонаселенный виадук между Тайванем и Индонезией?" . Молекулярная биология и эволюция . 27 (1): 21–31. DOI : 10.1093 / molbev / msp215 . PMID 19755666 .
- Trejaut, Жан А .; Кивисилд, Тоомас; Лу, Джун Хун; Ли, Чиен Лян; Он, Чун Линь; Сюй, Чиа Юнг; Ли, Чжэн Юань; Лин, Мари (2005). «Следы архаичных митохондриальных линий сохраняются в австронезийско-говорящих формозских популяциях» . PLOS Биология . 3 (8). e247. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0030247 . PMC 1166350 . PMID 15984912 .
- ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2008). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386 – E394. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
- Vilar, Miguel G .; Chan, Chim W .; Сантос, Дана Р .; Линч, Дэниел; Спатис, Рита; Гарруто, Ральф М .; Лам, Дж. Коджи (2013). «Происхождение и генетическая особенность чаморро Марианских островов: перспектива мтДНК» . Американский журнал биологии человека . 25 (1): 116–122. DOI : 10.1002 / ajhb.22349 . PMC 4335639 . PMID 23180676 .
внешние ссылки
- Общий
- Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
- Филотрия Манниса ван Овена
- Гаплогруппа E
- Баллинджер, ЮАР; Schurr, TG; Torroni, A .; Ган, ГГ; Hodge, JA; Hassan, K .; Чен, KH; Уоллес, округ Колумбия (1992). «Анализ митохондриальной ДНК Юго-Восточной Азии показывает генетическую преемственность древних монголоидных миграций» . Генетика . 130 (1): 139–152. DOI : 10.1093 / генетика / 130.1.139 . PMC 1204787 . PMID 1346259 .
- Herrnstadt, C .; Элсон, JL; Fahy, E .; и другие. (2002). "Анализ сокращенной медианной сети полных последовательностей кодирующей области митохондриальной ДНК для основных африканских, азиатских и европейских гаплогрупп" . Американский журнал генетики человека . 70 (5): 1152–1171. DOI : 10.1086 / 339933 . PMC 447592 . PMID 11938495 .
- Ингман, М .; Kaessmann, H .; Pääbo, S .; Гилленстен, У. (2000). «Вариации митохондриального генома и происхождение современного человека». Природа . 408 (6813): 708–713. Bibcode : 2000Natur.408..708I . DOI : 10.1038 / 35047064 . PMID 11130070 . S2CID 52850476 .
- Stoneking, M .; Jorde, LB; Bhatia, K .; Уилсон, AC (1990). «Географические изменения митохондриальной ДНК человека из Папуа-Новой Гвинеи» . Генетика . 124 (3): 717–733. DOI : 10.1093 / генетика / 124.3.717 . PMC 1203963 . PMID 1968873 .